ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Prunus persica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014697	CAG	4	938	949	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31318380
2	NC_014697	AAGT	3	1044	1054	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31318380
3	NC_014697	AAT	4	1477	1489	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_014697	T	14	1591	1604	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014697	GAAT	3	1605	1616	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014697	TAAAAG	3	2047	2064	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	31318380
7	NC_014697	TCTT	3	2230	2240	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	31318380
8	NC_014697	AAAT	3	3280	3291	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31318380
9	NC_014697	T	14	4014	4027	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_014697	ATTA	3	4482	4493	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_014697	TTCA	3	4982	4993	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014697	TA	6	5038	5049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014697	TAA	4	5092	5103	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_014697	TAAAT	3	5566	5579	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	31318380
15	NC_014697	TTC	4	5600	5611	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31318380
16	NC_014697	A	14	5620	5633	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31318380
17	NC_014697	TATT	3	5708	5720	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	31318380
18	NC_014697	ATTC	3	5769	5779	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31318380
19	NC_014697	TA	6	6248	6258	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318380
20	NC_014697	A	14	6827	6840	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_014697	GATATA	3	6921	6938	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_014697	TAT	4	6979	6989	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014697	ATAA	3	7995	8005	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31318380
24	NC_014697	AAAAAT	3	8441	8457	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_014697	T	12	9637	9648	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014697	TTAAT	5	9710	9734	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_014697	TA	7	9942	9954	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_014697	TAA	4	9983	9994	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_014697	GAT	4	10167	10177	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31318380
30	NC_014697	A	12	12497	12508	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31318380
31	NC_014697	AT	6	12694	12705	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318380
32	NC_014697	TAT	5	13009	13023	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_014697	AAAG	3	13232	13243	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_014697	AAAT	3	13665	13676	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_014697	ATTA	3	13808	13820	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_014697	TCTT	3	15644	15655	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_014697	T	16	16548	16563	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_014697	A	13	16565	16577	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_014697	GAATA	3	18169	18182	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	31318381
40	NC_014697	T	13	18755	18767	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31318381
41	NC_014697	CTT	4	22870	22881	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31318381
42	NC_014697	T	23	22877	22899	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31318381
43	NC_014697	GAAT	3	22983	22993	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31318381
44	NC_014697	GTT	4	23857	23868	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	31318381
45	NC_014697	TCA	4	26210	26220	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31318381
46	NC_014697	T	12	26483	26494	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31318381
47	NC_014697	TCAT	3	27172	27182	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_014697	T	13	29253	29265	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_014697	TATGAA	3	29391	29409	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
50	NC_014697	TA	8	30150	30165	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_014697	TTTA	3	30781	30792	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014697	TA	11	31057	31078	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_014697	TAAA	3	31115	31126	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_014697	TTTA	3	31169	31180	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_014697	ATTTAA	3	32747	32764	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_014697	TA	6	32848	32858	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_014697	TA	6	33094	33104	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_014697	TCTTT	3	33320	33333	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
59	NC_014697	AATA	3	33417	33428	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_014697	TAA	4	33715	33725	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_014697	GAAA	3	35649	35660	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31318381
62	NC_014697	TTGC	3	36050	36060	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	31318381
63	NC_014697	T	22	36741	36762	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_014697	AG	6	36883	36893	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_014697	TA	8	37085	37099	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_014697	TC	6	37492	37502	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31318381
67	NC_014697	TCT	4	38509	38519	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	31318382
68	NC_014697	ATG	4	40053	40063	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	31318382
69	NC_014697	GCA	4	41951	41962	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31318382
70	NC_014697	TG	6	41988	41998	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	31318382
71	NC_014697	ATA	6	43842	43859	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_014697	T	12	44171	44182	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31318382
73	NC_014697	TTTC	3	44739	44750	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	31318382
74	NC_014697	ATA	4	45099	45113	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31318382
75	NC_014697	A	13	45714	45726	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31318382
76	NC_014697	AT	6	46293	46304	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_014697	AT	7	48038	48051	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_014697	ATATT	3	48196	48210	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_014697	AT	7	48213	48227	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_014697	A	18	48492	48509	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_014697	TA	7	48575	48589	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_014697	AT	6	48587	48597	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_014697	TA	6	48607	48618	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_014697	TA	7	49594	49606	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_014697	AT	8	50069	50083	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_014697	TA	7	50085	50097	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_014697	TA	6	50320	50331	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_014697	GTCT	3	51707	51718	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	31318382
