ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Symsagittifera roscoffensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014578	T	13	194	206	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	30874581
2	NC_014578	TACT	3	620	630	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	30874581
3	NC_014578	TAT	4	1032	1042	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30874581
4	NC_014578	TTTA	3	1402	1412	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30874581
5	NC_014578	GTTTA	3	1591	1604	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_014578	ATGG	3	2021	2031	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	30874582
7	NC_014578	TCTT	3	2324	2334	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30874582
8	NC_014578	AACT	4	2419	2434	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	30874582
9	NC_014578	TTCT	3	2877	2888	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	30874582
10	NC_014578	CTTT	3	2904	2916	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	30874582
11	NC_014578	ATT	4	3355	3366	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874582
12	NC_014578	T	12	3488	3499	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30874582
13	NC_014578	CTTTTT	3	3512	3530	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30874582
14	NC_014578	TAT	4	3659	3670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874582
15	NC_014578	TTAT	3	3783	3794	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30874582
16	NC_014578	ATTT	3	3825	3836	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30874582
17	NC_014578	ATT	4	4309	4319	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_014578	TA	6	4472	4482	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_014578	AAATA	3	4557	4572	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_014578	A	14	4891	4904	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_014578	ATA	4	5024	5034	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_014578	A	13	5168	5180	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014578	ATAAG	3	5235	5248	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_014578	TAAA	3	5936	5946	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30874582
25	NC_014578	CTTT	3	6018	6028	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30874582
26	NC_014578	TA	7	6049	6062	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30874582
27	NC_014578	AGA	4	6272	6282	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30874582
28	NC_014578	AATTGA	3	6719	6736	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	30874582
29	NC_014578	AAAG	3	6835	6845	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	30874582
30	NC_014578	A	12	7673	7684	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014578	A	13	7694	7706	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_014578	AAATT	3	7783	7797	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_014578	TAAAA	3	8008	8022	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_014578	T	12	8394	8405	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014578	TTG	4	8631	8642	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30874582
36	NC_014578	TTTAG	3	8717	8730	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	30874582
37	NC_014578	ATT	4	8742	8753	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874582
38	NC_014578	ATA	4	8794	8805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874582
39	NC_014578	ATA	4	9092	9103	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874582
40	NC_014578	TA	7	9117	9129	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_014578	TAT	7	9530	9550	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30874582
42	NC_014578	TTA	4	9751	9761	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30874582
43	NC_014578	ATT	4	10317	10328	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30874582
44	NC_014578	GAAA	3	10689	10700	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30874582
45	NC_014578	TAA	4	11218	11229	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874582
46	NC_014578	A	18	11559	11576	18	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30874582
47	NC_014578	AATAAA	3	11727	11745	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	30874582
48	NC_014578	AAAT	3	12036	12046	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30874582
49	NC_014578	AAAG	3	13359	13370	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	30874582
50	NC_014578	AAT	4	13761	13772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874582
51	NC_014578	TTTACT	6	13789	13821	33	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
52	NC_014578	TAA	4	14043	14054	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874582
53	NC_014578	TAA	4	14057	14068	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30874582
54	NC_014578	TTTTAT	3	14679	14697	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Symsagittifera roscoffensis mitochondrion