ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phraortes sp. Iriomote Island mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014705	TAAT	3	196	206	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223349
2	NC_014705	TATAAT	3	227	244	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	31223349
3	NC_014705	AAT	4	336	347	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223349
4	NC_014705	ATA	4	423	434	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223349
5	NC_014705	ATA	4	444	456	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223349
6	NC_014705	TAA	4	475	486	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223349
7	NC_014705	AAT	4	1004	1015	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223349
8	NC_014705	AATA	3	1103	1113	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31223349
9	NC_014705	TTA	4	1692	1703	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223349
10	NC_014705	TAT	7	1939	1959	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223349
11	NC_014705	AAT	4	2753	2764	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223349
12	NC_014705	TAT	4	3078	3090	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31223349
13	NC_014705	ATA	4	3089	3100	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223349
14	NC_014705	AAT	4	3622	3632	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223349
15	NC_014705	TTAATA	3	3713	3731	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_014705	TAT	5	3812	3826	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31223349
17	NC_014705	AAT	4	4030	4042	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223349
18	NC_014705	AAT	5	4486	4500	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223349
19	NC_014705	ATA	4	5057	5067	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223349
20	NC_014705	GTAT	3	5248	5258	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	31223349
21	NC_014705	ATA	9	5459	5485	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223350
22	NC_014705	TAA	6	5496	5514	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	31223350
23	NC_014705	AAT	4	5686	5697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223350
24	NC_014705	TTAA	3	5923	5933	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_014705	ATTTAT	3	6049	6066	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_014705	AAAAT	5	6211	6235	25	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	31223350
27	NC_014705	TAAA	3	7145	7156	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223350
28	NC_014705	TA	6	7388	7399	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223350
29	NC_014705	TAAA	3	7808	7820	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31223350
30	NC_014705	ATAA	6	7860	7883	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223350
31	NC_014705	AAAT	3	7999	8010	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223350
32	NC_014705	ATAAAA	3	8148	8165	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	31223350
33	NC_014705	ATAAA	3	8356	8369	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	31223350
34	NC_014705	ATA	4	8590	8601	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223350
35	NC_014705	AACA	3	8708	8718	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	31223350
36	NC_014705	AAAT	3	8926	8936	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31223350
37	NC_014705	AAAT	3	9037	9048	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	31223350
38	NC_014705	AAAT	3	9442	9453	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223350
39	NC_014705	TAT	4	9694	9704	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_014705	AAT	4	9977	9988	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223350
41	NC_014705	ATA	4	10011	10021	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223350
42	NC_014705	TCA	4	10071	10082	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31223350
43	NC_014705	AATT	3	10232	10243	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223350
44	NC_014705	TAA	4	10551	10562	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223350
45	NC_014705	ATA	4	10892	10903	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223350
46	NC_014705	CCAA	3	11138	11149	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	31223350
47	NC_014705	AAT	4	11161	11173	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223350
48	NC_014705	ATA	4	11301	11311	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223350
49	NC_014705	ATA	4	11398	11410	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223350
50	NC_014705	TAAAA	4	11653	11671	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	31223350
51	NC_014705	AAAAT	3	11793	11807	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	31223350
52	NC_014705	TAA	4	12356	12366	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_014705	ATA	4	12714	12724	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_014705	A	14	12772	12785	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_014705	TAA	4	12876	12886	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_014705	AAAAT	3	13101	13114	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_014705	ATAAC	3	13400	13414	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
58	NC_014705	AATA	4	13485	13501	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_014705	A	16	13617	13632	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_014705	ATA	5	13668	13682	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_014705	ATAA	4	13980	13995	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_014705	TAAA	3	14011	14021	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_014705	A	15	14223	14237	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_014705	AATT	3	14265	14275	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_014705	TAT	4	14741	14752	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_014705	ATA	4	14842	14853	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_014705	AAT	4	15045	15057	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_014705	ATT	5	15114	15128	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_014705	TA	8	15153	15167	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_014705	TATT	4	15176	15192	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_014705	TAA	4	15288	15298	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_014705	CAA	4	15480	15491	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_014705	TTAA	4	15601	15616	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_014705	TTAA	3	15650	15661	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_014705	TTAA	3	15748	15759	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_014705	TTAA	3	15845	15856	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_014705	TTAA	3	15942	15953	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_014705	TTAA	3	16039	16050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_014705	TTAA	3	16136	16147	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_014705	TTAA	3	16233	16244	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_014705	TTAA	3	16331	16342	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_014705	TTAA	3	16428	16439	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_014705	TTAA	3	16525	16536	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_014705	TTAA	3	16622	16633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_014705	TTAA	3	16719	16730	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_014705	TTAA	3	16816	16827	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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