ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Castanea mollissima chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014674	AT	6	6756	6766	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_014674	AT	7	7395	7408	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_014674	AT	6	8112	8124	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_014674	AT	10	9878	9897	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_014674	TA	6	11339	11349	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_014674	TA	6	14889	14900	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_014674	AT	6	17436	17446	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318398
8	NC_014674	AG	6	18448	18458	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_014674	AT	7	22090	22102	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318398
10	NC_014674	GA	6	29669	29679	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_014674	AT	12	39968	39990	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014674	AG	6	40004	40014	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_014674	TA	6	40178	40189	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_014674	TA	7	40235	40248	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_014674	TC	6	40665	40675	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31318399
16	NC_014674	AT	6	40861	40873	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_014674	TA	6	41087	41097	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_014674	TG	6	45543	45553	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	31318399
19	NC_014674	AT	7	50195	50208	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_014674	TA	8	52397	52411	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_014674	AT	6	53361	53371	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_014674	AT	6	56442	56452	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014674	TA	6	64470	64481	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_014674	AT	7	64694	64709	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_014674	AT	6	64770	64781	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014674	AT	6	67655	67665	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318400
27	NC_014674	AT	9	69217	69233	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_014674	TA	7	73845	73857	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_014674	TA	6	77362	77373	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318401
30	NC_014674	AT	6	77376	77389	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318401
31	NC_014674	TA	8	83017	83033	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	31318401
32	NC_014674	TC	6	88502	88513	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	31318401
33	NC_014674	AT	6	88632	88642	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318401
34	NC_014674	TA	6	89609	89619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31318401
35	NC_014674	AG	6	113868	113878	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	31318405
36	NC_014674	AT	6	118576	118587	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318405
37	NC_014674	AT	7	121840	121852	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31318405
38	NC_014674	AT	6	123669	123680	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31318405
39	NC_014674	CT	6	137355	137366	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	31318405

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Castanea mollissima chloroplast