ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Monsonia speciosa plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014582	TTA	5	54	67	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_014582	CAA	4	356	367	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30932220
3	NC_014582	GAA	4	3455	3466	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_014582	TAA	4	4960	4971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_014582	GAG	4	5370	5380	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_014582	AGA	4	15428	15438	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30932221
7	NC_014582	AAT	4	16557	16568	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_014582	TCT	6	24399	24415	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
9	NC_014582	CTC	4	24589	24599	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
10	NC_014582	TCT	4	27187	27197	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30932222
11	NC_014582	TTG	4	32920	32930	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	30932222
12	NC_014582	TAT	4	37160	37170	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_014582	ATA	5	44894	44908	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30932223
14	NC_014582	TAA	6	47517	47534	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_014582	CTT	4	48049	48059	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_014582	GTT	4	48396	48406	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	30932224
17	NC_014582	ATA	4	52874	52884	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_014582	TAT	4	57385	57396	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_014582	AGA	4	57587	57599	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_014582	ATT	4	57871	57882	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014582	TAA	4	64565	64575	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_014582	TGT	4	67032	67042	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014582	TAA	4	71829	71839	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932225
24	NC_014582	AGA	5	72531	72545	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	30932225
25	NC_014582	GAA	4	72927	72939	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	30932225
26	NC_014582	CAT	5	77039	77053	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	30932226
27	NC_014582	GTT	4	79836	79847	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30932226
28	NC_014582	GAA	4	80713	80724	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_014582	AAT	5	80955	80969	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_014582	CTA	4	82256	82266	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30932226
31	NC_014582	AGA	4	91027	91038	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_014582	CTT	4	93482	93493	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_014582	TCT	4	93702	93714	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_014582	GAA	4	93717	93728	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_014582	AAT	4	115196	115208	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_014582	TAA	5	115607	115622	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_014582	AAT	5	119049	119064	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Monsonia speciosa plastid