ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Plocamiocolax pulvinata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014773	TAT	4	4468	4479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31376854
2	NC_014773	AGG	4	4556	4567	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31376854
3	NC_014773	TTTA	4	4914	4929	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	31376854
4	NC_014773	ATT	4	5851	5862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31376854
5	NC_014773	TTAT	3	5863	5875	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	31376854
6	NC_014773	AAAATT	3	6026	6044	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	31376854
7	NC_014773	CTT	4	6344	6355	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31376854
8	NC_014773	AATT	3	6464	6475	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31376854
9	NC_014773	ATT	4	6851	6862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_014773	TAA	5	6937	6951	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_014773	TAT	4	7118	7128	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31376854
12	NC_014773	TTATA	3	7246	7259	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	31376854
13	NC_014773	TAT	6	7400	7416	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	31376854
14	NC_014773	TA	6	7927	7938	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31376854
15	NC_014773	TA	6	8162	8173	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31376854
16	NC_014773	ATT	4	8963	8973	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31376854
17	NC_014773	TTTG	3	9584	9595	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	31376854
18	NC_014773	TAAA	3	9882	9893	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	31376854
19	NC_014773	A	15	10018	10032	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31376854
20	NC_014773	TATAG	3	10034	10047	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	31376854
21	NC_014773	AAATA	3	10332	10347	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	31376854
22	NC_014773	AT	7	11500	11514	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31376855
23	NC_014773	ATA	5	11591	11604	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31376855
24	NC_014773	CCAT	3	11881	11892	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
25	NC_014773	T	14	12214	12227	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_014773	TTCTTT	3	12396	12413	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	31376855
27	NC_014773	ATT	4	12710	12721	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31376855
28	NC_014773	TTAA	3	12928	12940	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31376855
29	NC_014773	TTTA	3	13248	13259	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31376855
30	NC_014773	TTCTGC	3	13602	13619	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	31376855
31	NC_014773	ATT	4	14194	14205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31376855
32	NC_014773	AAT	4	14554	14565	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31376855
33	NC_014773	ATA	5	14646	14660	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31376855
34	NC_014773	TAA	4	14763	14774	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31376855
35	NC_014773	TAAACA	3	14925	14942	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	31376855
36	NC_014773	TAA	4	15186	15197	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31376855
37	NC_014773	AAT	4	15370	15381	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31376855
38	NC_014773	AT	6	15525	15536	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31376855
39	NC_014773	ATA	4	15661	15673	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31376855
40	NC_014773	TAA	4	15787	15798	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31376855
41	NC_014773	TA	6	15928	15939	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31376855
42	NC_014773	AATT	3	16261	16271	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31376855
43	NC_014773	TAAA	3	16888	16898	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31376855
44	NC_014773	ATA	4	17046	17056	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31376855
45	NC_014773	AAAT	3	17194	17205	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31376855
46	NC_014773	ATAA	3	17361	17371	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31376855
47	NC_014773	ATA	4	18066	18077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31376855
48	NC_014773	TAA	4	18088	18098	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31376855
49	NC_014773	AAAT	3	18340	18351	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31376855
50	NC_014773	AAT	4	18352	18362	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31376855
51	NC_014773	ATTT	3	20030	20040	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31376856
52	NC_014773	TAT	4	20089	20101	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31376856
53	NC_014773	TTAA	3	20154	20164	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31376856
54	NC_014773	AATT	3	20248	20259	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	31376856
55	NC_014773	AAAT	5	20324	20342	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	31376856
56	NC_014773	TAA	4	20498	20508	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31376856
57	NC_014773	AATA	3	21430	21441	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31376856
58	NC_014773	GA	6	21901	21912	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_014773	TAAA	3	22080	22090	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_014773	TC	6	22196	22207	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
61	NC_014773	TA	6	22688	22698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31376856
62	NC_014773	TTTA	3	22880	22891	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	31376856
63	NC_014773	ATTT	3	22954	22965	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	31376856
64	NC_014773	TAT	4	22995	23006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31376856
65	NC_014773	ATT	4	23160	23170	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31376856
66	NC_014773	AAAT	3	23559	23569	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31376856
67	NC_014773	ATA	5	24177	24192	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_014773	TA	8	24184	24198	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_014773	TTG	4	24383	24394	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Plocamiocolax pulvinata mitochondrion