Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Eucalyptus grandis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014570ACT480911233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_014570T1693108160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
3NC_014570AGA42252361266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
4NC_014570CAG4113211431233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %30932243
5NC_014570CATT3421642271225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
6NC_014570A154610462415100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
7NC_014570AAT4463246431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_014570TCTCT352175230140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
9NC_014570GTTC362496260120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
10NC_014570ATAG3660966201250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
11NC_014570CTTT372957305110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
12NC_014570A128539855012100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_014570AAAAT3882088331480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
14NC_014570AATAA3911691301580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
15NC_014570CTTT391629173120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
16NC_014570TAT5935693701533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_014570GAAA3940094111275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
18NC_014570ACAAA3958896031680 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding
19NC_014570AT610575105851150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_014570ATT411114111241133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_014570TTAA411127111421650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
22NC_014570ATTT311178111891225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
23NC_014570TACG311322113331225 %25 %25 %25 %8 %30932243
24NC_014570A14127441275714100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_014570TTTCT41346513483190 %80 %0 %20 %5 %30932243
26NC_014570AAAT314111141221275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
27NC_014570TTTA314184141951225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_014570TAAA314273142851375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_014570TAA414331143421266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_014570A12144111442212100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_014570ATAA314580145911275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_014570A13148841489613100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_014570ATTC315115151251125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
34NC_014570TTTC31512815139120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
35NC_014570ATTCA315148151611440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
36NC_014570TAG415224152341133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
37NC_014570CAGAT315237152511540 %20 %20 %20 %6 %Non-Coding
38NC_014570TTCT31536015370110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
39NC_014570T121564315654120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
40NC_014570TTTA315684156941125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
41NC_014570T131569915711130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
42NC_014570TTCT31854218552110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
43NC_014570T121990719918120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_014570TTCT42027920294160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
45NC_014570TTCA324014240251225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
46NC_014570GTT42497624987120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
47NC_014570CCTA325897259071125 %25 %0 %50 %9 %30932244
48NC_014570T122760327614120 %100 %0 %0 %8 %30932244
49NC_014570CTTT32873228743120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
50NC_014570CTTG32967829689120 %50 %25 %25 %0 %Non-Coding
51NC_014570GATT329792298031225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
52NC_014570AAT430419304291166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
53NC_014570TTA430689306991133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_014570T173128131297170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
55NC_014570T153163231646150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
56NC_014570TTCA331898319081125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
57NC_014570AAATAA332185322021883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
58NC_014570A19325953261319100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
59NC_014570TTTC33316233174130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
60NC_014570TCTT33356333574120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
61NC_014570ATTC333692337021125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
62NC_014570AAAAGA333772337891883.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
63NC_014570TTCA333867338781225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
64NC_014570ATTA434125341401650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
65NC_014570TTATA334632346451440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_014570CGATA335090351031440 %20 %20 %20 %7 %Non-Coding
67NC_014570GATT335580355901125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
68NC_014570GAAA337315373261275 %0 %25 %0 %8 %30932244
69NC_014570GGA437517375281233.33 %0 %66.67 %0 %8 %30932244
70NC_014570TTGC33771637726110 %50 %25 %25 %9 %30932244
71NC_014570GA638525385361250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
