ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cheilanthes lindheimeri chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014592	AT	6	1334	1345	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30874598
2	NC_014592	GAAC	3	2137	2148	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	30874598
3	NC_014592	CTTT	3	4046	4056	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30874598
4	NC_014592	GATA	3	4528	4539	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	30874598
5	NC_014592	A	12	7596	7607	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30874598
6	NC_014592	AAAT	3	7664	7674	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30874598
7	NC_014592	ATA	4	8900	8911	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	30874598
8	NC_014592	AT	6	12725	12736	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30874598
9	NC_014592	G	14	13565	13578	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	30874598
10	NC_014592	AAAT	3	13957	13968	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30874598
11	NC_014592	CATA	3	20676	20687	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	30874598
12	NC_014592	ATTG	3	20893	20903	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	30874598
13	NC_014592	TCTT	3	22140	22151	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	30874598
14	NC_014592	ATCG	3	24033	24044	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	30874598
15	NC_014592	GGGT	3	24055	24066	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	30874598
16	NC_014592	TGT	4	24968	24979	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30874598
17	NC_014592	TTGC	3	25045	25055	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	30874598
18	NC_014592	TC	6	26659	26669	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	30874598
19	NC_014592	T	15	26914	26928	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30874598
20	NC_014592	TATG	3	27009	27020	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	30874598
21	NC_014592	AT	6	27036	27047	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30874598
22	NC_014592	AAGC	3	27064	27074	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	30874598
23	NC_014592	TTAA	3	28374	28385	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30874598
24	NC_014592	ATT	4	28916	28927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874598
25	NC_014592	CT	6	31565	31575	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	30874598
26	NC_014592	AAAT	3	33732	33744	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	30874598
27	NC_014592	TTC	4	34331	34343	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	30874598
28	NC_014592	AT	6	35893	35903	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30874598
29	NC_014592	GGGA	3	35934	35944	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	30874598
30	NC_014592	TTG	4	39029	39041	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	30874598
31	NC_014592	ATG	4	40069	40079	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	30874598
32	NC_014592	G	14	41184	41197	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	30874598
33	NC_014592	A	12	41584	41595	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30874598
34	NC_014592	CAA	4	43987	43999	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	30874598
35	NC_014592	TAA	4	44158	44169	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874598
36	NC_014592	AT	6	46013	46023	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30874598
37	NC_014592	AG	6	48433	48443	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30874598
38	NC_014592	AGTTA	3	48725	48738	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	30874598
39	NC_014592	TATCTA	3	49623	49640	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	30874598
40	NC_014592	ATT	4	52081	52092	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874598
41	NC_014592	GGAC	3	52664	52675	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	30874598
42	NC_014592	AG	6	55341	55351	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30874598
43	NC_014592	GTTT	3	55681	55691	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	30874598
44	NC_014592	GAG	4	57395	57406	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	30874598
45	NC_014592	AAG	4	57914	57924	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30874598
46	NC_014592	TATG	3	58047	58057	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	30874598
47	NC_014592	AATG	3	58437	58448	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	30874598
48	NC_014592	C	16	58508	58523	16	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	30874598
49	NC_014592	CTGT	3	58755	58766	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	30874598
50	NC_014592	A	12	59704	59715	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30874598
51	NC_014592	AATC	3	59991	60001	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	30874598
52	NC_014592	TAA	4	60414	60425	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874598
53	NC_014592	A	12	62063	62074	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30874598
54	NC_014592	C	15	63248	63262	15	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	30874598
55	NC_014592	TGGC	3	63530	63541	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	30874598
56	NC_014592	C	13	63783	63795	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	30874598
57	NC_014592	TAT	4	65701	65712	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874598
58	NC_014592	GTTT	3	69016	69026	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	30874598
59	NC_014592	CAA	4	73559	73570	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30874598
60	NC_014592	A	12	74341	74352	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30874598
61	NC_014592	CCTT	3	75411	75421	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	30874598
62	NC_014592	TTTGA	3	75820	75833	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	30874598
63	NC_014592	GAC	4	77304	77315	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30874598
64	NC_014592	AT	9	77620	77637	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30874598
65	NC_014592	TGC	4	77735	77746	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30874598
