ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Corynocarpus laevigata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014807	ATTCAA	3	202	220	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
2	NC_014807	CAG	4	1071	1082	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31704615
3	NC_014807	AAGT	3	1177	1187	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31704615
4	NC_014807	A	17	1778	1794	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014807	TA	7	1808	1821	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_014807	A	20	3778	3797	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_014807	A	13	3952	3964	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_014807	CATT	3	4190	4201	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_014807	A	14	4724	4737	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_014807	CTT	4	4738	4749	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014807	TTTA	3	5003	5014	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014807	T	13	5041	5053	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_014807	ATT	4	5111	5123	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_014807	TAA	4	5204	5215	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_014807	A	17	5211	5227	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_014807	TCAA	3	5365	5376	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014807	CTTCTA	3	5568	5585	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
18	NC_014807	TTA	4	5743	5755	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31704615
19	NC_014807	TCTCT	3	5906	5919	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	31704615
20	NC_014807	TTTTC	3	6124	6139	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	31704615
21	NC_014807	ATTC	3	6290	6300	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31704615
22	NC_014807	ATTTGA	3	6526	6544	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	31704615
23	NC_014807	TA	6	6770	6780	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31704615
24	NC_014807	AAAT	3	7578	7589	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_014807	AT	6	7965	7975	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_014807	AACTC	3	8407	8420	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
27	NC_014807	TTCT	3	8606	8616	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31704615
28	NC_014807	ATT	4	8810	8820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_014807	ATAA	3	9172	9182	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31704615
30	NC_014807	TA	7	9252	9265	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_014807	TA	6	9490	9501	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_014807	AAGATA	3	9518	9536	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
33	NC_014807	TAAT	3	9610	9622	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_014807	AT	10	9633	9651	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_014807	TAA	4	9652	9664	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_014807	TAT	4	9907	9918	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_014807	TCT	5	9916	9931	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
38	NC_014807	TTA	4	10091	10103	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_014807	AAT	4	11061	11072	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014807	TATAA	3	11092	11105	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_014807	AT	8	11307	11322	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_014807	TAT	7	11409	11428	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_014807	TAT	4	11460	11472	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_014807	T	19	11567	11585	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_014807	A	15	11596	11610	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_014807	TA	7	11611	11623	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_014807	AATT	6	11761	11784	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_014807	AATT	3	11792	11802	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_014807	AAATAA	3	11892	11909	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_014807	A	13	13492	13504	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_014807	TTTC	3	14212	14222	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31704615
52	NC_014807	TATAAT	5	14337	14367	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31704615
53	NC_014807	A	15	14429	14443	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31704615
54	NC_014807	T	13	15011	15023	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014807	A	12	15316	15327	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_014807	AAAT	3	15610	15621	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_014807	T	12	15780	15791	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_014807	TAT	6	16220	16237	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_014807	TGAAA	4	16253	16272	20	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_014807	T	15	16494	16508	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014807	TTAT	4	16553	16568	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_014807	A	13	17605	17617	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014807	T	17	18367	18383	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_014807	A	17	18384	18400	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_014807	TTA	6	18527	18545	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_014807	TAT	4	18550	18561	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_014807	CAAAT	3	18562	18576	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014807	GAATA	3	20047	20060	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	31704616
69	NC_014807	T	15	20639	20653	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	31704616
70	NC_014807	TGAA	3	21043	21053	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31704616
71	NC_014807	AT	6	21976	21986	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31704616
72	NC_014807	TTTA	4	24711	24725	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	31704616
73	NC_014807	GAAT	3	24816	24826	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31704616
74	NC_014807	AAAG	3	25039	25050	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	31704616
75	NC_014807	GTT	4	25678	25689	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	31704616
76	NC_014807	T	12	28299	28310	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31704616
