ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Micadina phluctainoides mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014673	ATA	4	228	239	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
2	NC_014673	TAAT	3	443	455	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31223313
3	NC_014673	AAT	4	470	481	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
4	NC_014673	TAA	4	490	501	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
5	NC_014673	AAT	5	599	612	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223313
6	NC_014673	ATA	4	759	770	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
7	NC_014673	TAA	4	1024	1035	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
8	NC_014673	TAT	4	1047	1057	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223313
9	NC_014673	TAA	4	1075	1086	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
10	NC_014673	TTTA	3	1139	1149	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31223313
11	NC_014673	TTTAAA	3	1290	1308	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
12	NC_014673	AACAGG	3	1773	1790	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	31223313
13	NC_014673	ACT	4	2035	2045	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	31223313
14	NC_014673	TTTG	3	2269	2279	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	31223313
15	NC_014673	AAT	4	2808	2819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
16	NC_014673	TAT	4	2820	2831	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223313
17	NC_014673	AAT	4	3681	3691	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223313
18	NC_014673	TAA	4	3808	3819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_014673	AAT	4	3876	3887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
20	NC_014673	TAAAA	3	3915	3928	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	31223314
21	NC_014673	AT	6	4116	4126	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223314
22	NC_014673	ATA	4	4174	4184	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223314
23	NC_014673	AAT	4	4777	4788	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
24	NC_014673	TAAA	3	5128	5139	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223314
25	NC_014673	TAA	4	5524	5535	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
26	NC_014673	ATA	4	5559	5570	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
27	NC_014673	CAT	4	5644	5655	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31223314
28	NC_014673	ATA	4	6473	6485	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223314
29	NC_014673	TGAA	3	7347	7357	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	31223314
30	NC_014673	TAA	4	7697	7708	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
31	NC_014673	TAA	5	7731	7744	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223314
32	NC_014673	A	12	7950	7961	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31223314
33	NC_014673	TAA	4	7964	7976	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223314
34	NC_014673	AAAT	3	8111	8122	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223314
35	NC_014673	AT	6	8354	8364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223314
36	NC_014673	TAA	4	8420	8432	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223314
37	NC_014673	ATA	5	8699	8712	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223314
38	NC_014673	ATA	4	8951	8961	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223314
39	NC_014673	AAAAT	4	9074	9092	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	31223314
40	NC_014673	A	12	9314	9325	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	31223314
41	NC_014673	AAATAA	3	9562	9579	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	31223314
42	NC_014673	TAA	4	9840	9854	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223314
43	NC_014673	TA	6	10024	10034	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223314
44	NC_014673	AAT	5	10075	10089	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223314
45	NC_014673	AATA	3	10166	10177	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223314
46	NC_014673	TAA	4	10676	10687	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
47	NC_014673	AAT	4	10884	10895	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
48	NC_014673	ATTT	3	10898	10908	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	31223314
49	NC_014673	TAA	4	11009	11020	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
50	NC_014673	AATA	3	11530	11541	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223314
51	NC_014673	A	13	11702	11714	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31223314
52	NC_014673	TAA	4	12434	12445	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223314
53	NC_014673	AAAT	3	12457	12468	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223314
54	NC_014673	TAA	4	12548	12559	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_014673	TTAA	3	12688	12698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_014673	CAAA	3	12826	12837	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_014673	TAAA	3	12910	12921	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_014673	AAAAT	3	12924	12939	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_014673	TA	6	13216	13227	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_014673	AAAT	4	13306	13321	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_014673	AAAAT	3	13327	13341	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_014673	ATAA	3	13454	13465	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014673	ATAAC	3	13546	13560	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
64	NC_014673	ATAA	4	13628	13643	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_014673	TAAA	3	13788	13799	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_014673	TAA	4	14166	14176	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_014673	TTAA	3	14319	14330	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_014673	AATT	3	14466	14476	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_014673	ATAA	3	14750	14760	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_014673	TTA	4	15331	15343	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_014673	TTA	4	15480	15492	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_014673	TAAAAA	3	15749	15767	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_014673	TAAA	3	15804	15814	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_014673	TAAAAA	3	16096	16114	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
75	NC_014673	TAAAAA	3	16202	16220	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
76	NC_014673	TAAAAA	3	16308	16326	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
77	NC_014673	TAAAAA	3	16414	16432	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Micadina phluctainoides mitochondrion