72NC_014570TC63913839148110 %50 %0 %50 %9 %30932244
73NC_014570ATTT339512395221125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_014570TAT539730397431433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
75NC_014570ATG442138421481133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %30932244
76NC_014570AATG343631436421250 %25 %25 %0 %8 %30932244
77NC_014570TG64407344083110 %50 %50 %0 %9 %30932244
78NC_014570ATG444362443721133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %30932244
79NC_014570ATTA445663456771550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
80NC_014570TAA446309463201266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932245
81NC_014570TATC346568465781125 %50 %0 %25 %9 %30932245
82NC_014570TAAG346585465961250 %25 %25 %0 %0 %30932245
83NC_014570CTTT34685046860110 %75 %0 %25 %9 %30932245
84NC_014570CTTT34775747768120 %75 %0 %25 %8 %30932245
85NC_014570A16478394785416100 %0 %0 %0 %6 %30932245
86NC_014570ATAA349860498711275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_014570TAGT350684506941125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
88NC_014570TA650720507301150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_014570TA651131511411150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_014570AAAAT351997520101480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
91NC_014570ATG452084520951233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
92NC_014570CTTTT35239552409150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
93NC_014570TTTC35261752627110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
94NC_014570TATTTG453453534762416.67 %66.67 %16.67 %0 %8 %Non-Coding
95NC_014570TTTG35349153501110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
96NC_014570GTCT35398954000120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
97NC_014570ATTT354970549811225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
98NC_014570TCTT35529355303110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
99NC_014570ATA458219582301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932245
100NC_014570TTTC35858658596110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
101NC_014570TTG45897658986110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
102NC_014570TGCA359906599181325 %25 %25 %25 %7 %30932245
103NC_014570ATT462696627071233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
104NC_014570CTTT46278562799150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
105NC_014570TCTT36297662987120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
106NC_014570TA762998630101350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
107NC_014570TTAT363144631541125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
108NC_014570AATTCG363172631881733.33 %33.33 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
109NC_014570AAG463253632641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
110NC_014570TA663304633141150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
111NC_014570AAAC363878638891275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
112NC_014570CTTTT56488764912260 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
113NC_014570TTC46552565536120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932245
114NC_014570AATA366324663361375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
115NC_014570AT666484664941150 %50 %0 %0 %9 %30932246
116NC_014570CTT46774867759120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
117NC_014570TA667908679191250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
118NC_014570TTCT36862768637110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
119NC_014570CTTG36938769397110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
120NC_014570A12696336964412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
121NC_014570TGAT370220702311225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
122NC_014570AATT370889709001250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
123NC_014570ATA471394714051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
124NC_014570AT771603716151350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
125NC_014570GTTT37214072150110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
126NC_014570ATTT372159721701225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
127NC_014570ATAA472925729401675 %25 %0 %0 %6 %30932246
128NC_014570GAA473039730501266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
129NC_014570TGAA373569735801250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
130NC_014570TTTC37360373615130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
131NC_014570GATA374207742181250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
132NC_014570CCTT37422774237110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
133NC_014570GTAA374547745571150 %25 %25 %0 %9 %30932249
134NC_014570TTC47476274773120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
135NC_014570TTTA375110751211225 %75 %0 %0 %8 %30932249
136NC_014570T127515475165120 %100 %0 %0 %0 %30932249
137NC_014570AGT476309763201233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30932249
138NC_014570TCCAA376381763941440 %20 %0 %40 %7 %30932249
139NC_014570TTCAC476470764892020 %40 %0 %40 %10 %30932249
140NC_014570TCT47845778468120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
141NC_014570TTTC47945579470160 %75 %0 %25 %0 %30932249
142NC_014570TGA481572815831233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30932249
143NC_014570TTTC38277282782110 %75 %0 %25 %9 %30932249
144NC_014570TCT48286482875120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
145NC_014570ATA483569835801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932249
