ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida salmanticensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014613	TTATT	3	61	75	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014613	TTATT	3	165	179	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_014613	TTATT	3	269	283	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_014613	TTATT	3	373	387	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_014613	TTATT	3	477	491	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_014613	TTATT	3	581	595	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_014613	TTATT	3	685	699	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_014613	TTATT	3	789	803	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_014613	TTATT	3	893	907	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_014613	TTTAA	3	982	996	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_014613	TAA	4	1193	1204	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014613	TTA	4	1446	1458	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932203
13	NC_014613	TTTATA	3	1535	1553	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30932203
14	NC_014613	TTA	4	1572	1584	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932203
15	NC_014613	TAT	4	1700	1710	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932203
16	NC_014613	TAT	6	1868	1884	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30932203
17	NC_014613	TAT	5	1891	1904	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932203
18	NC_014613	TTAA	3	3004	3015	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30932203
19	NC_014613	TAT	4	3070	3080	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_014613	TAT	4	3105	3116	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014613	TAAT	3	3116	3127	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014613	TTTA	3	3211	3221	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30932203
23	NC_014613	GTT	4	3872	3883	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30932203
24	NC_014613	TA	8	3972	3986	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_014613	TA	7	3989	4001	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_014613	AAT	4	4072	4084	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_014613	TAT	4	4136	4147	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932203
28	NC_014613	TTA	4	4247	4257	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932203
29	NC_014613	AT	6	4317	4328	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30932203
30	NC_014613	ATTC	3	4396	4407	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30932203
31	NC_014613	TTTA	3	4410	4422	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	30932203
32	NC_014613	TA	8	5188	5204	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30932203
33	NC_014613	ATA	4	5214	5226	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932203
34	NC_014613	TAT	8	5290	5312	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932203
35	NC_014613	TAT	5	5394	5408	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30932203
36	NC_014613	ATTT	3	5424	5436	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	30932203
37	NC_014613	TAT	4	6104	6115	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932203
38	NC_014613	TTA	4	6119	6131	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932203
39	NC_014613	TAA	4	6310	6320	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932203
40	NC_014613	TTA	4	6390	6404	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30932203
41	NC_014613	TCT	4	6493	6503	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_014613	TA	6	6513	6524	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_014613	TAT	4	6539	6549	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_014613	TA	6	6647	6657	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_014613	TA	7	6799	6811	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30932203
46	NC_014613	TAT	5	7141	7155	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	30932204
47	NC_014613	TAATT	3	7188	7201	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	30932204
48	NC_014613	TA	6	7834	7844	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932204
49	NC_014613	ATT	4	7865	7876	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932204
50	NC_014613	CATG	3	7938	7948	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	30932204
51	NC_014613	TATT	4	7964	7978	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	30932204
52	NC_014613	TA	6	8467	8477	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932204
53	NC_014613	ATA	4	8785	8796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
54	NC_014613	ATTA	6	9573	9594	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_014613	TCT	4	9962	9973	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30932204
56	NC_014613	ATT	4	10066	10077	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932204
57	NC_014613	ACA	4	10094	10105	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30932204
58	NC_014613	TAA	4	10376	10388	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932204
59	NC_014613	ATT	4	10400	10410	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932204
60	NC_014613	TAA	4	10788	10799	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
61	NC_014613	ATA	5	10874	10888	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30932204
62	NC_014613	ATA	6	11012	11028	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30932204
63	NC_014613	TATTTA	3	11167	11184	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30932204
64	NC_014613	ATAA	3	12194	12204	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30932204
65	NC_014613	AAT	4	12277	12288	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
66	NC_014613	TA	6	12342	12352	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932204
67	NC_014613	TAT	4	12381	12391	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932204
68	NC_014613	ATA	5	12396	12409	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932204
69	NC_014613	TTA	4	12608	12619	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932204
70	NC_014613	TA	6	12675	12685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932204
71	NC_014613	TATAT	3	12754	12768	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	30932204
72	NC_014613	TAT	4	12810	12820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932204
73	NC_014613	TGAT	3	12965	12976	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	30932204
74	NC_014613	TAT	5	13332	13345	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932204
75	NC_014613	AAT	4	13346	13356	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932204
76	NC_014613	AT	8	13353	13369	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30932204
77	NC_014613	AAT	9	13367	13392	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932204
78	NC_014613	ATA	4	13416	13427	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
79	NC_014613	TATTAA	3	13431	13449	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30932204