77	NC_014807	GAAA	3	29399	29409	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_014807	AAGA	3	30164	30175	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_014807	A	13	30197	30209	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014807	TAT	4	30676	30689	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_014807	TTA	4	30942	30953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_014807	T	15	31401	31415	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_014807	GTAAGA	3	31520	31537	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014807	AT	6	31638	31648	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_014807	TA	6	31650	31661	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_014807	TTC	4	31894	31904	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_014807	T	14	32060	32073	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_014807	CTTTA	4	32303	32321	19	20 %	60 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
89	NC_014807	T	13	32322	32334	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_014807	T	13	32337	32349	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_014807	CAAA	4	32455	32470	16	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
92	NC_014807	AT	12	32486	32508	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_014807	CTTT	3	32738	32749	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_014807	A	14	32916	32929	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_014807	A	12	33020	33031	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_014807	TTTC	3	33464	33475	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
97	NC_014807	ATTAT	4	33590	33608	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
98	NC_014807	TA	7	33606	33618	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_014807	TTCA	4	33863	33878	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
100	NC_014807	AT	7	33909	33922	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_014807	GGCTTT	3	34447	34463	17	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
102	NC_014807	TTA	4	34629	34640	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_014807	ATTT	3	34693	34704	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_014807	TTTTA	3	34933	34947	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_014807	TTA	4	35301	35312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_014807	GAA	4	35455	35466	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_014807	GAAA	3	37427	37438	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31704616
108	NC_014807	GGA	4	37629	37640	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31704616
109	NC_014807	GCTT	3	37830	37840	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	31704616
110	NC_014807	AG	6	38645	38655	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_014807	TA	8	38858	38873	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_014807	TC	6	39228	39238	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31704617
113	NC_014807	A	15	39345	39359	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014807	AT	6	39517	39527	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_014807	TATACA	3	39729	39745	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
116	NC_014807	AAAG	3	39957	39967	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_014807	CCAAT	3	40762	40775	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	31704617
118	NC_014807	ATG	4	42062	42072	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31704617
119	NC_014807	AATG	3	43555	43566	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	31704617
120	NC_014807	GCA	4	43960	43971	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31704617
121	NC_014807	TG	6	43997	44007	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	31704617
122	NC_014807	TAT	4	45548	45559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_014807	T	23	46783	46805	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31704617
124	NC_014807	A	17	47763	47779	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31704617
125	NC_014807	CTAAA	4	49689	49709	21	60 %	20 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
126	NC_014807	ATT	4	50362	50373	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_014807	ATA	7	50845	50865	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_014807	AATT	3	50869	50881	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_014807	AATA	3	50946	50957	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_014807	CATA	3	51005	51015	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
131	NC_014807	A	13	51062	51074	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_014807	TA	11	51728	51749	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_014807	T	12	52122	52133	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_014807	AT	6	52147	52157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_014807	TATAGA	3	52533	52549	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
136	NC_014807	TA	6	52633	52644	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_014807	TATT	3	52854	52865	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014807	T	18	53078	53095	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
139	NC_014807	AAT	4	53102	53113	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_014807	ATTTT	3	53750	53765	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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164	NC_014807	ATTT	3	70038	70048	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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270	NC_014807	A	16	144693	144708	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31704619
271	NC_014807	A	23	146348	146370	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
272	NC_014807	AT	7	149157	149169	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
273	NC_014807	AATC	3	150216	150226	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	31704623
274	NC_014807	ATCA	3	152403	152415	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	31704623
275	NC_014807	ACC	4	152607	152617	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	31704623
276	NC_014807	ATC	4	154092	154103	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31704623
277	NC_014807	AAAG	3	154248	154258	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	31704623
278	NC_014807	TATT	3	155319	155330	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31704623
279	NC_014807	ATC	4	157168	157178	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
280	NC_014807	ATC	4	158557	158567	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31704623
281	NC_014807	GAA	5	159023	159037	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	31704623
282	NC_014807	A	17	159125	159141	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Corynocarpus laevigata chloroplast