ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Corynocarpus laevigata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014807	CAG	4	1071	1082	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31704615
2	NC_014807	CTT	4	4738	4749	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014807	ATT	4	5111	5123	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_014807	TAA	4	5204	5215	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_014807	TTA	4	5743	5755	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31704615
6	NC_014807	ATT	4	8810	8820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_014807	TAA	4	9652	9664	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_014807	TAT	4	9907	9918	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_014807	TCT	5	9916	9931	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
10	NC_014807	TTA	4	10091	10103	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_014807	AAT	4	11061	11072	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014807	TAT	7	11409	11428	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
13	NC_014807	TAT	4	11460	11472	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_014807	TAT	6	16220	16237	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_014807	TTA	6	18527	18545	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_014807	TAT	4	18550	18561	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_014807	GTT	4	25678	25689	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	31704616
18	NC_014807	TAT	4	30676	30689	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_014807	TTA	4	30942	30953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_014807	TTC	4	31894	31904	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_014807	TTA	4	34629	34640	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_014807	TTA	4	35301	35312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_014807	GAA	4	35455	35466	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_014807	GGA	4	37629	37640	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31704616
25	NC_014807	ATG	4	42062	42072	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31704617
26	NC_014807	GCA	4	43960	43971	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31704617
27	NC_014807	TAT	4	45548	45559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_014807	ATT	4	50362	50373	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_014807	ATA	7	50845	50865	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_014807	AAT	4	53102	53113	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_014807	AAG	4	55461	55471	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_014807	TTG	4	59447	59457	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_014807	ATA	5	63455	63468	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_014807	GTA	4	69130	69140	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_014807	ATA	4	71126	71137	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_014807	TTA	4	72925	72935	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_014807	TCT	4	78385	78396	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31704623
38	NC_014807	AGA	4	81419	81429	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	31704623
39	NC_014807	TAT	4	86512	86524	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31704623
40	NC_014807	CTT	4	89030	89041	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31704623
41	NC_014807	GAT	4	89498	89508	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31704623
42	NC_014807	GAT	4	90887	90897	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31704623
43	NC_014807	GAT	4	93962	93973	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	31704623
44	NC_014807	ATT	4	115307	115319	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31704619
45	NC_014807	AAG	4	115961	115972	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	31704619
46	NC_014807	TAT	4	117559	117570	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31704619
47	NC_014807	TTA	4	118610	118620	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31704619
48	NC_014807	TTC	5	125052	125066	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	31704619
49	NC_014807	TAA	5	125433	125447	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31704619
50	NC_014807	TAA	4	130367	130378	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31704619
51	NC_014807	TCC	5	132140	132154	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	31704619
52	NC_014807	ACC	4	152607	152617	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	31704623
53	NC_014807	ATC	4	154092	154103	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31704623
54	NC_014807	ATC	4	157168	157178	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_014807	ATC	4	158557	158567	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31704623
56	NC_014807	GAA	5	159023	159037	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	31704623

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Corynocarpus laevigata chloroplast