ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Equisetum arvense chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014699	ATAAA	3	11	25	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014699	TTCT	3	577	587	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318388
3	NC_014699	AAAG	3	1736	1747	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318388
4	NC_014699	A	13	2388	2400	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_014699	TTAT	3	2401	2412	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	31318389
6	NC_014699	AAAG	3	2800	2810	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_014699	AAGA	3	4212	4223	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318389
8	NC_014699	TA	6	4252	4263	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318389
9	NC_014699	GAA	5	5655	5668	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	31318389
10	NC_014699	AAAT	3	6241	6251	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_014699	ATTA	3	8068	8078	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014699	ATA	4	8909	8919	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31318390
13	NC_014699	CAT	4	10632	10643	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31318390
14	NC_014699	TCAA	3	11773	11784	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_014699	ACCTA	3	12328	12341	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	31318390
16	NC_014699	TCCATC	3	12349	12367	19	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	10 %	31318390
17	NC_014699	TTAA	3	13895	13906	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
18	NC_014699	AGA	4	14921	14932	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	31318390
19	NC_014699	T	20	15213	15232	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014699	AT	6	15652	15663	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
21	NC_014699	ATTT	3	15914	15924	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31318390
22	NC_014699	ATTT	3	16051	16062	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31318390
23	NC_014699	ATTAGT	3	16067	16084	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	31318390
24	NC_014699	AT	7	16124	16139	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31318390
25	NC_014699	TTG	4	16184	16194	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	31318390
26	NC_014699	TTCT	3	16260	16270	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
27	NC_014699	AAATA	3	16777	16791	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	31318390
28	NC_014699	GTT	4	16929	16939	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	31318390
29	NC_014699	T	18	17116	17133	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	31318390
30	NC_014699	TGAA	3	17658	17668	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31318390
31	NC_014699	AAAT	3	17700	17710	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31318390
32	NC_014699	TA	7	17991	18004	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318390
33	NC_014699	A	13	18314	18326	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31318390
34	NC_014699	T	14	18421	18434	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31318390
35	NC_014699	CAAA	3	19400	19411	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	31318390
36	NC_014699	A	13	19575	19587	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31318390
37	NC_014699	TTCT	3	20420	20430	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
38	NC_014699	TCAT	3	22008	22019	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	31318390
39	NC_014699	CTT	4	22532	22543	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31318390
40	NC_014699	GAA	5	22984	22998	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	31318390
41	NC_014699	TCT	4	23035	23045	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	31318390
42	NC_014699	TTTTC	3	23047	23060	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	31318390
43	NC_014699	A	12	24326	24337	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	31318390
44	NC_014699	TAA	4	26523	26533	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31318390
45	NC_014699	GCT	4	27805	27816	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31318390
46	NC_014699	TTAT	3	28284	28295	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31318390
47	NC_014699	ATTG	3	28425	28436	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	31318390
48	NC_014699	GAA	4	30039	30050	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	31318390
49	NC_014699	AT	6	30540	30551	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
50	NC_014699	ATAAAA	3	30566	30584	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	31318390
51	NC_014699	T	15	30595	30609	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	31318390
52	NC_014699	AT	6	30729	30740	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
53	NC_014699	TAA	4	30993	31004	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31318390
54	NC_014699	GTTT	3	31342	31352	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
55	NC_014699	ATA	4	31485	31495	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31318390
56	NC_014699	GTT	4	32839	32849	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	31318390
57	NC_014699	TAA	4	33262	33274	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31318390
58	NC_014699	TA	11	34919	34940	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318390
59	NC_014699	ATAA	3	35217	35228	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31318390
60	NC_014699	TATTT	3	35240	35253	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	31318390
61	NC_014699	AAT	4	37954	37965	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31318390
62	NC_014699	ATTT	3	38107	38119	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	31318390
63	NC_014699	TAA	4	38518	38529	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	31318390
64	NC_014699	TAC	4	38815	38826	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31318390
65	NC_014699	ATG	4	41074	41084	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31318390
66	NC_014699	AATT	3	41948	41958	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318390
67	NC_014699	ATT	4	44104	44114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31318390
