ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Theobroma cacao chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014676	AT	6	1843	1857	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014676	AT	6	8401	8412	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_014676	TA	7	8421	8434	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_014676	TA	6	8481	8492	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_014676	TA	6	10205	10216	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014676	AT	7	27805	27817	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_014676	TA	8	28271	28285	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_014676	TA	8	33124	33139	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_014676	TA	6	33533	33544	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_014676	AT	7	34251	34263	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_014676	AG	6	37380	37390	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014676	TA	6	37592	37603	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014676	AT	6	38310	38320	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_014676	TG	6	42948	42958	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	31319970
15	NC_014676	AT	9	44593	44609	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_014676	AT	6	47750	47761	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_014676	AT	9	49129	49145	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_014676	AT	8	49685	49699	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_014676	AT	6	51413	51423	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_014676	AT	7	54676	54688	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_014676	AT	6	54696	54708	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_014676	AT	7	65622	65635	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_014676	AT	6	66840	66850	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319971
24	NC_014676	TA	6	72598	72608	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_014676	AT	6	72677	72688	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014676	TC	6	87428	87439	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	31319968
27	NC_014676	AT	6	87568	87578	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319968
28	NC_014676	TA	6	99653	99663	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319968
29	NC_014676	AT	7	118644	118659	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31319972
30	NC_014676	TA	7	120706	120718	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31319972
31	NC_014676	TA	6	150290	150300	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_014676	CA	6	150690	150700	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Theobroma cacao chloroplast