89	NC_014697	T	13	51949	51961	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_014697	CAA	4	52423	52433	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_014697	TTCTAT	3	52509	52525	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
92	NC_014697	ATA	4	52722	52732	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_014697	ATA	4	52735	52745	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_014697	TAT	4	52747	52759	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_014697	TA	7	52806	52818	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_014697	TA	7	52840	52852	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_014697	AT	6	52871	52884	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_014697	ATA	4	52886	52898	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_014697	TTTTTA	3	52958	52975	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_014697	TTA	4	53032	53043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_014697	ATA	4	56080	56090	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31318382
102	NC_014697	TTTC	3	56388	56398	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_014697	CTTT	3	56468	56479	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_014697	TGCA	3	57700	57712	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	31318383
105	NC_014697	TA	6	58381	58392	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_014697	TAT	4	58546	58556	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_014697	T	16	58725	58740	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014697	TATT	3	58812	58823	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_014697	TATT	3	60369	60380	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_014697	C	13	60639	60651	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
111	NC_014697	TAT	4	60675	60686	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_014697	ATA	5	60765	60780	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_014697	T	13	61220	61232	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014697	TGAA	3	62176	62186	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_014697	T	14	62326	62339	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_014697	GATC	3	63418	63429	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_014697	AT	6	63696	63706	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318383
118	NC_014697	AAAT	3	64620	64631	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_014697	A	12	65165	65176	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014697	TA	8	65247	65261	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_014697	TGTT	3	66760	66770	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_014697	CTTT	3	67020	67031	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_014697	A	12	67119	67130	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014697	TA	6	67288	67299	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_014697	TTA	4	68180	68191	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_014697	AT	6	68238	68248	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_014697	AT	6	68508	68518	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_014697	A	17	69031	69047	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_014697	TTA	4	69233	69244	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_014697	T	17	69301	69317	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_014697	TA	6	69638	69648	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_014697	A	13	70035	70047	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31318384
133	NC_014697	TGAA	3	70553	70564	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_014697	TTTC	3	70587	70599	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
135	NC_014697	TTTC	3	70710	70721	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_014697	A	12	70738	70749	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014697	ATT	4	71516	71526	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31318384
138	NC_014697	AAT	4	71936	71947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31318384
139	NC_014697	TTAC	3	72026	72038	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	31318384
140	NC_014697	TAAA	3	72057	72069	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31318384
141	NC_014697	TTTA	3	72160	72171	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31318384
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154	NC_014697	T	12	85211	85222	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31318384
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207	NC_014697	AATC	3	123961	123972	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	31318388
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220	NC_014697	TTTG	3	130711	130721	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31318388
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222	NC_014697	TTC	6	132206	132224	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	31318388
223	NC_014697	TGAA	3	134007	134017	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31318388
224	NC_014697	CTTA	3	134293	134303	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31318388
225	NC_014697	GGAT	3	138889	138900	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	31318388
226	NC_014697	CTT	4	141653	141664	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31318388
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228	NC_014697	ACCGG	3	146996	147010	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
229	NC_014697	ATA	4	147238	147248	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
230	NC_014697	AT	6	147253	147263	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
231	NC_014697	AT	8	147277	147291	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
232	NC_014697	CATAC	3	148281	148294	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
233	NC_014697	ATCA	3	150827	150839	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	31318388
234	NC_014697	ACC	4	151022	151032	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	31318388
235	NC_014697	AAAG	3	152654	152664	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	31318388
236	NC_014697	TATT	3	153716	153727	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31318388
237	NC_014697	GAA	4	154015	154025	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	31318388
238	NC_014697	ATC	4	155538	155548	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
239	NC_014697	ATC	4	156922	156932	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31318388
240	NC_014697	GAA	5	157388	157402	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	31318388
241	NC_014697	TA	8	157736	157751	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Prunus persica chloroplast