ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Grapholita molesta mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014806	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014806	TAAT	3	227	237	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_014806	TTTTAA	4	692	715	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31527092
4	NC_014806	ATT	4	921	933	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31527092
5	NC_014806	TTAA	3	1139	1150	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31527092
6	NC_014806	TTAAAA	3	1163	1180	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	31527092
7	NC_014806	TTTAA	3	1264	1278	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_014806	TAT	4	1951	1962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31527091
9	NC_014806	AGG	4	2119	2130	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31527091
10	NC_014806	TTTG	3	2303	2313	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31527091
11	NC_014806	ATT	4	2854	2866	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31527091
12	NC_014806	ATT	4	2891	2901	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31527091
13	NC_014806	AAAT	3	3431	3443	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31527092
14	NC_014806	TTCT	3	3911	3921	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31527092
15	NC_014806	ATT	4	3958	3968	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31527092
16	NC_014806	TTAA	4	4704	4719	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31527092
17	NC_014806	CAT	4	4728	4739	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31527092
18	NC_014806	T	13	4995	5007	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31527092
19	NC_014806	TATTTA	3	5509	5527	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_014806	ATA	4	5582	5593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31527092
21	NC_014806	ATT	5	5600	5614	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31527092
22	NC_014806	ATTT	3	5829	5840	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31527092
23	NC_014806	AATTT	4	5981	6000	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
24	NC_014806	ATT	4	6199	6211	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_014806	TAAA	7	6337	6364	28	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31527092
26	NC_014806	TAAA	3	6387	6398	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	31527092
27	NC_014806	TAT	4	6694	6705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31527092
28	NC_014806	TTAA	3	6843	6854	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31527092
29	NC_014806	TTA	4	7212	7223	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31527092
30	NC_014806	ATA	5	7317	7331	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31527092
31	NC_014806	TAA	4	7755	7767	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31527092
32	NC_014806	ATT	4	7973	7983	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31527092
33	NC_014806	TAAA	3	8961	8971	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31527092
34	NC_014806	AAAT	3	9045	9055	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31527092
35	NC_014806	AAAAT	3	9134	9147	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	31527092
36	NC_014806	TATAA	3	9174	9187	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	31527092
37	NC_014806	AATA	3	9190	9201	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31527092
38	NC_014806	AT	7	9617	9631	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31527092
39	NC_014806	ATT	5	9907	9921	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_014806	AAT	4	9957	9968	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31527092
41	NC_014806	TTTA	3	10122	10133	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	31527092
42	NC_014806	TAATTA	3	10211	10228	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	31527092
43	NC_014806	TTTA	3	10302	10312	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31527092
44	NC_014806	TAA	7	10364	10384	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	31527092
45	NC_014806	ATT	4	10852	10862	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31527093
46	NC_014806	TTA	4	11538	11548	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31527093
47	NC_014806	AAAT	3	11856	11868	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31527093
48	NC_014806	TTAA	3	12149	12160	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31527093
49	NC_014806	ATA	4	12166	12180	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31527093
50	NC_014806	A	16	12320	12335	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31527093
51	NC_014806	TTA	4	12730	12740	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_014806	TCAT	3	13036	13047	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
53	NC_014806	TA	17	13058	13089	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_014806	AAAATT	3	13560	13576	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_014806	TTAA	3	13854	13865	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014806	AATT	3	14008	14019	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_014806	ATT	4	14067	14078	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_014806	AATTT	3	14743	14757	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014806	ATT	4	14856	14868	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_014806	T	19	14972	14990	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_014806	TAA	5	15003	15018	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_014806	TAA	7	15030	15050	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
63	NC_014806	TAT	7	15084	15107	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_014806	TAT	4	15115	15129	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_014806	TAA	8	15135	15158	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
66	NC_014806	TAA	7	15164	15185	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_014806	TAA	8	15187	15210	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_014806	TAA	8	15216	15240	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_014806	TAA	7	15242	15262	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_014806	TTAA	3	15267	15277	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_014806	TA	6	15388	15399	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_014806	TA	8	15449	15464	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_014806	ATA	4	15517	15528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_014806	TTATA	9	15556	15596	41	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_014806	ATTA	11	15606	15645	40	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Grapholita molesta mitochondrion