ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Meretrix lusoria mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014809	AGAA	3	33	44	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31527094
2	NC_014809	CTATT	3	974	987	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	31527094
3	NC_014809	TGG	4	1131	1142	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	31527094
4	NC_014809	ATTTT	3	1547	1562	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	31527094
5	NC_014809	TTTGT	3	2073	2086	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	31527093
6	NC_014809	TTGG	3	2195	2206	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	31527093
7	NC_014809	TTGG	3	2565	2576	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	31527093
8	NC_014809	TGTT	3	2726	2737	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	31527093
9	NC_014809	AG	6	3085	3096	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	31527093
10	NC_014809	TTG	4	3323	3334	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	31527093
11	NC_014809	TTTA	3	3705	3715	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31527093
12	NC_014809	ATGT	3	3993	4004	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014809	T	24	4034	4057	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31527093
14	NC_014809	TTG	5	4739	4753	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	31527093
15	NC_014809	GGTTT	3	5658	5672	15	0 %	60 %	40 %	0 %	6 %	31527093
16	NC_014809	TTGG	3	6297	6308	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	31527094
17	NC_014809	TAT	4	6654	6665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31527094
18	NC_014809	TATGAA	3	7168	7185	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	31527094
19	NC_014809	TAAA	3	7267	7278	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_014809	TTGT	3	7398	7409	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014809	TTTGT	3	8179	8193	15	0 %	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014809	GTT	4	8201	8211	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014809	CTTT	3	8667	8678	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	31527094
24	NC_014809	TTGAG	3	8809	8823	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	31527094
25	NC_014809	ATT	4	8884	8898	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31527094
26	NC_014809	TTTG	3	9238	9248	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31527094
27	NC_014809	T	14	10109	10122	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31527094
28	NC_014809	TGT	4	10155	10165	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_014809	TTTA	3	11297	11308	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31527093
30	NC_014809	T	17	11739	11755	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	31527094
31	NC_014809	TTG	4	13897	13909	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	31527094
32	NC_014809	TTA	4	14381	14391	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_014809	GAAA	3	15245	15255	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_014809	A	16	15359	15374	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014809	AGGG	3	15708	15719	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_014809	GTT	4	17646	17658	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_014809	GTTT	3	17917	17928	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_014809	TTAAA	3	18133	18146	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_014809	TTTC	3	19082	19093	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014809	GCT	4	19260	19271	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31527093
41	NC_014809	TTTG	3	19341	19351	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31527093
42	NC_014809	TTA	4	19363	19374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31527093
43	NC_014809	GTTT	3	19962	19973	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	31527093
44	NC_014809	TGTT	3	20219	20230	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Meretrix lusoria mitochondrion