ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phraortes illepidus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014695	TAAT	3	199	209	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319976
2	NC_014695	TAA	4	469	480	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319976
3	NC_014695	TAA	4	487	498	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319976
4	NC_014695	TAA	4	565	576	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319976
5	NC_014695	TAA	4	637	648	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319976
6	NC_014695	TAT	4	786	796	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31319976
7	NC_014695	TAA	5	808	822	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31319976
8	NC_014695	ATA	6	999	1016	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	31319976
9	NC_014695	TAT	4	1957	1968	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31319976
10	NC_014695	TTATA	3	2773	2786	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	31319976
11	NC_014695	TAA	4	3122	3133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319976
12	NC_014695	ATT	4	3227	3237	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31319976
13	NC_014695	TTAATA	3	3728	3746	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
14	NC_014695	AAT	4	4046	4058	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31319976
15	NC_014695	AAT	4	4081	4093	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31319976
16	NC_014695	TAACAA	3	4234	4251	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	31319976
17	NC_014695	TAT	5	4522	4536	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31319976
18	NC_014695	ATA	4	4739	4750	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319976
19	NC_014695	ATA	4	5073	5083	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31319976
20	NC_014695	TAA	4	5485	5496	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319977
21	NC_014695	TTA	4	5494	5505	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31319977
22	NC_014695	ATC	4	5600	5610	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31319977
23	NC_014695	ATA	5	5700	5714	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31319977
24	NC_014695	ATT	4	5742	5753	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31319977
25	NC_014695	ATTTAT	3	6069	6086	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_014695	CAA	4	6617	6629	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	31319977
27	NC_014695	ATA	4	6639	6651	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31319977
28	NC_014695	TTAA	3	6716	6726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319977
29	NC_014695	AGAAAA	3	6769	6787	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	31319977
30	NC_014695	AAT	4	6813	6824	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319977
31	NC_014695	ATAA	6	7883	7905	23	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31319977
32	NC_014695	AT	7	8134	8146	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31319977
33	NC_014695	AAAT	3	9028	9039	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31319977
34	NC_014695	A	14	9053	9066	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31319977
35	NC_014695	ATA	4	9073	9083	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31319977
36	NC_014695	A	18	9223	9240	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	31319977
37	NC_014695	ATA	4	9752	9764	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31319977
38	NC_014695	TAA	4	9774	9784	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31319977
39	NC_014695	TAA	7	9987	10007	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31319977
40	NC_014695	TAAA	3	10018	10029	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31319977
41	NC_014695	AAT	4	10114	10125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319977
42	NC_014695	TAA	4	10574	10585	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319977
43	NC_014695	AAT	4	10782	10793	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319977
44	NC_014695	TATAAT	3	10905	10922	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	31319977
45	NC_014695	ATAA	3	11164	11176	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31319977
46	NC_014695	CATA	3	11243	11253	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	31319977
47	NC_014695	AATA	5	11420	11439	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	31319977
48	NC_014695	A	15	11590	11604	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31319977
49	NC_014695	ATAAAC	3	11795	11812	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	31319977
50	NC_014695	A	15	12034	12048	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31319977
51	NC_014695	AACA	3	12384	12395	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_014695	TAA	4	12798	12809	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_014695	AAATA	3	13132	13145	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_014695	TAAAA	3	13165	13179	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_014695	TAAA	3	13181	13191	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_014695	ATA	4	13240	13250	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_014695	ATAA	6	13340	13361	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_014695	ATA	4	13485	13495	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_014695	AATT	3	13628	13638	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_014695	CAA	4	13959	13970	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_014695	AAAT	3	14503	14514	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_014695	A	14	14595	14608	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014695	AATA	3	14767	14779	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014695	AATA	3	14787	14798	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_014695	TAA	5	14866	14880	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_014695	AT	12	15113	15135	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_014695	TTA	4	15147	15159	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_014695	TAAA	3	15261	15271	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_014695	TTAA	3	15686	15697	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_014695	TTAA	3	15756	15767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_014695	TTAA	3	15826	15837	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_014695	TTAA	3	15896	15907	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_014695	TTAA	3	15966	15977	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_014695	TTAA	3	16036	16047	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_014695	TTAA	3	16106	16117	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_014695	TTAA	3	16176	16187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_014695	TTAA	3	16246	16257	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_014695	TTAA	3	16316	16327	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_014695	ATAA	3	16364	16376	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Phraortes illepidus mitochondrion