ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tanystylum orbiculare mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014505	GTAA	3	99	111	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_014505	TAA	4	264	275	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30710162
3	NC_014505	TCT	5	350	364	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	30710162
4	NC_014505	ATT	4	579	589	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30710162
5	NC_014505	TTAC	3	960	971	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30710162
6	NC_014505	ATT	4	1039	1050	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710162
7	NC_014505	ATTAT	4	1238	1257	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_014505	CTTC	3	1630	1640	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	30710162
9	NC_014505	TAT	4	1643	1654	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710162
10	NC_014505	TTA	6	1897	1914	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30710162
11	NC_014505	TAT	4	2085	2095	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30710162
12	NC_014505	GAAA	3	2106	2116	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	30710162
13	NC_014505	TTAA	3	2831	2842	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30710162
14	NC_014505	ATT	4	2954	2965	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710162
15	NC_014505	TTAATT	3	3071	3088	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30710162
16	NC_014505	TATTTA	4	3702	3725	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710162
17	NC_014505	TAA	4	4031	4042	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30710162
18	NC_014505	AATT	3	4210	4221	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30710162
19	NC_014505	TAT	4	4368	4382	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30710162
20	NC_014505	AAT	4	4549	4560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30710162
21	NC_014505	ATT	4	4601	4612	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710162
22	NC_014505	TAA	4	4626	4637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30710162
23	NC_014505	TAA	4	4936	4946	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30710162
24	NC_014505	ATT	4	5116	5127	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710162
25	NC_014505	ATTA	3	5140	5150	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30710162
26	NC_014505	AATTT	3	5673	5687	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	30710163
27	NC_014505	ATA	4	6439	6450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30710163
28	NC_014505	TAT	4	6755	6767	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30710163
29	NC_014505	ATTAAT	3	7468	7485	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30710163
30	NC_014505	TAT	4	7494	7505	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710163
31	NC_014505	TAT	4	7695	7706	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710163
32	NC_014505	TAAA	3	7775	7785	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30710163
33	NC_014505	TATAA	3	7881	7894	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	30710163
34	NC_014505	TAAA	3	8070	8081	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30710163
35	NC_014505	TAAA	3	8136	8147	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30710163
36	NC_014505	AAT	4	8690	8700	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30710163
37	NC_014505	TA	6	8937	8947	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30710163
38	NC_014505	TAA	4	8994	9004	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30710163
39	NC_014505	TAT	7	9084	9104	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30710163
40	NC_014505	AAT	4	9278	9289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30710163
41	NC_014505	ATT	4	9399	9410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710163
42	NC_014505	TTA	4	9925	9936	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710163
43	NC_014505	ATT	4	9948	9959	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30710163
44	NC_014505	ATTT	3	10000	10010	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30710163
45	NC_014505	AATTTT	3	10468	10485	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30710163
46	NC_014505	AGA	4	10793	10803	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30710163
47	NC_014505	AATA	4	11355	11370	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	30710163
48	NC_014505	ATAAA	3	11929	11943	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	30710163
49	NC_014505	ATA	4	12028	12039	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30710163
50	NC_014505	AATT	3	12337	12348	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_014505	TAA	4	12746	12757	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_014505	TAAA	4	12814	12828	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_014505	TAT	4	13047	13058	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_014505	TTATAA	3	13224	13240	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_014505	TTAA	3	13319	13329	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_014505	AAATT	3	13388	13401	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_014505	TAA	4	13560	13571	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014505	TTAAA	3	13738	13752	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014505	ATA	4	13799	13810	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_014505	AATT	3	14075	14085	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_014505	TAT	4	14228	14239	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_014505	TAA	4	14312	14323	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_014505	TA	6	14477	14487	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_014505	TTAA	3	14558	14568	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tanystylum orbiculare mitochondrion