ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Erodium texanum plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014569	ATC	4	510	520	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_014569	TCT	4	1285	1296	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30932205
3	NC_014569	A	12	4936	4947	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014569	ACCC	3	4978	4989	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
5	NC_014569	TAGA	3	5681	5692	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014569	GTTT	3	6273	6284	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	30932205
7	NC_014569	TTTC	3	7712	7723	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_014569	AT	7	7760	7772	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_014569	TAT	4	9525	9536	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30932209
10	NC_014569	TCT	4	11782	11793	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30932209
11	NC_014569	AT	6	12307	12319	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30932209
12	NC_014569	AGAA	3	13417	13427	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	30932209
13	NC_014569	AAAC	3	13494	13505	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	30932209
14	NC_014569	CA	7	13608	13620	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	30932209
15	NC_014569	T	12	14495	14506	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30932209
16	NC_014569	G	13	14512	14524	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	30932209
17	NC_014569	A	13	16095	16107	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30932209
18	NC_014569	TTTC	3	17194	17205	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	30932209
19	NC_014569	T	13	17745	17757	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30932209
20	NC_014569	T	14	18307	18320	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30932209
21	NC_014569	ATC	4	19084	19094	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30932209
22	NC_014569	TAAA	3	19367	19377	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30932209
23	NC_014569	CTTT	3	19430	19440	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30932209
24	NC_014569	TAAA	3	20381	20391	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30932209
25	NC_014569	CAA	4	21157	21169	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	30932209
26	NC_014569	AT	8	22245	22260	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30932209
27	NC_014569	TAA	4	22263	22273	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932209
28	NC_014569	AGAAA	3	22432	22446	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	30932209
29	NC_014569	AT	6	23270	23281	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30932209
30	NC_014569	ATA	4	23960	23971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932209
31	NC_014569	CTT	4	27337	27349	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	30932209
32	NC_014569	CATA	3	28987	28997	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	30932209
33	NC_014569	CT	7	29079	29092	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	30932209
34	NC_014569	ATC	4	29499	29509	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30932209
35	NC_014569	ATC	4	30889	30899	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30932209
36	NC_014569	TTTC	3	31433	31444	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	30932209
37	NC_014569	CTTT	3	31506	31516	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30932209
38	NC_014569	A	12	31850	31861	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30932209
39	NC_014569	A	13	31913	31925	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30932209
40	NC_014569	AAAAG	4	32701	32721	21	80 %	0 %	20 %	0 %	9 %	30932209
41	NC_014569	GCAAA	3	32890	32904	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	30932209
42	NC_014569	AAAG	4	33346	33361	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	30932209
43	NC_014569	A	15	34406	34420	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	30932209
44	NC_014569	GTT	4	34859	34870	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30932209
45	NC_014569	GCCA	3	35935	35946	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	30932209
46	NC_014569	AAG	4	36487	36498	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30932209
47	NC_014569	AGAA	3	36633	36644	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30932209
48	NC_014569	T	12	37653	37664	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30932209
49	NC_014569	TCGA	3	37916	37928	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	30932209
50	NC_014569	A	15	38395	38409	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	30932209
51	NC_014569	CT	6	38494	38507	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	30932209
52	NC_014569	TA	8	39285	39300	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30932209
53	NC_014569	CATA	3	39302	39313	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	30932209
54	NC_014569	A	14	39853	39866	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30932209
55	NC_014569	TAAT	3	39870	39882	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30932209
56	NC_014569	AAT	4	40078	40089	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932209
57	NC_014569	TATT	3	40341	40352	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30932209
58	NC_014569	TCAA	3	41461	41472	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	30932209
59	NC_014569	TAA	4	41856	41867	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932209
60	NC_014569	TA	6	43866	43876	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30932209
61	NC_014569	T	12	44919	44930	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30932209
62	NC_014569	TTTC	4	45296	45311	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	30932209
63	NC_014569	CTTT	3	45420	45430	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30932209
64	NC_014569	ATTT	3	45443	45455	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	30932209
65	NC_014569	T	15	46050	46064	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30932209
66	NC_014569	A	14	46259	46272	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30932209
