Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Monsonia speciosa plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014582TTA554671433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
2NC_014582GCTT3179190120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
3NC_014582AATA42722871675 %25 %0 %0 %6 %30932220
4NC_014582CAA43563671266.67 %0 %0 %33.33 %8 %30932220
5NC_014582CTAT34354461225 %50 %0 %25 %8 %30932220
6NC_014582TATAGA3259526121850 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
7NC_014582GAAT3292929401250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
8NC_014582GAA4345534661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
9NC_014582AGGGGA3372437411833.33 %0 %66.67 %0 %5 %30932220
10NC_014582AG6388238931250 %0 %50 %0 %8 %30932220
11NC_014582TCTATC4391539382416.67 %50 %0 %33.33 %4 %30932220
12NC_014582TAA4496049711266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_014582GAAA3499950091175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
14NC_014582GAG4537053801133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
15NC_014582A145396540914100 %0 %0 %0 %7 %30932221
16NC_014582GAAA3678167921275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
17NC_014582ATTG3776377731125 %50 %25 %0 %9 %30932221
18NC_014582A12103071031812100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
19NC_014582G131231812330130 %0 %100 %0 %7 %30932221
20NC_014582AGA415428154381166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932221
21NC_014582AAAAG416028160461980 %0 %20 %0 %10 %Non-Coding
22NC_014582AATA316392164031275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_014582AAT416557165681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_014582T191682816846190 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
25NC_014582GAAA318761187721275 %0 %25 %0 %8 %30932221
26NC_014582TTGC31916219172110 %50 %25 %25 %9 %30932221
27NC_014582AAAG319811198221275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
28NC_014582AG619975199851150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
29NC_014582TC62060820618110 %50 %0 %50 %9 %30932222
30NC_014582GCCTT32083020844150 %40 %20 %40 %6 %Non-Coding
31NC_014582T132213322145130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_014582GTTC32230822320130 %50 %25 %25 %7 %30932222
33NC_014582T132265522667130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
34NC_014582TCCC32312523135110 %25 %0 %75 %9 %Non-Coding
35NC_014582CA623260232711250 %0 %0 %50 %8 %Non-Coding
36NC_014582T122372223733120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
37NC_014582TCT62439924415170 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
38NC_014582CTC42458924599110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
39NC_014582TTCATA324722247391833.33 %50 %0 %16.67 %0 %Non-Coding
40NC_014582T142483224845140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_014582ATAG325316253271250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
42NC_014582TATT325384253951225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_014582TTTTTG32548525502180 %83.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
44NC_014582TCT42718727197110 %66.67 %0 %33.33 %9 %30932222
45NC_014582AAAG328216282261175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
46NC_014582T152863328647150 %100 %0 %0 %0 %30932222
47NC_014582GCTT32933829349120 %50 %25 %25 %8 %30932222
48NC_014582A15298882990215100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
49NC_014582T133148131493130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
50NC_014582A16314943150916100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
51NC_014582TTG43292032930110 %66.67 %33.33 %0 %9 %30932222
52NC_014582T123314033151120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
53NC_014582CCCGCT33344833465180 %16.67 %16.67 %66.67 %5 %Non-Coding
54NC_014582AT634021340311150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_014582T183711537132180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
56NC_014582TAT437160371701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
57NC_014582TAAAGA337450374661766.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
58NC_014582A14374693748214100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_014582ATCT337569375801225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
60NC_014582A16376683768316100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
61NC_014582ATAG338580385901150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
62NC_014582TTTCT33949139504140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
63NC_014582CATTTT340007400251916.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
64NC_014582T134155941571130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
65NC_014582T124284842859120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
66NC_014582ATA544894449081566.67 %33.33 %0 %0 %6 %30932223
67NC_014582TGCA346564465761325 %25 %25 %25 %7 %30932224
68NC_014582CTAT347205472151125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
69NC_014582A19472694728719100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
70NC_014582T164746747482160 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
71NC_014582CGTT34750547517130 %50 %25 %25 %7 %Non-Coding
72NC_014582TAA647517475341866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
73NC_014582GC64768447695120 %0 %50 %50 %8 %Non-Coding
74NC_014582T134778747799130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
75NC_014582CTTT34780647818130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
76NC_014582CTCTT34783447847140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
77NC_014582CTTT34785147863130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
78NC_014582CTTT34786647878130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
79NC_014582CTTT34788147893130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
80NC_014582CTTT34789647908130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
81NC_014582CTTT34791147923130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
82NC_014582CTTT34792647938130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
83NC_014582CTCTT34795447967140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
84NC_014582CTTT34797247984130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
85NC_014582CTTT34798747999130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
86NC_014582CTTT34800248014130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
87NC_014582CTTT34801748029130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
88NC_014582CTTT34803248044130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
89NC_014582CTT44804948059110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
90NC_014582GTT44839648406110 %66.67 %33.33 %0 %9 %30932224
91NC_014582TA648845488551150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
92NC_014582T125108251093120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
93NC_014582TTAA351198512091250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
94NC_014582AAAG351355513661275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
95NC_014582A15513915140515100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
96NC_014582T155146851482150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
97NC_014582A12515335154412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
98NC_014582ATA452874528841166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
99NC_014582CT75301253024130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
100NC_014582TTTC35308653097120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
101NC_014582TAGAA453600536181960 %20 %20 %0 %5 %Non-Coding
102NC_014582TA654820548301150 %50 %0 %0 %9 %30932225
