ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Teinopalpus aureus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014398	TTTAT	3	126	140	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014398	TAA	4	481	492	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30263261
3	NC_014398	TAA	4	697	708	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30263261
4	NC_014398	ATT	4	920	932	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	30263261
5	NC_014398	ATT	5	1023	1037	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	30263261
6	NC_014398	ATTT	3	1136	1147	12	25 %	75 %	0 %	8 %	30263261
7	NC_014398	T	12	1244	1255	12	0 %	100 %	0 %	8 %	30263261
8	NC_014398	TAAA	4	1381	1395	15	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_014398	AGG	4	2117	2128	12	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	30263261
10	NC_014398	ATA	8	2841	2864	24	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30263261
11	NC_014398	ATT	4	2889	2899	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	30263261
12	NC_014398	T	16	3910	3925	16	0 %	100 %	0 %	6 %	30263261
13	NC_014398	ATT	4	4110	4122	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	30263261
14	NC_014398	AATT	3	4215	4226	12	50 %	50 %	0 %	8 %	30263261
15	NC_014398	AATT	3	4383	4393	11	50 %	50 %	0 %	9 %	30263261
16	NC_014398	TTATT	3	4592	4607	16	20 %	80 %	0 %	6 %	30263261
17	NC_014398	TATT	3	5342	5353	12	25 %	75 %	0 %	8 %	30263261
18	NC_014398	TTTAA	4	5535	5554	20	40 %	60 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_014398	TAAA	3	6369	6380	12	75 %	25 %	0 %	0 %	30263261
20	NC_014398	TA	6	6435	6445	11	50 %	50 %	0 %	9 %	30263261
21	NC_014398	TA	6	6873	6883	11	50 %	50 %	0 %	9 %	30263261
22	NC_014398	A	13	6908	6920	13	100 %	0 %	0 %	7 %	30263261
23	NC_014398	TTA	4	7194	7205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	30263261
24	NC_014398	ATA	5	7299	7313	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	30263261
25	NC_014398	TAA	4	7737	7749	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	30263261
26	NC_014398	AGA	4	7840	7850	11	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30263261
27	NC_014398	A	13	7984	7996	13	100 %	0 %	0 %	0 %	30263261
28	NC_014398	TTAAA	4	8112	8130	19	60 %	40 %	0 %	10 %	30263261
29	NC_014398	ATA	4	8948	8960	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	30263261
30	NC_014398	AAAT	3	9032	9042	11	75 %	25 %	0 %	9 %	30263261
31	NC_014398	AAAAT	3	9121	9134	14	80 %	20 %	0 %	7 %	30263261
32	NC_014398	ATA	5	9178	9191	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	30263261
33	NC_014398	TAT	5	9380	9393	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	30263261
34	NC_014398	AT	6	9581	9593	13	50 %	50 %	0 %	7 %	30263262
35	NC_014398	ATA	4	9722	9733	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30263262
36	NC_014398	ATT	5	9864	9878	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_014398	TAT	4	10078	10089	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	30263262
38	NC_014398	TAA	5	10330	10344	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	30263262
39	NC_014398	ATTT	3	10983	10993	11	25 %	75 %	0 %	9 %	30263262
40	NC_014398	TAT	4	11431	11441	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	30263262
41	NC_014398	TTA	4	11476	11486	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	30263262
42	NC_014398	TAAT	3	11569	11580	12	50 %	50 %	0 %	0 %	30263262
43	NC_014398	ATAA	3	11729	11740	12	75 %	25 %	0 %	8 %	30263262
44	NC_014398	AAT	4	12052	12063	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30263262
45	NC_014398	TAA	4	12183	12195	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	30263262
46	NC_014398	TAA	4	12293	12303	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	30263262
47	NC_014398	ATA	4	12690	12701	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_014398	T	14	12894	12907	14	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_014398	AAATT	3	13083	13097	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014398	TTAAAT	3	13482	13500	19	50 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
51	NC_014398	AATT	3	13982	13992	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_014398	ATTA	3	14005	14016	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014398	TTAA	3	14171	14182	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_014398	AAATTT	3	14807	14823	17	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_014398	T	19	14869	14887	19	0 %	100 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_014398	AT	12	14886	14908	23	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_014398	TTAAA	3	14929	14943	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_014398	AATTT	3	14944	14958	15	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_014398	TTA	4	14961	14973	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_014398	AAAT	3	15069	15080	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_014398	AAAT	3	15117	15128	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_014398	AAT	4	15132	15143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_014398	AT	14	15157	15183	27	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014398	TAAT	3	15190	15201	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Teinopalpus aureus mitochondrion