146NC_014570TTCT38463384644120 %75 %0 %25 %8 %30932249
147NC_014570TCCTT38495484969160 %60 %0 %40 %6 %30932249
148NC_014570ATC485480854901133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932249
149NC_014570CTT48582885838110 %66.67 %0 %33.33 %9 %30932249
150NC_014570AAAT385860858701175 %25 %0 %0 %9 %30932249
151NC_014570T128645186462120 %100 %0 %0 %8 %30932249
152NC_014570GAAT386654866651250 %25 %25 %0 %8 %30932249
153NC_014570TTCT38698786998120 %75 %0 %25 %0 %30932249
154NC_014570AT687100871101150 %50 %0 %0 %9 %30932249
155NC_014570CAAT387476874861150 %25 %0 %25 %9 %30932249
156NC_014570CTT48815188162120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
157NC_014570ACTA388284882941150 %25 %0 %25 %9 %30932249
158NC_014570CTT48898488995120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
159NC_014570ATATG390790908041540 %40 %20 %0 %6 %30932249
160NC_014570TTCT49252092534150 %75 %0 %25 %6 %30932249
161NC_014570CTTT39371793727110 %75 %0 %25 %9 %30932249
162NC_014570GAT493872938831233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30932249
163NC_014570TGAT395542955541325 %50 %25 %0 %7 %30932249
164NC_014570TGAT395584955961325 %50 %25 %0 %7 %30932249
165NC_014570AATA396431964431375 %25 %0 %0 %7 %30932249
166NC_014570GAAGGA397217972341850 %0 %50 %0 %5 %30932249
167NC_014570AATA398280982911275 %25 %0 %0 %8 %30932249
168NC_014570TGGG39872498735120 %25 %75 %0 %8 %30932249
169NC_014570TCCGG39933899352150 %20 %40 %40 %6 %30932249
170NC_014570A1310283210284413100 %0 %0 %0 %7 %30932249
171NC_014570TTC4103756103767120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
172NC_014570TATTAG31043381043602333.33 %50 %16.67 %0 %4 %30932249
173NC_014570ATCC31076321076431225 %25 %0 %50 %8 %30932249
174NC_014570CTAT31080291080401225 %50 %0 %25 %8 %30932249
175NC_014570AAGG31081711081811150 %0 %50 %0 %9 %30932249
176NC_014570GAGG31108961109071225 %0 %75 %0 %8 %30932249
177NC_014570AGGT31111081111191225 %25 %50 %0 %8 %30932249
178NC_014570TAAG31122281122381150 %25 %25 %0 %9 %30932249
179NC_014570GAA51143191143331566.67 %0 %33.33 %0 %6 %30932249
180NC_014570AATA31154561154671275 %25 %0 %0 %8 %30932249
181NC_014570ATT41161741161861333.33 %66.67 %0 %0 %7 %30932249
182NC_014570TTGAAA31162911163091950 %33.33 %16.67 %0 %10 %30932249
183NC_014570AAG41168311168421266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932249
184NC_014570ATAG31175011175121250 %25 %25 %0 %0 %30932249
185NC_014570ATGAT31178611178761640 %40 %20 %0 %6 %30932249
186NC_014570TTCA31181211181321225 %50 %0 %25 %8 %30932249
187NC_014570T12118796118807120 %100 %0 %0 %0 %30932249
188NC_014570A1311880811882013100 %0 %0 %0 %7 %30932249
189NC_014570TCA41188961189061133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30932249
190NC_014570TAA41189071189191366.67 %33.33 %0 %0 %7 %30932249
191NC_014570ATT41193321193431233.33 %66.67 %0 %0 %0 %30932249
192NC_014570ATA41207701207811266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30932249
193NC_014570GAAA31208701208811275 %0 %25 %0 %8 %30932249
194NC_014570AAGA31212781212891275 %0 %25 %0 %8 %30932249
195NC_014570TCTAA31228191228321440 %40 %0 %20 %7 %30932249
196NC_014570TAAT31229551229661250 %50 %0 %0 %0 %30932249
197NC_014570TATT41229731229881625 %75 %0 %0 %6 %30932249
198NC_014570TAT41244601244701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %30932249
199NC_014570ATATT31257081257211440 %60 %0 %0 %7 %30932249
200NC_014570ATT41262141262251233.33 %66.67 %0 %0 %8 %30932249
201NC_014570AATC31264191264301250 %25 %0 %25 %8 %30932249
202NC_014570TGAA31265611265711150 %25 %25 %0 %9 %30932249
203NC_014570AATA31284631284741275 %25 %0 %0 %8 %30932249
204NC_014570TTC4128721128732120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
205NC_014570TCT4128731128742120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30932249
206NC_014570TAA41290241290361366.67 %33.33 %0 %0 %7 %30932249
207NC_014570TTCT4129978129992150 %75 %0 %25 %6 %30932249
208NC_014570ATC41306161306271233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %30932249
209NC_014570TTTA31307121307221125 %75 %0 %0 %9 %30932249
210NC_014570TAAT31308691308801250 %50 %0 %0 %0 %30932249
211NC_014570AAGA31311291311401275 %0 %25 %0 %8 %30932249
212NC_014570TTTC3131940131950110 %75 %0 %25 %9 %30932249
213NC_014570ATA41323311323411166.67 %33.33 %0 %0 %9 %30932249
214NC_014570TTTC3132532132542110 %75 %0 %25 %9 %30932249
215NC_014570AAAG31326331326431175 %0 %25 %0 %9 %30932249
216NC_014570ATT41328121328231233.33 %66.67 %0 %0 %8 %30932249
217NC_014570T13133010133022130 %100 %0 %0 %7 %30932249
218NC_014570TTC6134673134691190 %66.67 %0 %33.33 %10 %30932249
219NC_014570AAAG31357421357521175 %0 %25 %0 %9 %30932249
220NC_014570CTTA31367721367821125 %50 %0 %25 %9 %30932249
221NC_014570CCTT3140829140839110 %50 %0 %50 %9 %30932249
222NC_014570GGAT31413671413781225 %25 %50 %0 %8 %30932249
223NC_014570ACTAAT41446491446712350 %33.33 %0 %16.67 %4 %30932249
224NC_014570AAAAGA31451881452061983.33 %0 %16.67 %0 %10 %30932249
225NC_014570GAA41452431452541266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30932249
226NC_014570CATAC31509051509181440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
227NC_014570CTCCTT3151775151792180 %50 %0 %50 %5 %30932250
228NC_014570ATCA31534561534681350 %25 %0 %25 %7 %30932250
229NC_014570ACC41536511536611133.33 %0 %0 %66.67 %9 %30932250
230NC_014570ATC41551271551381233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %30932250
231NC_014570AAAG31552831552931175 %0 %25 %0 %9 %30932250
232NC_014570TATT31563481563591225 %75 %0 %0 %8 %30932250
233NC_014570GAA51600141600281566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding