ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Radoszkowskius oculata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014485	TAA	4	764	775	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696006
2	NC_014485	ATT	4	1063	1074	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30696006
3	NC_014485	AGG	4	2179	2190	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	30696006
4	NC_014485	TAA	7	2904	2924	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	30696006
5	NC_014485	AAT	4	3243	3253	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30696006
6	NC_014485	ATA	5	4082	4096	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30696006
7	NC_014485	AAAT	3	4137	4148	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30696006
8	NC_014485	TAA	4	4241	4252	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696006
9	NC_014485	ATT	8	4384	4407	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30696006
10	NC_014485	TAA	4	4511	4522	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696006
11	NC_014485	ATA	4	4739	4752	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30696006
12	NC_014485	AAT	4	4798	4809	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30696006
13	NC_014485	TTATAT	3	5722	5739	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30696006
14	NC_014485	AT	6	5831	5841	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30696007
15	NC_014485	TAAAA	3	5851	5864	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	30696007
16	NC_014485	AATA	3	5866	5876	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30696007
17	NC_014485	ATT	4	6068	6079	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_014485	TAA	4	6277	6287	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_014485	ATAAA	4	6490	6508	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	30696007
20	NC_014485	TATAAA	3	6518	6534	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30696007
21	NC_014485	TAAA	3	6560	6571	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30696007
22	NC_014485	ATT	4	6638	6649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30696007
23	NC_014485	ATA	5	6714	6728	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30696007
24	NC_014485	TTAA	3	6729	6739	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30696007
25	NC_014485	ATAA	3	7039	7049	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30696007
26	NC_014485	C	12	7573	7584	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	30696007
27	NC_014485	AAAT	3	7974	7984	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30696007
28	NC_014485	A	12	8018	8029	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30696007
29	NC_014485	AAAT	3	8139	8150	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30696007
30	NC_014485	TAAAA	3	8290	8303	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	30696007
31	NC_014485	TAT	4	8527	8538	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30696007
32	NC_014485	TAAA	4	9002	9017	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	30696007
33	NC_014485	ATAA	3	9050	9062	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	30696007
34	NC_014485	CAAAA	3	9180	9194	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	30696007
35	NC_014485	AAAT	3	9320	9331	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30696007
36	NC_014485	CAA	4	9552	9562	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	30696007
37	NC_014485	ATA	5	9612	9626	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30696007
38	NC_014485	TTAA	3	9861	9871	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30696007
39	NC_014485	ACA	4	9879	9890	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30696007
40	NC_014485	AATAAA	3	9947	9964	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	30696007
41	NC_014485	TTTA	3	10017	10028	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30696007
42	NC_014485	A	16	10043	10058	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	30696007
43	NC_014485	ATA	4	10126	10136	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30696007
44	NC_014485	TAT	6	10656	10673	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30696007
45	NC_014485	CTA	4	11207	11218	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	30696007
46	NC_014485	AATA	3	11639	11651	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	30696007
47	NC_014485	ATA	4	11864	11876	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30696007
48	NC_014485	A	17	12219	12235	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	30696007
49	NC_014485	AAAT	3	12469	12479	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_014485	AAAT	4	12493	12508	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_014485	ATTC	4	12977	12992	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
52	NC_014485	ATTAA	3	13138	13152	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_014485	TAA	5	13168	13181	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_014485	AAC	4	13617	13627	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_014485	ATA	5	13993	14007	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_014485	TA	6	14372	14382	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_014485	ATAA	3	14557	14572	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_014485	AAT	5	14749	14762	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_014485	AAGA	3	14808	14818	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_014485	AT	6	15489	15499	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_014485	ATA	5	15590	15603	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_014485	AATAA	3	16017	16031	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_014485	AAAT	3	16491	16501	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_014485	ATA	5	16765	16779	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_014485	TA	6	17143	17153	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_014485	ATAA	3	17328	17343	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_014485	AAT	5	17520	17533	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_014485	TTA	4	17552	17562	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_014485	AAGA	3	17582	17593	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_014485	AT	6	18317	18327	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Radoszkowskius oculata mitochondrion