ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida alai mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014612	ATA	4	230	241	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014612	ATA	4	400	410	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_014612	TAT	5	479	493	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_014612	ATA	4	724	736	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_014612	TAT	4	902	916	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_014612	TAA	4	935	949	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_014612	TAT	4	1540	1551	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_014612	ATA	4	1554	1566	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_014612	ATT	5	1890	1904	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_014612	AAT	4	2482	2494	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_014612	ATA	4	2553	2564	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014612	TAT	5	2772	2787	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_014612	ATA	5	3026	3041	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_014612	ATA	4	3100	3111	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014612	TTA	4	3527	3538	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_014612	TAT	5	3557	3571	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_014612	AAT	4	4005	4016	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932202
18	NC_014612	TAT	4	4334	4344	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932202
19	NC_014612	TAT	4	4912	4923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932202
20	NC_014612	AAT	4	5412	5423	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014612	TAA	12	5431	5467	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30932202
22	NC_014612	TAT	4	5710	5721	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932202
23	NC_014612	TTA	4	5737	5747	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932202
24	NC_014612	AGT	4	5931	5941	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	30932202
25	NC_014612	ATT	4	6411	6422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932202
26	NC_014612	ATA	4	6655	6667	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932202
27	NC_014612	TGC	4	6928	6939	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30939870
28	NC_014612	TAT	4	7236	7248	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30939870
29	NC_014612	TAT	4	7725	7736	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_014612	TAT	4	8500	8511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932202
31	NC_014612	TTA	4	8790	8800	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932202
32	NC_014612	TAT	5	8876	8889	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932202
33	NC_014612	TAA	4	8935	8946	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932202
34	NC_014612	ATT	4	9007	9017	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_014612	ATA	5	9340	9354	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_014612	ATA	5	10224	10238	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_014612	TTA	4	10538	10549	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_014612	AAT	4	10591	10601	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_014612	ATT	4	11651	11662	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932202
40	NC_014612	ATA	4	12346	12357	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932202
41	NC_014612	TAA	4	13135	13146	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_014612	TAT	4	13211	13222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_014612	GAT	4	13250	13261	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_014612	TAT	4	13307	13319	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_014612	TAA	4	13399	13411	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_014612	ATT	4	13715	13727	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_014612	ATT	4	13875	13888	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_014612	ATA	4	14135	14148	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_014612	TAT	4	14838	14850	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_014612	ATA	4	15216	15227	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_014612	ATA	5	15479	15492	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_014612	ATA	4	15593	15605	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_014612	TAT	4	15933	15944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_014612	ATA	7	15997	16017	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_014612	TAA	4	16359	16370	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_014612	ATA	4	16560	16571	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30939870
57	NC_014612	TTA	5	16566	16580	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30939870
58	NC_014612	GCA	5	16581	16595	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	30939870
59	NC_014612	ATA	4	18093	18105	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932202
60	NC_014612	TAA	4	18411	18423	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_014612	AGG	4	18461	18473	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_014612	TTA	5	18637	18651	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_014612	TTA	4	18951	18962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_014612	TTA	4	19249	19261	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_014612	AAT	4	19287	19299	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_014612	ATT	5	19523	19537	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_014612	TAT	4	20092	20104	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_014612	ATA	4	20631	20642	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_014612	ATA	4	20838	20849	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932202
70	NC_014612	TAA	4	20962	20973	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932202
71	NC_014612	ATA	4	20976	20987	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932202
72	NC_014612	TAT	4	21070	21081	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932202
73	NC_014612	TAT	4	21232	21244	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932202
74	NC_014612	ATA	5	21307	21321	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30932202
75	NC_014612	TAT	4	21688	21700	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30932202
76	NC_014612	ATA	7	21985	22005	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932202
77	NC_014612	TAT	4	22114	22125	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932202
78	NC_014612	ATA	5	22723	22736	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_014612	TAT	4	23152	23162	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_014612	TAT	4	23175	23186	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_014612	ATT	4	23738	23749	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932203
82	NC_014612	AAT	4	23744	23755	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932203
83	NC_014612	ATT	4	25172	25183	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_014612	AGG	4	25243	25254	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_014612	ATT	4	26056	26067	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_014612	CTT	5	26380	26394	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
87	NC_014612	AAT	4	26979	26990	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932203
88	NC_014612	TAT	4	27510	27521	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932203
89	NC_014612	ATA	4	27540	27552	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30932203
90	NC_014612	ATT	4	27645	27655	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30932203
91	NC_014612	ATT	4	27842	27853	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932203
92	NC_014612	ATA	6	28080	28096	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30932203
93	NC_014612	ATT	5	28679	28694	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30932203
94	NC_014612	TTA	4	28769	28780	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_014612	ATT	4	28876	28886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_014612	TAT	4	30107	30119	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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