ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ramulus irregulariterdentatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014702	TAT	4	606	617	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223345
2	NC_014702	TAT	4	663	675	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31223345
3	NC_014702	TTTAAA	3	1288	1306	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_014702	ACAGGA	3	1743	1760	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	31223345
5	NC_014702	ATT	5	3771	3784	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_014702	TA	6	3830	3841	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223345
7	NC_014702	ATT	4	4022	4034	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31223345
8	NC_014702	TAAA	3	5095	5106	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223345
9	NC_014702	AT	8	5424	5438	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_014702	AAT	4	5717	5727	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223345
11	NC_014702	TAT	4	5759	5770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223345
12	NC_014702	ATAA	4	6785	6799	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	31223345
13	NC_014702	TAAA	3	7182	7193	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223345
14	NC_014702	AATA	4	7242	7257	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	31223345
15	NC_014702	AAT	4	7371	7383	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223345
16	NC_014702	TAA	4	7625	7636	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223345
17	NC_014702	AAAT	3	7667	7677	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31223345
18	NC_014702	AAAT	3	7838	7849	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223345
19	NC_014702	A	14	7896	7909	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31223345
20	NC_014702	ATA	4	8068	8080	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223346
21	NC_014702	AT	7	8147	8159	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31223346
22	NC_014702	TAA	4	8344	8356	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223346
23	NC_014702	ATA	4	8433	8444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223346
24	NC_014702	AAAAT	3	8998	9011	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	31223346
25	NC_014702	AATAA	3	9065	9078	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	31223346
26	NC_014702	TAA	4	9122	9133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223346
27	NC_014702	AT	6	9480	9491	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223346
28	NC_014702	ATA	4	9605	9615	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223346
29	NC_014702	AAT	5	9760	9774	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223346
30	NC_014702	TA	6	9913	9923	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223346
31	NC_014702	AAT	4	10000	10011	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223346
32	NC_014702	ATA	4	10037	10049	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223346
33	NC_014702	TTA	5	10589	10602	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31223346
34	NC_014702	ATTT	3	10823	10833	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31223346
35	NC_014702	TAAT	4	11357	11372	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223346
36	NC_014702	AATAA	3	11486	11500	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	31223346
37	NC_014702	AT	6	12421	12432	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_014702	AAAT	3	12478	12489	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014702	AAT	4	12847	12858	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014702	A	15	12856	12870	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_014702	AAT	4	12893	12903	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_014702	ATA	5	13159	13174	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_014702	ATAA	3	13373	13384	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014702	AATTA	3	13424	13438	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_014702	TTAA	3	13611	13622	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014702	ATA	4	14060	14070	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_014702	TAA	4	14090	14100	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_014702	TAA	4	15026	15037	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_014702	AGTG	3	15158	15169	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_014702	TAA	4	15285	15297	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_014702	TTA	5	15318	15333	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_014702	ATG	4	15669	15680	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ramulus irregulariterdentatus mitochondrion