Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Cathaya argyrophylla chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014589TCC4726736110 %33.33 %0 %66.67 %9 %30932243
2NC_014589AATG38508611250 %25 %25 %0 %8 %30932243
3NC_014589CCAT3283128421225 %25 %0 %50 %0 %30932243
4NC_014589TCTA3380338141225 %50 %0 %25 %0 %30932243
5NC_014589A164305432016100 %0 %0 %0 %0 %30932243
6NC_014589A234856487823100 %0 %0 %0 %4 %30932243
7NC_014589TAA4523452451266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932243
8NC_014589GAAA3531653261175 %0 %25 %0 %9 %30932243
9NC_014589T2856665693280 %100 %0 %0 %7 %30932243
10NC_014589GAAA3679068001175 %0 %25 %0 %9 %30932243
11NC_014589AAT4734573551166.67 %33.33 %0 %0 %9 %30932243
12NC_014589AATG3745274621150 %25 %25 %0 %9 %30932243
13NC_014589GAAA3837783881275 %0 %25 %0 %8 %30932243
14NC_014589A178681869717100 %0 %0 %0 %5 %30932243
15NC_014589CGTG388008811120 %25 %50 %25 %8 %30932243
16NC_014589A129574958512100 %0 %0 %0 %8 %30932243
17NC_014589AATT310570105801150 %50 %0 %0 %9 %30932243
18NC_014589AG710923109351350 %0 %50 %0 %7 %30932243
19NC_014589AAAAG311691117051580 %0 %20 %0 %6 %30932243
20NC_014589A19134471346519100 %0 %0 %0 %0 %30932243
21NC_014589TATC313892139031225 %50 %0 %25 %8 %30932243
22NC_014589ACGA314210142201150 %0 %25 %25 %9 %30932243
23NC_014589T121453314544120 %100 %0 %0 %0 %30932243
24NC_014589TA615852158621150 %50 %0 %0 %9 %30932243
25NC_014589TTCC31737517386120 %50 %0 %50 %0 %30932243
26NC_014589GAAA317416174281375 %0 %25 %0 %7 %30932243
27NC_014589A15178371785115100 %0 %0 %0 %0 %30932243
28NC_014589ATT418531185411133.33 %66.67 %0 %0 %9 %30932243
29NC_014589T131920319215130 %100 %0 %0 %7 %30932243
30NC_014589TACAG319556195691440 %20 %20 %20 %7 %30932243
31NC_014589ATTT320522205321125 %75 %0 %0 %9 %30932243
32NC_014589AGAA321403214141275 %0 %25 %0 %0 %30932243
33NC_014589TA623781237921250 %50 %0 %0 %8 %30932243
34NC_014589GA623910239211250 %0 %50 %0 %8 %30932243
35NC_014589ATCT324601246121225 %50 %0 %25 %8 %30932243
36NC_014589ATAGGT326808268302333.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30932243
37NC_014589GTT42715027160110 %66.67 %33.33 %0 %9 %30932243
38NC_014589C122788027891120 %0 %0 %100 %0 %30932243
39NC_014589TAA429905299171366.67 %33.33 %0 %0 %7 %30932243
40NC_014589TC63048830499120 %50 %0 %50 %8 %30932243
41NC_014589AGA431471314811166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932243
42NC_014589TA731752317651450 %50 %0 %0 %7 %30932243
43NC_014589T143176431777140 %100 %0 %0 %7 %30932243
44NC_014589TAA432265322761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932243
45NC_014589A21342233424321100 %0 %0 %0 %4 %30932243
46NC_014589ACAA334796348061175 %0 %0 %25 %9 %30932243
47NC_014589TATATG435895359182433.33 %50 %16.67 %0 %8 %30932243
48NC_014589AAG437755377651166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932243
49NC_014589AT638160381711250 %50 %0 %0 %8 %30932243
50NC_014589GATA338191382021250 %25 %25 %0 %8 %30932243
51NC_014589GGA441041410521233.33 %0 %66.67 %0 %8 %30932243
52NC_014589T164355743572160 %100 %0 %0 %6 %30932243
53NC_014589T144378843801140 %100 %0 %0 %7 %30932243
54NC_014589TAA444957449681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932243
55NC_014589GAA445758457681166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932243
56NC_014589ATC446089460991133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932243
57NC_014589T234671346735230 %100 %0 %0 %4 %30932243
58NC_014589ATA447218472291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932243
59NC_014589GGAT347828478381125 %25 %50 %0 %9 %30932243
60NC_014589GAA448869488801266.67 %0 %33.33 %0 %0 %30932243
61NC_014589GGGAGG348882489001916.67 %0 %83.33 %0 %10 %30932243
62NC_014589CAT449561495711133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932243
63NC_014589AAC451512515231266.67 %0 %0 %33.33 %8 %30932243
64NC_014589ATG453941539511133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %30932243
65NC_014589CGTA355034550441125 %25 %25 %25 %9 %30932243