103NC_014582GGAGGG355024550411816.67 %0 %83.33 %0 %5 %Non-Coding
104NC_014582AAAT356933569431175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
105NC_014582TAT457385573961233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
106NC_014582AGA457587575991366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
107NC_014582AT657652576621150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
108NC_014582TATTAG357807578251933.33 %50 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
109NC_014582ATTC357855578651125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
110NC_014582ATT457871578821233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
111NC_014582AATG358012580241350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
112NC_014582A15580405805415100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
113NC_014582TTTC36005360063110 %75 %0 %25 %9 %30932225
114NC_014582T126040060411120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
115NC_014582TTCT36121561226120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
116NC_014582A12613606137112100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
117NC_014582TTTA361468614781125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
118NC_014582TTGA362973629841225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
119NC_014582T176301563031170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
120NC_014582TAAA363199632101275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
121NC_014582CTTT36365763669130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
122NC_014582AATA364053640641275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
123NC_014582TAA464565645751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
124NC_014582ACCC364595646061225 %0 %0 %75 %8 %Non-Coding
125NC_014582A14649116492414100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
126NC_014582T186643266449180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
127NC_014582T126676666777120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
128NC_014582TGT46703267042110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
129NC_014582CT66710867118110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
130NC_014582AATG367587675981250 %25 %25 %0 %8 %30932225
131NC_014582TATC367967679771125 %50 %0 %25 %9 %30932225
132NC_014582TTCT37079270802110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
133NC_014582TCTATA371570715861733.33 %50 %0 %16.67 %5 %30932225
134NC_014582ATTC371740717501125 %50 %0 %25 %9 %30932225
135NC_014582TGAAA371809718241660 %20 %20 %0 %6 %30932225
136NC_014582TAA471829718391166.67 %33.33 %0 %0 %9 %30932225
137NC_014582AGA572531725451566.67 %0 %33.33 %0 %6 %30932225
138NC_014582GAA472927729391366.67 %0 %33.33 %0 %7 %30932225
139NC_014582CAT577039770531533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %30932226
140NC_014582AATAG378116781291460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
141NC_014582A17782257824117100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
142NC_014582GTT47983679847120 %66.67 %33.33 %0 %8 %30932226
143NC_014582A13803948040613100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
144NC_014582TA680600806101150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
145NC_014582GAA480713807241266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
146NC_014582AAT580955809691566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
147NC_014582ATTT381003810141225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
148NC_014582T128132981340120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
149NC_014582CTCC38136081371120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
150NC_014582TTTC38150081511120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
151NC_014582GATTTC381656816731816.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
152NC_014582A25817148173825100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
153NC_014582CTA482256822661133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932226
154NC_014582AAAG382444824551275 %0 %25 %0 %8 %30932226
155NC_014582T148317183184140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
156NC_014582CAAA383186831971275 %0 %0 %25 %0 %Non-Coding
157NC_014582TTTA383981839921225 %75 %0 %0 %8 %30932226
158NC_014582GAAG385419854311350 %0 %50 %0 %7 %30932226
159NC_014582TATT385495855051125 %75 %0 %0 %9 %30932226
160NC_014582TTTTTC38613686152170 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
161NC_014582T138616286174130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
162NC_014582TAAT386529865391150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
163NC_014582A17885578857317100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
164NC_014582ATAA389069890801275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
165NC_014582TTTA390266902771225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
166NC_014582T139031890330130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
167NC_014582AATTAT390851908691950 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
168NC_014582AGA491027910381266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
169NC_014582TA691074910841150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
170NC_014582CTT49348293493120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
171NC_014582TCT49370293714130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
172NC_014582GAA493717937281266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
173NC_014582GTAT395502955121125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
174NC_014582CTGA396995970061225 %25 %25 %25 %8 %30932226
175NC_014582TCCCT39927099284150 %40 %0 %60 %6 %Non-Coding
176NC_014582TTTCT3100277100290140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
177NC_014582TATTAG41007831008052333.33 %50 %16.67 %0 %4 %Non-Coding
178NC_014582CGAAG31029111029251540 %0 %40 %20 %6 %Non-Coding
179NC_014582T12103902103913120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
180NC_014582ATCC31044771044881225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
181NC_014582CTAT31048651048761225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
182NC_014582GGAG31052331052441225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
183NC_014582GAGG31077521077631225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
184NC_014582ATATGA31079361079531850 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
185NC_014582AGGT31081931082041225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
186NC_014582AG61124671124781250 %0 %50 %0 %8 %30932227
187NC_014582GATT31140081140191225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
188NC_014582CAAA31140441140541175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
189NC_014582TTAG31143771143881225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
190NC_014582C12114713114724120 %0 %0 %100 %8 %Non-Coding
191NC_014582AAT41151961152081366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
192NC_014582GAAT31153651153761250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
193NC_014582A1311537711538913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
194NC_014582TAA51156071156221666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
195NC_014582AAT51190491190641666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
196NC_014582A1312021912023113100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
197NC_014582CTAA31222601222711250 %25 %0 %25 %8 %30932228
198NC_014582ACCA31226261226371250 %0 %0 %50 %8 %30932228
199NC_014582GAAT31227921228021150 %25 %25 %0 %9 %30932228
200NC_014582TC6124171124182120 %50 %0 %50 %8 %30932228
201NC_014582CGAAAA31246211246391966.67 %0 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
202NC_014582AGAC31247981248081150 %0 %25 %25 %9 %30932228