ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Culex pipiens pipiens mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015079	TTAA	3	238	250	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32242242
2	NC_015079	TAA	4	440	451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242242
3	NC_015079	AATT	3	488	498	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242242
4	NC_015079	T	13	651	663	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	32242242
5	NC_015079	TAT	4	666	676	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242242
6	NC_015079	ATT	5	1020	1034	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32242242
7	NC_015079	TAT	4	1066	1076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242242
8	NC_015079	TTAA	3	1241	1253	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_015079	TTAA	3	1308	1318	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015079	ACT	4	1767	1777	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32242242
11	NC_015079	GGA	4	2109	2119	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	32242242
12	NC_015079	TTTTAA	3	3137	3154	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	32242242
13	NC_015079	TTTAAC	4	4340	4363	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	32242242
14	NC_015079	ATTAC	3	4933	4946	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	32242242
15	NC_015079	TTTA	3	5212	5222	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32242242
16	NC_015079	TATTTT	3	5859	5877	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	32242242
17	NC_015079	TTTA	3	6247	6257	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015079	ATTTAA	3	6321	6338	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	32242242
19	NC_015079	ATT	4	6401	6411	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242242
20	NC_015079	TA	6	6502	6513	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32242242
21	NC_015079	AAAT	3	6626	6637	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32242242
22	NC_015079	A	22	6908	6929	22	100 %	0 %	0 %	0 %	9 %	32242242
23	NC_015079	TAA	4	7316	7327	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242242
24	NC_015079	ATT	4	7515	7526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242242
25	NC_015079	TAT	4	7760	7772	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242242
26	NC_015079	AAAT	3	8003	8014	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32242242
27	NC_015079	TAA	4	8197	8211	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32242242
28	NC_015079	TAA	5	9187	9201	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32242242
29	NC_015079	AAGA	3	9843	9853	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015079	TTTA	3	10094	10105	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	32242243
31	NC_015079	ATTA	4	10343	10358	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32242243
32	NC_015079	ATT	4	10781	10791	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242243
33	NC_015079	ATTT	3	11122	11132	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32242243
34	NC_015079	ATTT	3	11164	11175	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32242243
35	NC_015079	AATAA	3	11682	11696	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	32242243
36	NC_015079	TAAA	3	12108	12119	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32242243
37	NC_015079	TAA	4	12546	12557	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242243
38	NC_015079	ATA	4	12572	12582	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242243
39	NC_015079	TCAT	3	12957	12968	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015079	ATT	4	13415	13426	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015079	ATTT	3	13786	13796	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_015079	ATT	4	13945	13956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_015079	TAAA	10	13956	13993	38	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015079	TAA	4	14567	14579	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_015079	AATA	4	14757	14773	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_015079	ATA	5	14824	14838	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Culex pipiens pipiens mitochondrion