66	NC_014592	TATC	3	79903	79914	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30874598
67	NC_014592	AT	8	82801	82816	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30874598
68	NC_014592	AAGG	3	83105	83115	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30874598
69	NC_014592	AAAT	3	83953	83964	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30874598
70	NC_014592	TTCT	5	84182	84200	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	30874598
71	NC_014592	A	12	84566	84577	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30874598
72	NC_014592	CT	6	85237	85247	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	30874598
73	NC_014592	TTCA	3	85663	85674	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30874598
74	NC_014592	T	15	86163	86177	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30874598
75	NC_014592	AG	6	86387	86397	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30874598
76	NC_014592	CTT	4	90794	90805	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30874598
77	NC_014592	GGAA	3	95761	95773	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	30874598
78	NC_014592	AAG	4	97708	97719	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30874598
79	NC_014592	CATT	3	98327	98337	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	30874598
80	NC_014592	AACAAA	3	98450	98468	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	30874598
81	NC_014592	TGGA	4	100325	100340	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	30874598
82	NC_014592	CATCT	4	101284	101303	20	20 %	40 %	0 %	40 %	10 %	30874598
83	NC_014592	TCAC	3	101377	101388	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	30874598
84	NC_014592	CAA	4	102897	102908	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30874598
85	NC_014592	GAG	4	104861	104873	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	30874598
86	NC_014592	AAGT	3	105313	105323	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	30874598
87	NC_014592	G	15	105617	105631	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	30874598
88	NC_014592	GAA	4	108672	108683	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30874598
89	NC_014592	T	12	111197	111208	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	30874598
90	NC_014592	GGCA	3	111584	111595	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	30874598
91	NC_014592	AAT	4	111596	111608	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30874598
92	NC_014592	GAA	4	111827	111837	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30874598
93	NC_014592	ATT	4	112274	112285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874598
94	NC_014592	AT	6	112677	112687	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30874598
95	NC_014592	AATT	3	113697	113708	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30874598
96	NC_014592	GCA	4	113915	113926	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30874598
97	NC_014592	GTAG	3	114167	114178	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	30874598
98	NC_014592	AAAG	3	115473	115484	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30874598
99	NC_014592	TA	8	119479	119494	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30874598
100	NC_014592	ATA	4	120050	120060	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30874598
101	NC_014592	GAA	4	121711	121722	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30874598
102	NC_014592	TAAA	3	124844	124855	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30874598
103	NC_014592	GGAA	3	126291	126302	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	30874598
104	NC_014592	TTC	4	130147	130158	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30874598
105	NC_014592	AGG	4	131138	131148	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	30874598
106	NC_014592	CAA	4	133155	133166	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30874598
107	NC_014592	C	16	133201	133216	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	30874598
108	NC_014592	ACTT	3	133507	133517	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	30874598
109	NC_014592	CTC	4	133961	133972	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	30874598
110	NC_014592	AATT	3	135412	135423	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30874598
111	NC_014592	TTG	4	135922	135933	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30874598
112	NC_014592	ATGA	3	137516	137527	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	30874598
113	NC_014592	TCCA	4	138490	138505	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	30874598
114	NC_014592	TTTGTT	3	140362	140380	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	30874598
115	NC_014592	AATG	3	140493	140503	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	30874598
116	NC_014592	TCT	4	141111	141121	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30874598
117	NC_014592	ACGC	3	142068	142080	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	30874598
118	NC_014592	TTCC	3	143057	143069	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	30874598
119	NC_014592	TGG	4	144325	144336	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	30874598
120	NC_014592	AGA	4	148026	148037	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30874598
121	NC_014592	GGA	4	149425	149436	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	30874598
122	NC_014592	GAGG	3	150682	150693	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	30874598
123	NC_014592	AGGT	3	150894	150905	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	30874598
124	NC_014592	A	13	152655	152667	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30874598
125	NC_014592	GGGA	3	152852	152862	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	30874598
126	NC_014592	ACCT	3	153552	153564	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	30874598
127	NC_014592	GA	6	153582	153592	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30874598
128	NC_014592	T	12	154253	154264	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30874598
129	NC_014592	AAAG	3	154635	154646	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30874598
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131	NC_014592	CCTT	3	155715	155725	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cheilanthes lindheimeri chloroplast