68	NC_014699	TA	7	44272	44285	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318390
69	NC_014699	GTT	4	44291	44302	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	31318390
70	NC_014699	TAGAA	3	44447	44460	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	31318390
71	NC_014699	AAG	4	44685	44695	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	31318390
72	NC_014699	TGT	4	46868	46878	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	31318390
73	NC_014699	AG	6	47583	47593	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	31318390
74	NC_014699	TAAAAA	3	47809	47826	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	31318390
75	NC_014699	TCTT	3	48977	48987	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
76	NC_014699	TCTATA	3	49488	49504	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	31318390
77	NC_014699	GTTT	3	49568	49578	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
78	NC_014699	TCTATA	3	49606	49622	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	31318390
79	NC_014699	GTTT	3	50065	50075	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
80	NC_014699	GTTT	3	50293	50303	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
81	NC_014699	TATAGA	3	50359	50376	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	31318390
82	NC_014699	GTTT	3	50468	50478	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
83	NC_014699	AT	7	50653	50666	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318390
84	NC_014699	GTTT	3	51861	51872	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	31318390
85	NC_014699	GTTT	3	51966	51976	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318390
86	NC_014699	TAA	4	54915	54927	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31318390
87	NC_014699	AGAAA	3	55137	55150	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	31318390
88	NC_014699	AAGA	3	55893	55904	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
89	NC_014699	ATT	4	55947	55957	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31318390
90	NC_014699	GCAA	3	56420	56430	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	31318390
91	NC_014699	TA	6	57160	57170	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318390
92	NC_014699	TAAA	3	59423	59434	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31318390
93	NC_014699	AGAA	3	59671	59682	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
94	NC_014699	TGT	4	60486	60497	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	31318390
95	NC_014699	GAA	4	62897	62907	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	31318390
96	NC_014699	TAAA	3	63211	63223	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31318390
97	NC_014699	TTCT	3	63496	63506	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
98	NC_014699	ATCT	3	64317	64327	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31318390
99	NC_014699	ATT	4	64686	64697	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31318390
100	NC_014699	A	20	65853	65872	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	31318390
101	NC_014699	GGTA	3	66087	66097	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	31318390
102	NC_014699	AAAG	3	66582	66593	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
103	NC_014699	A	12	66901	66912	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	31318390
104	NC_014699	AGA	4	67373	67384	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	31318390
105	NC_014699	T	12	67913	67924	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31318390
106	NC_014699	TTTC	3	68024	68034	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318390
107	NC_014699	TA	8	68152	68167	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31318390
108	NC_014699	TA	7	68171	68184	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318390
109	NC_014699	CTG	4	68317	68328	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31318390
110	NC_014699	GATA	3	69557	69568	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	31318390
111	NC_014699	AATT	3	71734	71745	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318390
112	NC_014699	T	13	72215	72227	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	31318390
113	NC_014699	GTTAA	3	72617	72631	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	31318390
114	NC_014699	G	16	72813	72828	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	31318390
115	NC_014699	AAT	4	73436	73447	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31318390
116	NC_014699	CT	6	73742	73752	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31318390
117	NC_014699	AGAA	3	74214	74225	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318390
118	NC_014699	T	12	74788	74799	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	31318390
119	NC_014699	TCTTTT	3	74961	74978	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	31318390
120	NC_014699	TAAA	3	75191	75203	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31318390
121	NC_014699	ATA	4	77176	77186	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31318390
122	NC_014699	T	14	77273	77286	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31318390
123	NC_014699	TA	7	77366	77381	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31318390
124	NC_014699	T	15	77398	77412	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	31318390
125	NC_014699	TTTTCT	3	77751	77769	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	31318390
126	NC_014699	ACAT	3	78088	78099	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	31318390
127	NC_014699	TAATT	3	78143	78157	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	31318390
128	NC_014699	TA	6	78372	78382	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318390
129	NC_014699	ATA	5	79318	79332	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31318390
130	NC_014699	AT	7	79452	79464	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318390
131	NC_014699	T	12	79541	79552	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31318390
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216	NC_014699	TA	10	133077	133098	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
217	NC_014699	TAAA	3	133146	133156	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Equisetum arvense chloroplast