ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida jiufengensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014693	TA	7	129	142	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_014693	TTATA	3	293	307	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_014693	AT	6	733	743	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223337
4	NC_014693	AATA	3	1077	1088	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223337
5	NC_014693	AATT	3	1102	1112	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223337
6	NC_014693	TGC	4	1235	1246	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	31223337
7	NC_014693	TAGA	3	1910	1922	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	31223337
8	NC_014693	TAT	4	2012	2022	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223337
9	NC_014693	CCCT	3	2038	2048	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
10	NC_014693	GGAA	3	2152	2162	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_014693	ATT	4	3278	3288	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014693	TA	6	3364	3374	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_014693	AT	6	4332	4342	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_014693	TA	8	4512	4526	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_014693	AT	6	4531	4542	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_014693	AT	11	5306	5328	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_014693	TAT	4	5498	5508	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_014693	ATAA	3	5674	5685	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014693	TAT	6	5706	5722	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	31223338
20	NC_014693	TAT	4	5766	5777	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223338
21	NC_014693	TAT	4	6095	6105	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223338
22	NC_014693	TTAA	3	6148	6160	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31223338
23	NC_014693	ATT	4	7092	7102	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223338
24	NC_014693	TAA	4	7122	7133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223338
25	NC_014693	ATT	4	7344	7355	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223338
26	NC_014693	TAA	4	7410	7420	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223338
27	NC_014693	TTAT	3	7602	7613	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31223338
28	NC_014693	TAT	4	7735	7747	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_014693	TATTT	3	7842	7856	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_014693	TA	6	7860	7871	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_014693	GGGA	3	7908	7918	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_014693	AT	6	7923	7933	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_014693	TA	7	7958	7970	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_014693	AT	8	8095	8110	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_014693	TA	7	8175	8189	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_014693	TA	16	8653	8684	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_014693	C	12	9537	9548	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014693	ATA	4	9867	9878	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223338
39	NC_014693	TTA	4	10176	10187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223338
40	NC_014693	TA	8	10349	10363	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223338
41	NC_014693	ATAAAG	3	10418	10435	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	31223338
42	NC_014693	AT	6	10517	10528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223338
43	NC_014693	TTA	7	10739	10759	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223338
44	NC_014693	ATT	4	10783	10794	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223338
45	NC_014693	TTTA	3	11236	11246	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31223338
46	NC_014693	GAG	4	11896	11907	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31223338
47	NC_014693	TA	7	11976	11988	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31223338
48	NC_014693	ATA	4	12074	12086	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223338
49	NC_014693	TAT	4	12085	12095	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223338
50	NC_014693	AT	8	12161	12176	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223338
51	NC_014693	TA	8	12217	12231	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223338
52	NC_014693	ATA	5	12345	12359	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223338
53	NC_014693	TA	8	12451	12465	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223338
54	NC_014693	AT	11	12555	12575	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223338
55	NC_014693	TCC	4	13084	13095	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	31223338
56	NC_014693	AT	6	13181	13191	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223338
57	NC_014693	ATATT	3	13213	13227	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	31223338
58	NC_014693	TAA	4	13400	13412	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223338
59	NC_014693	TAT	4	13504	13515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223338
60	NC_014693	AGG	4	14117	14128	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31223338
61	NC_014693	TA	7	14216	14228	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31223338
62	NC_014693	GATA	3	14406	14417	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	31223338
63	NC_014693	C	14	14742	14755	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014693	TA	6	14861	14871	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_014693	TA	6	15020	15030	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_014693	AT	6	15112	15123	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_014693	ATAAAT	3	15326	15343	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_014693	TAT	5	15354	15368	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_014693	AAATA	3	16988	17002	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_014693	ATT	5	17388	17402	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_014693	TA	6	17811	17822	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_014693	TTTA	3	17884	17894	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_014693	AT	6	18109	18119	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_014693	AT	6	18138	18148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_014693	C	13	18450	18462	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
76	NC_014693	ATT	4	18470	18481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_014693	ATT	4	18534	18544	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_014693	ATAA	4	18638	18653	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_014693	TTA	4	18869	18879	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223338
80	NC_014693	AT	6	18931	18941	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_014693	TA	6	19056	19068	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_014693	TA	13	19076	19100	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_014693	ATTAA	3	20297	20311	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	31223338
84	NC_014693	TATT	3	21456	21468	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	31223338
85	NC_014693	TTC	4	21716	21727	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31223338
86	NC_014693	TTA	4	21823	21835	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31223338
87	NC_014693	TAT	4	21907	21919	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_014693	TA	8	21976	21990	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_014693	TA	7	22182	22195	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_014693	TTTA	3	22806	22817	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31223338
91	NC_014693	TAT	8	22917	22940	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223338
92	NC_014693	TA	8	23479	23493	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223338
93	NC_014693	CCA	4	23665	23676	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	31223338
94	NC_014693	TTTA	3	23897	23908	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31223338
95	NC_014693	AAT	4	24346	24358	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223339
96	NC_014693	TA	7	24473	24485	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_014693	TTAT	3	24491	24503	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_014693	TA	6	24504	24514	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_014693	TCCT	3	24593	24604	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_014693	CTA	4	25043	25054	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_014693	ATA	4	25118	25128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_014693	ATTT	3	25548	25559	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014693	AT	7	25894	25906	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_014693	TAG	4	25917	25927	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_014693	AT	6	26052	26064	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_014693	AT	7	26122	26135	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_014693	TA	8	26137	26151	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_014693	TTATAT	3	26788	26805	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_014693	AATA	3	26923	26934	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_014693	GATA	3	27299	27310	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_014693	AT	7	27453	27468	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_014693	TA	6	27595	27605	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_014693	AT	6	27653	27663	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_014693	AT	7	28363	28375	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_014693	AT	6	28573	28584	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223339
116	NC_014693	TAT	4	28635	28646	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223339
117	NC_014693	CCCT	3	29200	29210	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
118	NC_014693	AT	6	29286	29296	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_014693	AT	6	29299	29309	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_014693	AATA	3	29473	29484	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_014693	GATA	3	29581	29592	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

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