ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhizanthella gardneri plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014874	TTA	4	2110	2120	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31713411
2	NC_014874	GCT	4	2670	2681	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31713411
3	NC_014874	TTC	4	2952	2962	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	31713411
4	NC_014874	ATT	4	4070	4081	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31713411
5	NC_014874	TAG	4	4266	4276	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31713411
6	NC_014874	ATA	5	9840	9853	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31713411
7	NC_014874	ATA	4	10524	10536	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31713411
8	NC_014874	TAA	5	10559	10573	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31713411
9	NC_014874	CTT	4	12771	12781	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	31713411
10	NC_014874	TAA	4	14199	14210	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31713411
11	NC_014874	TAT	4	14215	14226	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31713411
12	NC_014874	TAT	7	16147	16167	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	31713411
13	NC_014874	AAT	4	16471	16481	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31713411
14	NC_014874	CTT	4	16792	16803	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31713411
15	NC_014874	AGT	4	17116	17127	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	31713411
16	NC_014874	AAT	4	17751	17761	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31713411
17	NC_014874	ATT	4	18159	18170	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31713411
18	NC_014874	TTC	4	19636	19647	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31713411
19	NC_014874	ATA	5	20203	20216	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31713411
20	NC_014874	ATA	4	20219	20230	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31713411
21	NC_014874	TTA	4	20277	20289	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31713411
22	NC_014874	ATA	4	22388	22399	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31713411
23	NC_014874	CAA	4	23811	23822	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	31713411
24	NC_014874	GTT	4	24853	24863	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	31713411
25	NC_014874	CAT	4	25139	25149	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31713411
26	NC_014874	CTT	4	32042	32053	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31713411
27	NC_014874	TGA	4	32524	32535	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	31713411
28	NC_014874	TAT	4	33912	33923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31713411
29	NC_014874	AAT	4	35608	35618	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31713411
30	NC_014874	ATA	4	37710	37720	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31713411
31	NC_014874	GAT	4	38289	38299	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31713411
32	NC_014874	TAA	4	38479	38490	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31713411
33	NC_014874	TCT	4	39149	39160	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31713411
34	NC_014874	TTC	4	40548	40560	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	31713411
35	NC_014874	ATA	4	41720	41730	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31713411
36	NC_014874	CAC	4	44833	44844	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	31713411
37	NC_014874	TTA	5	49932	49945	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31713411
38	NC_014874	AAT	4	51627	51638	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31713411
39	NC_014874	TCA	4	53016	53027	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31713411
40	NC_014874	CAT	4	53708	53718	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31713411

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhizanthella gardneri plastid