ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Isoetes flaccida chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014675	T	12	207	218	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014675	AATT	3	1033	1043	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319959
3	NC_014675	ATTTT	3	1524	1539	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	31319959
4	NC_014675	GGGAA	3	2215	2229	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	31319959
5	NC_014675	GGGGA	3	2839	2852	14	20 %	0 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_014675	ATTG	3	3438	3448	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	31319960
7	NC_014675	TTAT	3	3520	3530	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_014675	AATT	3	3584	3595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014675	AT	6	4405	4416	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31319960
10	NC_014675	AAT	4	5559	5569	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_014675	TAA	11	5571	5601	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014675	T	17	5754	5770	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_014675	ATTC	3	6281	6291	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_014675	AT	6	7722	7733	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31319960
15	NC_014675	T	18	9284	9301	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	31319960
16	NC_014675	AT	6	12376	12387	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_014675	GAA	5	12534	12547	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	31319961
18	NC_014675	TACG	3	12851	12861	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	31319961
19	NC_014675	TTTA	3	14379	14390	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_014675	AT	25	14395	14442	48	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014675	TATCA	3	14906	14919	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
22	NC_014675	A	17	15263	15279	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	31319961
23	NC_014675	TTG	4	15858	15869	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	31319961
24	NC_014675	ATT	4	16570	16581	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31319961
25	NC_014675	CATT	4	18295	18309	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	31319967
26	NC_014675	TAAA	5	20054	20073	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	31319967
27	NC_014675	AAT	4	20121	20132	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319967
28	NC_014675	A	12	20291	20302	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	31319967
29	NC_014675	ATA	4	21381	21392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319967
30	NC_014675	TCA	4	24058	24068	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31319967
31	NC_014675	TAAAA	3	24152	24166	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	31319967
32	NC_014675	AATC	3	24177	24187	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	31319967
33	NC_014675	AT	43	24728	24810	83	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319967
34	NC_014675	TAAA	4	24839	24854	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	31319967
35	NC_014675	A	15	26354	26368	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31319967
36	NC_014675	GCTT	3	27825	27836	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	31319967
37	NC_014675	TA	18	28708	28742	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31319967
38	NC_014675	TAT	7	28771	28791	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	31319967
39	NC_014675	AAGA	3	28963	28974	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	31319967
40	NC_014675	CATT	3	28975	28986	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	31319967
41	NC_014675	AT	8	29161	29176	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31319967
42	NC_014675	T	12	29174	29185	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	31319967
43	NC_014675	T	14	29306	29319	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31319967
44	NC_014675	AAT	4	29550	29561	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319967
45	NC_014675	GGA	4	29855	29866	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31319967
46	NC_014675	AT	30	30471	30528	58	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31319967
47	NC_014675	TAAGA	3	30999	31013	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	31319967
48	NC_014675	T	13	31022	31034	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31319967
49	NC_014675	T	18	32802	32819	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	31319967
50	NC_014675	GA	6	32883	32893	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	31319967
51	NC_014675	A	19	33122	33140	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	31319967
52	NC_014675	AGAAT	4	33213	33232	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	31319967
53	NC_014675	TTC	4	35304	35315	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31319967
54	NC_014675	TCGAT	3	35769	35782	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	31319967
55	NC_014675	TCCA	3	35821	35832	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	31319967
56	NC_014675	T	14	36547	36560	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	31319967
57	NC_014675	TCATT	3	36968	36981	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	31319967
58	NC_014675	TAA	4	37146	37158	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31319967
59	NC_014675	AT	12	37174	37196	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31319967
60	NC_014675	GTT	4	37826	37836	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	31319967
61	NC_014675	ACGA	3	38406	38417	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	31319967
62	NC_014675	TAT	17	39670	39721	52	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31319967
63	NC_014675	TGAA	3	40175	40185	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31319967
64	NC_014675	CTT	4	40274	40285	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31319967
65	NC_014675	TCAA	3	40510	40522	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	31319967
66	NC_014675	ATT	8	41105	41128	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31319967
67	NC_014675	A	17	41311	41327	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	31319967
68	NC_014675	TATATG	3	42696	42713	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	31319967
69	NC_014675	AT	6	42733	42743	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319967
70	NC_014675	TTCT	3	42936	42948	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	31319967
71	NC_014675	A	24	43445	43468	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	31319967
