ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Solenopsis invicta mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014672	ATGA	3	1	12	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	31223312
2	NC_014672	AGG	4	663	674	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	31223312
3	NC_014672	ATA	4	1866	1876	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223312
4	NC_014672	AAT	5	2487	2501	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223312
5	NC_014672	CTA	4	2832	2843	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	31223312
6	NC_014672	TAT	4	3158	3168	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223312
7	NC_014672	TA	6	4088	4098	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_014672	TAATA	3	4146	4159	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	31223312
9	NC_014672	TACT	3	4599	4610	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_014672	AATT	3	4870	4882	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_014672	AT	8	5117	5131	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223312
12	NC_014672	TAAA	3	5151	5161	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31223312
13	NC_014672	AACA	3	5227	5238	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	31223312
14	NC_014672	ATT	5	5761	5775	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31223312
15	NC_014672	ATAAA	3	5867	5880	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	31223312
16	NC_014672	AAAT	3	6325	6336	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	31223312
17	NC_014672	ATA	4	6507	6518	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223312
18	NC_014672	ATAAAT	3	6573	6590	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	31223312
19	NC_014672	TAATAT	3	6697	6714	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	31223313
20	NC_014672	AT	6	7577	7587	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223313
21	NC_014672	AAAT	3	7730	7741	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223313
22	NC_014672	TAAA	3	7878	7889	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223313
23	NC_014672	TA	7	8219	8232	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31223313
24	NC_014672	ATT	4	8452	8463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_014672	ATA	4	8649	8660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
26	NC_014672	TTA	4	8767	8777	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223313
27	NC_014672	TCT	4	8970	8980	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	31223313
28	NC_014672	AT	6	9012	9022	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223313
29	NC_014672	TTA	4	9709	9720	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223313
30	NC_014672	ATT	4	9965	9975	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223313
31	NC_014672	AACT	3	10437	10448	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	31223313
32	NC_014672	AAT	4	10701	10712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
33	NC_014672	ATA	5	10831	10846	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223313
34	NC_014672	TAAA	3	10857	10867	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31223313
35	NC_014672	ACT	4	11113	11124	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31223313
36	NC_014672	TTTA	3	11528	11539	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_014672	TTTA	3	11589	11600	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_014672	CTA	4	11987	11998	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_014672	TAT	4	12143	12154	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014672	TAACT	3	12213	12226	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
41	NC_014672	ATT	4	12258	12269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_014672	ATATA	3	12270	12283	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_014672	TTTTA	3	12491	12504	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_014672	TTTAA	3	12530	12544	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014672	TTATT	3	12545	12559	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_014672	AATT	3	12654	12664	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_014672	TTAA	3	13535	13547	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_014672	TAA	4	13621	13632	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_014672	TA	6	13718	13729	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_014672	AAATT	3	13744	13757	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_014672	T	13	13851	13863	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_014672	TTTAAA	3	13877	13895	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_014672	CTAA	3	13968	13978	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_014672	TA	6	14188	14198	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_014672	TAT	4	14261	14273	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_014672	TTAA	3	14311	14323	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_014672	TAT	5	14332	14346	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31223313
58	NC_014672	TTTA	3	14511	14522	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31223313
59	NC_014672	TTTA	3	14542	14553	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31223313
60	NC_014672	ATA	4	14618	14629	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223313
61	NC_014672	TTA	4	14696	14707	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223313
62	NC_014672	AT	6	15368	15380	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Solenopsis invicta mitochondrion