ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetranychus cinnabarinus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014399	TTAA	3	244	254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30263262
2	NC_014399	TATAA	3	279	292	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	30263262
3	NC_014399	TTGA	3	297	307	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	30263262
4	NC_014399	GAG	4	659	670	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	30263262
5	NC_014399	TAT	4	759	771	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30263262
6	NC_014399	AT	8	1189	1203	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30263262
7	NC_014399	TAA	4	1206	1217	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263262
8	NC_014399	TATG	3	1329	1340	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	30263262
9	NC_014399	ATAA	5	1528	1548	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30263262
10	NC_014399	AATTTT	3	1591	1609	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	30263262
11	NC_014399	TGAA	3	2107	2118	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014399	TTTTAA	3	2164	2182	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
13	NC_014399	TAAA	3	2432	2442	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_014399	TAA	5	2461	2475	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_014399	AAAAT	3	2512	2526	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_014399	TAAA	3	2545	2556	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014399	AATA	3	2638	2650	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_014399	A	12	3298	3309	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30263262
19	NC_014399	AAAAT	3	3400	3414	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	30263262
20	NC_014399	TTAA	3	3527	3537	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_014399	AAT	4	3538	3548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30263262
22	NC_014399	A	14	3615	3628	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30263262
23	NC_014399	TAT	4	3631	3642	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30263262
24	NC_014399	AAAG	3	3650	3660	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	30263262
25	NC_014399	ATTAAA	3	3746	3763	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30263262
26	NC_014399	AAAT	3	4034	4045	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30263262
27	NC_014399	T	12	4103	4114	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	30263262
28	NC_014399	A	12	4149	4160	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30263262
29	NC_014399	A	13	4181	4193	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30263262
30	NC_014399	A	15	4195	4209	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	30263262
31	NC_014399	TTGA	3	4299	4309	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	30263262
32	NC_014399	AT	9	4403	4419	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30263262
33	NC_014399	A	15	4420	4434	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30263262
34	NC_014399	A	22	4738	4759	22	100 %	0 %	0 %	0 %	9 %	30263262
35	NC_014399	AAAG	3	4801	4811	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	30263262
36	NC_014399	AAAAT	3	4822	4835	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	30263262
37	NC_014399	A	19	4852	4870	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	30263262
38	NC_014399	TAA	4	4881	4892	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263262
39	NC_014399	TAA	4	5038	5048	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30263263
40	NC_014399	TCATT	3	5605	5618	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	30263263
41	NC_014399	TAT	4	5733	5746	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30263263
42	NC_014399	A	12	5879	5890	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_014399	ATTA	3	5902	5913	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014399	ATTAA	3	5967	5981	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_014399	A	12	6326	6337	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_014399	GAAAA	3	6518	6533	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_014399	TAAA	3	6541	6552	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_014399	A	15	6726	6740	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30263263
49	NC_014399	ATAAAA	4	6950	6973	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	30263263
50	NC_014399	A	12	7101	7112	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30263263
51	NC_014399	A	16	7133	7148	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30263263
52	NC_014399	TTAA	3	7189	7201	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30263263
53	NC_014399	TAT	4	7850	7862	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30263263
54	NC_014399	TAA	4	8278	8289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
55	NC_014399	TATT	4	8769	8784	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	30263263
56	NC_014399	ATTT	3	8853	8864	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30263263
57	NC_014399	TAA	4	8866	8877	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
58	NC_014399	AAT	4	8881	8892	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
59	NC_014399	TAA	4	8964	8975	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
60	NC_014399	A	12	8971	8982	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30263263
61	NC_014399	T	17	9080	9096	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	30263263
62	NC_014399	ATA	4	9101	9112	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
63	NC_014399	AAAC	3	9140	9151	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	30263263
64	NC_014399	ATTT	4	9167	9182	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	30263263
65	NC_014399	T	12	9752	9763	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	30263263
66	NC_014399	T	12	9781	9792	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	30263263
67	NC_014399	AAT	4	9995	10006	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
68	NC_014399	AT	8	10110	10125	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30263263
69	NC_014399	AAAC	3	10261	10271	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	30263263
70	NC_014399	ATT	5	10371	10386	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30263263
71	NC_014399	T	13	10624	10636	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	30263263
72	NC_014399	TAA	4	10793	10803	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30263263
73	NC_014399	T	13	11170	11182	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30263263
74	NC_014399	TAA	5	11266	11281	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30263263
75	NC_014399	AAT	4	11690	11702	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30263263
76	NC_014399	AT	7	11761	11774	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30263263
77	NC_014399	TTTA	3	11842	11852	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30263263
78	NC_014399	ATAA	3	11853	11863	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30263263
79	NC_014399	TAT	5	11908	11923	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30263263
80	NC_014399	AAT	4	12131	12142	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
81	NC_014399	TA	6	12197	12209	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30263263
82	NC_014399	ATTT	3	12231	12242	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30263263
83	NC_014399	AAT	4	12388	12399	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30263263
84	NC_014399	T	12	12559	12570	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30263263
85	NC_014399	ATT	5	12752	12765	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30263263

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetranychus cinnabarinus mitochondrion