72	NC_014675	A	13	44511	44523	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31319967
73	NC_014675	A	17	44558	44574	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	31319967
74	NC_014675	A	12	44624	44635	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	31319967
75	NC_014675	T	16	45196	45211	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	31319967
76	NC_014675	CTAG	3	46899	46911	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	31319967
77	NC_014675	TC	6	48549	48559	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31319967
78	NC_014675	TAA	5	49620	49634	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31319967
79	NC_014675	TAA	7	50936	50957	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31319967
80	NC_014675	AT	7	50954	50967	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31319967
81	NC_014675	CT	6	52007	52017	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31319967
82	NC_014675	AAGC	3	52754	52764	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	31319967
83	NC_014675	GGCC	3	55574	55585	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	31319967
84	NC_014675	AT	6	55640	55650	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319967
85	NC_014675	ATA	4	56193	56205	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31319967
86	NC_014675	TAA	4	56244	56255	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31319967
87	NC_014675	TTA	5	56359	56373	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31319967
88	NC_014675	AT	13	56661	56684	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31319967
89	NC_014675	AT	6	57198	57209	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31319967
90	NC_014675	GAGAT	3	57514	57529	16	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	31319967
91	NC_014675	AT	6	57552	57564	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31319967
92	NC_014675	ATAAGG	3	57697	57714	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	31319967
93	NC_014675	ACTA	3	58253	58264	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	31319967
94	NC_014675	TCCC	3	58744	58754	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	31319967
95	NC_014675	ATTC	3	61694	61706	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	31319967
96	NC_014675	CT	6	62445	62457	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	31319967
97	NC_014675	T	29	62924	62952	29	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	31319967
98	NC_014675	GGAC	3	63081	63093	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	31319967
99	NC_014675	TCAA	3	63502	63513	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	31319967
100	NC_014675	TC	6	63586	63596	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31319967
101	NC_014675	AATT	3	63776	63786	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319967
102	NC_014675	TAC	4	65944	65954	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31319967
103	NC_014675	T	17	65999	66015	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	31319967
104	NC_014675	T	13	66477	66489	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	31319967
105	NC_014675	ATGTT	3	66500	66513	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	31319967
106	NC_014675	AT	8	66676	66691	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31319967
107	NC_014675	AT	20	66694	66731	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31319967
108	NC_014675	GGGA	3	67202	67213	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	31319967
109	NC_014675	CATT	3	67426	67436	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31319967
110	NC_014675	AT	6	67779	67789	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31319967
111	NC_014675	AAAT	3	68145	68157	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31319967
112	NC_014675	ATTC	3	68654	68664	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31319967
113	NC_014675	T	12	68694	68705	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	31319967
114	NC_014675	TTA	4	69486	69498	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31319967
115	NC_014675	TTTC	3	71181	71192	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	31319967
116	NC_014675	ACAT	3	72224	72234	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	31319967
117	NC_014675	CT	6	72314	72324	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31319967
118	NC_014675	GA	7	72359	72371	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	31319967
119	NC_014675	AATA	3	72430	72442	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	31319967
120	NC_014675	TTTTA	3	73241	73255	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	31319967
121	NC_014675	AT	8	73370	73385	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31319967
122	NC_014675	CTATT	5	73561	73590	30	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	31319967
123	NC_014675	T	15	74403	74417	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	31319967
124	NC_014675	TA	8	74461	74476	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31319967
125	NC_014675	AAGAT	3	77095	77109	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	31319967
126	NC_014675	TTA	4	77242	77253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31319967
127	NC_014675	TTA	5	77263	77277	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31319967
128	NC_014675	CAAT	3	78017	78029	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	31319967
129	NC_014675	GTTT	3	78322	78333	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	31319967
130	NC_014675	TCTT	3	81370	81381	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	31319967
131	NC_014675	TTA	4	81689	81699	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31319967
132	NC_014675	GTA	4	83790	83801	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	31319967
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215	NC_014675	GGAT	3	139123	139134	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	31319967
216	NC_014675	CT	6	140280	140290	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31319967
217	NC_014675	AATA	3	141418	141429	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31319967
218	NC_014675	GC	6	141960	141970	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	31319967
219	NC_014675	ATGT	3	142028	142039	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	31319967
220	NC_014675	AGT	4	143911	143922	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	31319967
221	NC_014675	TAA	4	144645	144656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
222	NC_014675	AATTA	4	145157	145177	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Isoetes flaccida chloroplast