80	NC_014613	TTA	5	13633	13646	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932204
81	NC_014613	TA	6	13656	13666	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932204
82	NC_014613	TAA	4	13672	13683	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
83	NC_014613	TAA	4	13825	13836	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
84	NC_014613	TAT	4	14148	14159	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932204
85	NC_014613	ATT	7	14248	14268	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932204
86	NC_014613	ATA	4	14333	14343	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932204
87	NC_014613	ATA	4	14354	14368	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30932204
88	NC_014613	AAAAT	3	14560	14574	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_014613	ATA	4	14656	14670	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30932204
90	NC_014613	ATA	4	14773	14786	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932204
91	NC_014613	TATAAT	4	14780	14804	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30932204
92	NC_014613	TA	6	14846	14856	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932204
93	NC_014613	TTTA	3	14982	14993	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30932204
94	NC_014613	CAAAT	3	15013	15026	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	30932204
95	NC_014613	TAAA	3	15067	15077	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30932204
96	NC_014613	AAT	4	15267	15277	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932204
97	NC_014613	TAAT	3	15284	15296	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30932204
98	NC_014613	TAA	4	15494	15504	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932204
99	NC_014613	AAAG	3	15690	15701	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_014613	AAATAA	3	15719	15736	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
101	NC_014613	TA	6	15767	15778	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_014613	TAT	5	16412	16426	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30932204
103	NC_014613	TAT	4	16514	16524	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932204
104	NC_014613	TTA	4	17004	17015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932204
105	NC_014613	AT	6	17265	17277	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30932204
106	NC_014613	TGA	4	17448	17459	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	30932204
107	NC_014613	AATA	3	17572	17582	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30932204
108	NC_014613	TAT	4	17737	17748	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932204
109	NC_014613	AT	7	17750	17762	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30932204
110	NC_014613	TA	8	17973	17989	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_014613	ATA	4	18030	18042	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_014613	TTTA	3	18093	18104	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30932204
113	NC_014613	TAA	4	18106	18117	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
114	NC_014613	TA	7	18151	18164	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30932204
115	NC_014613	ATAAAT	3	18202	18219	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_014613	ATAAAA	3	18307	18325	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
117	NC_014613	TAT	4	18451	18462	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932204
118	NC_014613	TAA	4	18460	18471	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932204
119	NC_014613	TA	6	18536	18546	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932204
120	NC_014613	AT	8	19173	19187	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_014613	ATAA	3	19219	19229	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_014613	TAA	4	19936	19946	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_014613	AT	7	20325	20338	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_014613	CTA	4	20433	20443	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
125	NC_014613	AATA	4	20519	20534	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_014613	ATA	4	20534	20545	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_014613	TTAA	3	20607	20618	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_014613	TA	7	20829	20841	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_014613	TA	6	20882	20892	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_014613	AAAT	6	21231	21252	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_014613	ATA	4	21253	21264	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_014613	ACT	4	21300	21311	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_014613	TA	8	21447	21461	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_014613	AT	6	21647	21658	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_014613	TA	6	21930	21941	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_014613	ATT	4	21994	22005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_014613	TA	9	22134	22150	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
138	NC_014613	TA	6	22495	22505	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_014613	TAAT	3	22529	22541	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_014613	TA	9	22545	22561	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
141	NC_014613	TAT	4	22618	22630	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_014613	ATT	4	22638	22649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_014613	TA	8	22664	22679	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
144	NC_014613	TAGA	3	22785	22795	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_014613	ATTAT	3	22889	22903	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
146	NC_014613	TTA	4	22961	22972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_014613	ATTA	4	22990	23004	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
148	NC_014613	ATTT	3	23474	23484	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_014613	TAT	4	23598	23609	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014613	TTAA	3	23782	23793	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_014613	AT	6	23903	23913	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_014613	AAAATA	3	24039	24056	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
153	NC_014613	AAAT	3	24425	24436	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014613	TA	6	25004	25014	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_014613	TTAA	3	25138	25149	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014613	TAA	4	25315	25327	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
157	NC_014613	TA	6	26041	26051	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
158	NC_014613	TAA	4	26248	26259	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
159	NC_014613	ATT	4	26305	26317	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
160	NC_014613	TTAAA	3	26505	26519	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida salmanticensis mitochondrion