Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cedrus deodara chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014575ATA411839118501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932230
2NC_014575TCT41307013080110 %66.67 %0 %33.33 %9 %30932230
3NC_014575CCT41455214562110 %33.33 %0 %66.67 %9 %30932230
4NC_014575TTA420166201771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_014575GGA424674246841133.33 %0 %66.67 %0 %9 %30932230
6NC_014575CTG42937229383120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %30932231
7NC_014575GAA429418294291266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932231
8NC_014575TAT542172421861533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_014575TGG44312043131120 %33.33 %66.67 %0 %8 %30932231
10NC_014575AGA443506435171266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932231
11NC_014575CTT44558345595130 %66.67 %0 %33.33 %7 %30932231
12NC_014575AGA446069460791166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932231
13NC_014575TAT447567475771133.33 %66.67 %0 %0 %9 %30932231
14NC_014575GAA449477494881266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932231
15NC_014575TTC45327553286120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
16NC_014575GTA458793588041233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30932235
17NC_014575TTC46505765068120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932235
18NC_014575TAC468728687381133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932235
19NC_014575AAG469276692861166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932235
20NC_014575AAG469298693081166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932235
21NC_014575ATC471877718871133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932235
22NC_014575GAA472088720981166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30932235
23NC_014575GAC472367723771133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %30932235
24NC_014575AAT474416744271266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932235
25NC_014575CTA476059760691133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932235
26NC_014575TCT47738677397120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932235
27NC_014575GTT58218882202150 %66.67 %33.33 %0 %6 %30932235
28NC_014575TAT485822858321133.33 %66.67 %0 %0 %9 %30932235
29NC_014575TTC48775087761120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932235
30NC_014575CAT489959899691133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932235
31NC_014575GTT49237792388120 %66.67 %33.33 %0 %8 %30932235
32NC_014575CTT49501995030120 %66.67 %0 %33.33 %0 %30932235
33NC_014575AGA497200972111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932235
34NC_014575CTT59724897261140 %66.67 %0 %33.33 %7 %30932235
35NC_014575ATA41010381010491266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932235
36NC_014575AAT41012571012671166.67 %33.33 %0 %0 %9 %30932235
37NC_014575AGC41051781051891233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %30932235
38NC_014575TAC41166651166761233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %30932235