ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Equisetum arvense chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014699	TTCT	3	577	587	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318388
2	NC_014699	AAAG	3	1736	1747	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318388
3	NC_014699	TTAT	3	2401	2412	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	31318389
4	NC_014699	AAAG	3	2800	2810	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_014699	AAGA	3	4212	4223	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318389
6	NC_014699	AAAT	3	6241	6251	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_014699	ATTA	3	8068	8078	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_014699	TCAA	3	11773	11784	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_014699	TTAA	3	13895	13906	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
10	NC_014699	ATTT	3	15914	15924	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31318390
11	NC_014699	ATTT	3	16051	16062	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31318390
12	NC_014699	TTCT	3	16260	16270	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
13	NC_014699	TGAA	3	17658	17668	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31318390
14	NC_014699	AAAT	3	17700	17710	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31318390
15	NC_014699	CAAA	3	19400	19411	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	31318390
16	NC_014699	TTCT	3	20420	20430	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
17	NC_014699	TCAT	3	22008	22019	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	31318390
18	NC_014699	TTAT	3	28284	28295	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31318390
19	NC_014699	ATTG	3	28425	28436	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	31318390
20	NC_014699	GTTT	3	31342	31352	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
21	NC_014699	ATAA	3	35217	35228	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31318390
22	NC_014699	ATTT	3	38107	38119	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	31318390
23	NC_014699	AATT	3	41948	41958	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318390
24	NC_014699	TCTT	3	48977	48987	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
25	NC_014699	GTTT	3	49568	49578	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
26	NC_014699	GTTT	3	50065	50075	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
27	NC_014699	GTTT	3	50293	50303	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
28	NC_014699	GTTT	3	50468	50478	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
29	NC_014699	GTTT	3	51861	51872	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	31318390
30	NC_014699	GTTT	3	51966	51976	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
31	NC_014699	AAGA	3	55893	55904	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
32	NC_014699	GCAA	3	56420	56430	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	31318390
33	NC_014699	TAAA	3	59423	59434	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31318390
34	NC_014699	AGAA	3	59671	59682	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
35	NC_014699	TAAA	3	63211	63223	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31318390
36	NC_014699	TTCT	3	63496	63506	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
37	NC_014699	ATCT	3	64317	64327	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31318390
38	NC_014699	GGTA	3	66087	66097	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	31318390
39	NC_014699	AAAG	3	66582	66593	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
40	NC_014699	TTTC	3	68024	68034	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
41	NC_014699	GATA	3	69557	69568	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	31318390
42	NC_014699	AATT	3	71734	71745	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
43	NC_014699	AGAA	3	74214	74225	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
44	NC_014699	TAAA	3	75191	75203	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31318390
45	NC_014699	ACAT	3	78088	78099	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	31318390
46	NC_014699	AAGC	3	80464	80474	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	31318390
47	NC_014699	ATTT	3	85537	85547	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31318390
48	NC_014699	ATTT	3	86349	86359	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31318390
49	NC_014699	TTTA	3	88506	88517	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31318390
50	NC_014699	TTAA	3	89766	89777	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
51	NC_014699	TTTC	3	90136	90147	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	31318390
52	NC_014699	CATG	3	90743	90754	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	31318390
53	NC_014699	GAGT	3	91009	91020	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	31318390
54	NC_014699	TTTC	3	92652	92662	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
55	NC_014699	TTTA	3	93098	93109	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	31318390
56	NC_014699	GTTA	3	93525	93535	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_014699	ATTT	3	93695	93705	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_014699	CTTT	3	96659	96669	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_014699	TCTA	4	96851	96866	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
60	NC_014699	GAGG	3	99576	99587	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_014699	AGGT	3	99770	99781	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014699	CAAA	3	101572	101583	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_014699	AATT	3	103510	103521	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_014699	AAAT	3	103874	103884	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31318395
65	NC_014699	TAAA	3	104522	104532	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31318395
66	NC_014699	TATG	3	106306	106316	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	31318395
67	NC_014699	TGAA	3	107626	107637	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	31318395
68	NC_014699	GAAA	3	107903	107915	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	31318395
69	NC_014699	AAAT	3	109989	110000	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31318395
70	NC_014699	TTTA	3	111370	111380	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31318396
71	NC_014699	CCAT	3	111827	111837	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	31318396
72	NC_014699	AAAT	3	114267	114277	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31318396
73	NC_014699	AATT	3	114593	114604	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318396
74	NC_014699	CTTT	3	116832	116842	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_014699	TATT	3	118639	118650	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	31318396
76	NC_014699	TAAT	3	122258	122269	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318397
77	NC_014699	TTAT	3	122289	122299	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31318397
78	NC_014699	TCTA	3	123139	123150	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	31318397
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80	NC_014699	CTAC	3	127069	127080	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014699	AGAT	4	129987	130002	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_014699	AAAG	3	130183	130193	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_014699	CGGA	3	130346	130357	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_014699	TAAA	3	133146	133156	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Equisetum arvense chloroplast