66NC_014589GAA456149561601266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932243
67NC_014589AAGA356471564811175 %0 %25 %0 %9 %30932243
68NC_014589TAA458969589801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932243
69NC_014589G185899759014180 %0 %100 %0 %5 %30932243
70NC_014589ATATGG359232592491833.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %30932243
71NC_014589TCCTT36123661250150 %60 %0 %40 %6 %30932243
72NC_014589AAAT361305613171375 %25 %0 %0 %7 %30932243
73NC_014589CT66428664297120 %50 %0 %50 %8 %30932243
74NC_014589CTAT364470644821325 %50 %0 %25 %7 %30932243
75NC_014589T226470864729220 %100 %0 %0 %4 %30932243
76NC_014589TTTCT36478064794150 %80 %0 %20 %6 %30932243
77NC_014589T186480264819180 %100 %0 %0 %0 %30932243
78NC_014589TC66606766078120 %50 %0 %50 %8 %30932243
79NC_014589GAAAAA366722667401983.33 %0 %16.67 %0 %5 %30932243
80NC_014589CTTT36742467434110 %75 %0 %25 %9 %30932243
81NC_014589TAA467852678631266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932243
82NC_014589TCT46960369613110 %66.67 %0 %33.33 %9 %30932243
83NC_014589ATAG370647706571150 %25 %25 %0 %9 %30932243
84NC_014589AAAT371516715261175 %25 %0 %0 %9 %30932243
85NC_014589TTC47174871758110 %66.67 %0 %33.33 %9 %30932243
86NC_014589GAT471959719691133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %30932243
87NC_014589TCGAT371972719851420 %40 %20 %20 %7 %30932243
88NC_014589A26727667279126100 %0 %0 %0 %7 %30932243
89NC_014589T137412774139130 %100 %0 %0 %7 %30932243
90NC_014589A17746787469417100 %0 %0 %0 %5 %30932243
91NC_014589TAGT374778747901325 %50 %25 %0 %7 %30932243
92NC_014589GTA475109751191133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %30932243
93NC_014589ATT475548755601333.33 %66.67 %0 %0 %7 %30932243
94NC_014589T207614176160200 %100 %0 %0 %5 %30932243
95NC_014589ATTC476291763051525 %50 %0 %25 %6 %30932243
96NC_014589A12765827659312100 %0 %0 %0 %0 %30932243
97NC_014589A14786087862114100 %0 %0 %0 %7 %30932243
98NC_014589AG680830808401150 %0 %50 %0 %9 %30932243
99NC_014589T178161481630170 %100 %0 %0 %5 %30932243
100NC_014589AGAA381633816431175 %0 %25 %0 %9 %30932243
101NC_014589T178188081896170 %100 %0 %0 %0 %30932243
102NC_014589TCCA382333823441225 %25 %0 %50 %8 %30932243
103NC_014589TCT48301183022120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932243
104NC_014589ATG487656876671233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30932243
105NC_014589AT687895879061250 %50 %0 %0 %8 %30932243
106NC_014589TCCAAT388964889821933.33 %33.33 %0 %33.33 %10 %30932243
107NC_014589AAT489978899881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %30932243
108NC_014589TAA490414904261366.67 %33.33 %0 %0 %7 %30932243
109NC_014589TAA590443904571566.67 %33.33 %0 %0 %6 %30932243
110NC_014589T129072190732120 %100 %0 %0 %8 %30932243
111NC_014589TTC49158191591110 %66.67 %0 %33.33 %9 %30932243
112NC_014589AGA491719917291166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932243
113NC_014589GGTT39182991841130 %50 %50 %0 %7 %30932243
114NC_014589CTAC393456934671225 %25 %0 %50 %0 %30932243
115NC_014589TCTT39593895949120 %75 %0 %25 %0 %30932243
116NC_014589GGAT396938969491225 %25 %50 %0 %8 %30932243
117NC_014589AGA51002041002171466.67 %0 %33.33 %0 %7 %30932243
118NC_014589GA61003281003381150 %0 %50 %0 %9 %30932243
119NC_014589T16100644100659160 %100 %0 %0 %0 %30932243
120NC_014589GGAT31006641006741125 %25 %50 %0 %9 %30932243
121NC_014589GAAA31022271022381275 %0 %25 %0 %8 %30932243
122NC_014589A2610337510340026100 %0 %0 %0 %7 %30932243
123NC_014589GA61034021034131250 %0 %50 %0 %8 %30932243
124NC_014589ATACC31035491035621440 %20 %0 %40 %7 %30932243
125NC_014589CTC4103988103998110 %33.33 %0 %66.67 %9 %30932243
126NC_014589AGG41040501040621333.33 %0 %66.67 %0 %7 %30932243
127NC_014589TCT4104879104891130 %66.67 %0 %33.33 %7 %30932243
128NC_014589GAA41050931051041266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932243
129NC_014589ATT51057921058061533.33 %66.67 %0 %0 %6 %30932243
130NC_014589ATG41064791064891133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %30932243