ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Physemacris variolosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014491	AAC	4	205	215	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	30696015
2	NC_014491	TTAA	3	424	434	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30696015
3	NC_014491	TTA	4	575	586	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30696015
4	NC_014491	TAT	4	1977	1988	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30696015
5	NC_014491	TAAA	3	2610	2620	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30696015
6	NC_014491	TA	6	3257	3267	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30696015
7	NC_014491	ATA	4	4082	4093	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696015
8	NC_014491	AAT	4	4225	4236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696015
9	NC_014491	TAAA	3	6284	6294	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30696015
10	NC_014491	A	14	6858	6871	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30696015
11	NC_014491	AAT	4	7289	7300	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696015
12	NC_014491	AAG	4	7404	7415	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30696015
13	NC_014491	TAA	4	8134	8144	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30696015
14	NC_014491	AT	7	8218	8230	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30696015
15	NC_014491	TAAA	3	8620	8631	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30696015
16	NC_014491	ATAA	4	8855	8871	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	30696015
17	NC_014491	A	14	9078	9091	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30696015
18	NC_014491	AG	6	9100	9111	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	30696015
19	NC_014491	AAAGAA	3	9233	9250	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	30696015
20	NC_014491	AAT	4	9533	9544	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696015
21	NC_014491	AAAT	3	9576	9587	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30696015
22	NC_014491	AAT	4	9902	9913	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696016
23	NC_014491	TA	6	10621	10632	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30696016
24	NC_014491	TAT	4	10907	10917	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30696016
25	NC_014491	CCCA	3	11709	11720	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	30696016
26	NC_014491	TAAAA	4	11755	11774	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	30696016
27	NC_014491	CAAAA	3	11954	11968	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	30696016
28	NC_014491	TTAATA	3	12500	12517	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30696016
29	NC_014491	AAAT	3	12614	12624	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_014491	TAAA	3	13549	13561	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_014491	AATA	3	13696	13707	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014491	TAAAT	4	14086	14105	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
33	NC_014491	ATTA	3	14501	14512	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014491	ATAA	3	14631	14642	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014491	TAAA	3	14732	14743	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_014491	TA	6	14872	14883	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_014491	AAAT	3	14957	14969	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_014491	CTC	4	15286	15297	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
39	NC_014491	AATT	3	15403	15413	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_014491	ATAAA	3	15539	15552	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_014491	AAC	6	15635	15652	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
42	NC_014491	TA	6	15669	15680	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_014491	TA	6	15945	15955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_014491	ATA	4	16042	16053	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_014491	AATT	4	16092	16107	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_014491	TA	6	16288	16298	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_014491	ATA	4	16386	16397	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_014491	AATT	4	16436	16451	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_014491	TA	6	16632	16642	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_014491	ATA	4	16729	16740	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_014491	AATT	4	16779	16794	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_014491	ATTA	3	16845	16855	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Physemacris variolosa mitochondrion