Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Theobroma cacao chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014676CAG4114411551233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %31319968
2NC_014676TAA5672167351566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
3NC_014676ATT4834083511233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_014676TAA4998299931266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_014676TAT810251102742433.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_014676TAA412626126381366.67 %33.33 %0 %0 %7 %31319968
7NC_014676TAT413481134921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_014676AAT413599136101266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_014676TTA417158171691233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_014676GTT42439924410120 %66.67 %33.33 %0 %8 %31319969
11NC_014676ATA433350333611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_014676ATA433365333761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_014676TTA437307373181233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_014676AAT438093381061466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
15NC_014676ATT538291383051533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_014676ATA438323383341266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_014676TAA438351383631366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_014676ATA438521385311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_014676GCA442909429191133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %31319970
20NC_014676CAA444752447631266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
21NC_014676TAG446641466511133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %31319970
22NC_014676TAA446894469051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %31319970
23NC_014676TAA450054500661366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_014676ATT550743507561433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_014676TTA453731537451533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_014676CAA454236542461166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
27NC_014676ATA458450584601166.67 %33.33 %0 %0 %9 %31319970
28NC_014676TAT459068590801333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_014676ATT561427614411533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
30NC_014676ATT563186632001533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
31NC_014676AAT563534635481566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
32NC_014676AAT468155681661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_014676TCT46984169853130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
34NC_014676TAT572626726391433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
35NC_014676ATA572720727331466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_014676TAT481883818941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %31319968
37NC_014676CTT48947789488120 %66.67 %0 %33.33 %8 %31319968
38NC_014676GAT489945899551133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %31319968
39NC_014676GAT491346913561133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %31319968
40NC_014676AGA495071950811166.67 %0 %33.33 %0 %9 %31319968
41NC_014676TTC4104349104360120 %66.67 %0 %33.33 %8 %31319972
42NC_014676AAG41162571162681266.67 %0 %33.33 %0 %8 %31319972
43NC_014676TAA41174731174831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %31319972
44NC_014676ATA41185821185941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %31319972
45NC_014676CTT4126666126677120 %66.67 %0 %33.33 %8 %31319972
46NC_014676TAA41290671290781266.67 %33.33 %0 %0 %8 %31319972
47NC_014676ATT41294491294601233.33 %66.67 %0 %0 %8 %31319972
48NC_014676GAA41341901342011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %31319972
49NC_014676TTC6134893134911190 %66.67 %0 %33.33 %10 %31319972
50NC_014676GAA41455931456041266.67 %0 %33.33 %0 %8 %31319972
51NC_014676ACC41540721540821133.33 %0 %0 %66.67 %9 %34224021
52NC_014676TTC4154871154881110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34224021
53NC_014676ATC41585971586071133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
54NC_014676ATC41599981600081133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
55NC_014676GAA51604641604781566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding