Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Eucalyptus grandis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014570CATT3421642271225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
2NC_014570GTTC362496260120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
3NC_014570ATAG3660966201250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
4NC_014570CTTT372957305110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
5NC_014570CTTT391629173120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
6NC_014570GAAA3940094111275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
7NC_014570TTAA411127111421650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_014570ATTT311178111891225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
9NC_014570TACG311322113331225 %25 %25 %25 %8 %30932243
10NC_014570AAAT314111141221275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_014570TTTA314184141951225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_014570TAAA314273142851375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_014570ATAA314580145911275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_014570ATTC315115151251125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
15NC_014570TTTC31512815139120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
16NC_014570TTCT31536015370110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
17NC_014570TTTA315684156941125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_014570TTCT31854218552110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
19NC_014570TTCT42027920294160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
20NC_014570TTCA324014240251225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
21NC_014570CCTA325897259071125 %25 %0 %50 %9 %30932244
22NC_014570CTTT32873228743120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
23NC_014570CTTG32967829689120 %50 %25 %25 %0 %Non-Coding
24NC_014570GATT329792298031225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
25NC_014570TTCA331898319081125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
26NC_014570TTTC33316233174130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
27NC_014570TCTT33356333574120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
28NC_014570ATTC333692337021125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
29NC_014570TTCA333867338781225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
30NC_014570ATTA434125341401650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
31NC_014570GATT335580355901125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
32NC_014570GAAA337315373261275 %0 %25 %0 %8 %30932244
33NC_014570TTGC33771637726110 %50 %25 %25 %9 %30932244
34NC_014570ATTT339512395221125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_014570AATG343631436421250 %25 %25 %0 %8 %30932244
36NC_014570ATTA445663456771550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
37NC_014570TATC346568465781125 %50 %0 %25 %9 %30932245
38NC_014570TAAG346585465961250 %25 %25 %0 %0 %30932245
39NC_014570CTTT34685046860110 %75 %0 %25 %9 %30932245
40NC_014570CTTT34775747768120 %75 %0 %25 %8 %30932245
41NC_014570ATAA349860498711275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_014570TAGT350684506941125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
43NC_014570TTTC35261752627110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
44NC_014570TTTG35349153501110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
45NC_014570GTCT35398954000120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
46NC_014570ATTT354970549811225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
47NC_014570TCTT35529355303110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
48NC_014570TTTC35858658596110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
49NC_014570TGCA359906599181325 %25 %25 %25 %7 %30932245
50NC_014570CTTT46278562799150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
51NC_014570TCTT36297662987120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
52NC_014570TTAT363144631541125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
53NC_014570AAAC363878638891275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
54NC_014570AATA366324663361375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
55NC_014570TTCT36862768637110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
56NC_014570CTTG36938769397110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
57NC_014570TGAT370220702311225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
58NC_014570AATT370889709001250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
59NC_014570GTTT37214072150110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
60NC_014570ATTT372159721701225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_014570ATAA472925729401675 %25 %0 %0 %6 %30932246
62NC_014570TGAA373569735801250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
63NC_014570TTTC37360373615130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
64NC_014570GATA374207742181250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
65NC_014570CCTT37422774237110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
66NC_014570GTAA374547745571150 %25 %25 %0 %9 %30932249
67NC_014570TTTA375110751211225 %75 %0 %0 %8 %30932249
68NC_014570TTTC47945579470160 %75 %0 %25 %0 %30932249
69NC_014570TTTC38277282782110 %75 %0 %25 %9 %30932249
70NC_014570TTCT38463384644120 %75 %0 %25 %8 %30932249
71NC_014570AAAT385860858701175 %25 %0 %0 %9 %30932249
72NC_014570GAAT386654866651250 %25 %25 %0 %8 %30932249
73NC_014570TTCT38698786998120 %75 %0 %25 %0 %30932249
74NC_014570CAAT387476874861150 %25 %0 %25 %9 %30932249
75NC_014570ACTA388284882941150 %25 %0 %25 %9 %30932249
76NC_014570TTCT49252092534150 %75 %0 %25 %6 %30932249
77NC_014570CTTT39371793727110 %75 %0 %25 %9 %30932249
78NC_014570TGAT395542955541325 %50 %25 %0 %7 %30932249
79NC_014570TGAT395584955961325 %50 %25 %0 %7 %30932249
80NC_014570AATA396431964431375 %25 %0 %0 %7 %30932249
81NC_014570AATA398280982911275 %25 %0 %0 %8 %30932249
82NC_014570TGGG39872498735120 %25 %75 %0 %8 %30932249
83NC_014570ATCC31076321076431225 %25 %0 %50 %8 %30932249
84NC_014570CTAT31080291080401225 %50 %0 %25 %8 %30932249
85NC_014570AAGG31081711081811150 %0 %50 %0 %9 %30932249
86NC_014570GAGG31108961109071225 %0 %75 %0 %8 %30932249
87NC_014570AGGT31111081111191225 %25 %50 %0 %8 %30932249
88NC_014570TAAG31122281122381150 %25 %25 %0 %9 %30932249
89NC_014570AATA31154561154671275 %25 %0 %0 %8 %30932249
90NC_014570ATAG31175011175121250 %25 %25 %0 %0 %30932249
91NC_014570TTCA31181211181321225 %50 %0 %25 %8 %30932249
92NC_014570GAAA31208701208811275 %0 %25 %0 %8 %30932249
93NC_014570AAGA31212781212891275 %0 %25 %0 %8 %30932249
94NC_014570TAAT31229551229661250 %50 %0 %0 %0 %30932249
95NC_014570TATT41229731229881625 %75 %0 %0 %6 %30932249
96NC_014570AATC31264191264301250 %25 %0 %25 %8 %30932249
97NC_014570TGAA31265611265711150 %25 %25 %0 %9 %30932249
98NC_014570AATA31284631284741275 %25 %0 %0 %8 %30932249
99NC_014570TTCT4129978129992150 %75 %0 %25 %6 %30932249
100NC_014570TTTA31307121307221125 %75 %0 %0 %9 %30932249
101NC_014570TAAT31308691308801250 %50 %0 %0 %0 %30932249
102NC_014570AAGA31311291311401275 %0 %25 %0 %8 %30932249
103NC_014570TTTC3131940131950110 %75 %0 %25 %9 %30932249
104NC_014570TTTC3132532132542110 %75 %0 %25 %9 %30932249
105NC_014570AAAG31326331326431175 %0 %25 %0 %9 %30932249
106NC_014570AAAG31357421357521175 %0 %25 %0 %9 %30932249
107NC_014570CTTA31367721367821125 %50 %0 %25 %9 %30932249
108NC_014570CCTT3140829140839110 %50 %0 %50 %9 %30932249
109NC_014570GGAT31413671413781225 %25 %50 %0 %8 %30932249
110NC_014570ATCA31534561534681350 %25 %0 %25 %7 %30932250
111NC_014570AAAG31552831552931175 %0 %25 %0 %9 %30932250
112NC_014570TATT31563481563591225 %75 %0 %0 %8 %30932250