67	NC_014569	TTTC	3	47114	47125	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	30932209
68	NC_014569	TAA	4	47190	47200	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30932209
69	NC_014569	CTT	4	47261	47272	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30932209
70	NC_014569	CAGA	3	47616	47627	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	30932209
71	NC_014569	CTGG	3	47812	47823	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	30932209
72	NC_014569	AAC	4	48889	48900	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30932209
73	NC_014569	T	12	49342	49353	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30932209
74	NC_014569	AAGT	3	51270	51280	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	30932209
75	NC_014569	TTC	4	52177	52188	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30932209
76	NC_014569	TTG	4	52231	52241	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	30932209
77	NC_014569	TCTT	3	52476	52486	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30932209
78	NC_014569	TC	6	53412	53423	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_014569	GACAAA	3	53430	53447	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
80	NC_014569	A	14	54645	54658	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_014569	TCTT	4	55587	55602	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
82	NC_014569	AAAG	3	55608	55619	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_014569	T	17	57883	57899	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	30932209
84	NC_014569	TTCA	3	61993	62004	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30932209
85	NC_014569	GAAT	3	62114	62124	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	30932209
86	NC_014569	GTT	4	62990	63001	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30932209
87	NC_014569	GATA	3	65863	65873	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	30932209
88	NC_014569	CATT	3	66401	66412	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30932209
89	NC_014569	A	15	66697	66711	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_014569	GTAA	3	66952	66963	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_014569	AATT	3	68127	68138	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_014569	AAGTG	3	68201	68214	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_014569	GAA	4	68256	68267	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_014569	TAGA	3	68671	68681	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_014569	T	15	68774	68788	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_014569	A	12	70531	70542	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014569	AGAAA	3	70720	70734	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_014569	AT	6	71558	71569	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_014569	CTTT	3	71916	71927	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014569	AAGG	3	72172	72184	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_014569	TAA	5	72420	72433	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_014569	CGAA	3	72652	72663	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_014569	TCT	4	73344	73354	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_014569	T	15	73643	73657	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_014569	T	15	73852	73866	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_014569	A	12	75904	75915	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_014569	GAA	4	76633	76643	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_014569	TTTC	3	77267	77277	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_014569	ATTCTT	3	77304	77320	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
110	NC_014569	ATA	4	79349	79360	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30932210
111	NC_014569	TGCA	3	81025	81037	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	30932210
112	NC_014569	TA	7	82918	82931	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_014569	AGAA	3	83006	83016	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_014569	GAAA	3	83142	83152	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_014569	T	15	83327	83341	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014569	CTTT	3	83577	83589	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
117	NC_014569	A	18	83784	83801	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
118	NC_014569	AAGG	3	83844	83856	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_014569	TGTT	3	85768	85778	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_014569	AG	6	85919	85929	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30932210
121	NC_014569	TTTC	3	86262	86273	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_014569	ATCC	3	86418	86429	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
123	NC_014569	CT	6	86542	86552	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
124	NC_014569	AGAA	3	86656	86666	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_014569	AAGC	3	87358	87368	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	30932210
126	NC_014569	TTTC	3	87760	87771	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	30932210
127	NC_014569	CAGA	3	88756	88767	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	30932210
128	NC_014569	TTTA	3	89395	89406	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_014569	TTTCA	3	89489	89503	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
130	NC_014569	GAAGG	3	89893	89906	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_014569	TCT	4	90803	90813	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30932211
132	NC_014569	ATG	4	92314	92324	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	30932211
133	NC_014569	C	14	93890	93903	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	30932211
134	NC_014569	TG	6	94249	94259	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	30932211
135	NC_014569	AAAGC	3	95789	95803	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
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178	NC_014569	AAG	4	130690	130700	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Erodium texanum plastid