ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phakopsora meibomiae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014352	AAGA	3	609	620	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014352	TAA	4	1549	1561	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_014352	AGA	4	1869	1880	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_014352	GTATA	3	3327	3341	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_014352	TAG	4	3465	3475	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_014352	CTA	4	3807	3817	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30135346
7	NC_014352	GATAA	3	3973	3986	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_014352	TATT	3	5204	5215	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	30135346
9	NC_014352	GAT	4	5298	5309	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	30135346
10	NC_014352	AGTG	3	5814	5824	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	30135346
11	NC_014352	AAG	4	5898	5912	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	30135346
12	NC_014352	TA	11	6471	6494	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014352	TAAAA	3	6708	6722	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_014352	TA	6	6732	6742	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_014352	CTAAG	11	6814	6868	55	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
16	NC_014352	TAAGTA	9	7142	7194	53	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_014352	AT	12	7272	7294	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_014352	TA	6	7297	7307	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_014352	TA	6	8671	8682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_014352	TAAG	3	8818	8830	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_014352	AT	6	9228	9239	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_014352	AT	6	9250	9261	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_014352	TAA	4	10107	10117	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135346
24	NC_014352	GTTTAT	3	10345	10362	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014352	TA	8	10494	10509	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_014352	GTAT	3	10538	10549	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_014352	TAAG	3	10909	10920	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_014352	CTTT	3	11661	11671	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30135346
29	NC_014352	TTG	4	11805	11816	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30135346
30	NC_014352	TA	7	11928	11941	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_014352	ATA	5	12037	12050	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_014352	TTCA	3	12231	12242	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_014352	AAT	4	12590	12601	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_014352	AG	6	12756	12766	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_014352	GAG	4	13325	13336	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	30135347
36	NC_014352	ACG	4	13419	13430	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30135347
37	NC_014352	AAT	4	14327	14337	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_014352	C	14	14360	14373	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
39	NC_014352	AT	12	14482	14504	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014352	TA	7	14719	14734	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_014352	TATAA	3	14740	14753	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_014352	AG	6	14778	14788	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_014352	TAA	4	15014	15025	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_014352	AAT	4	16967	16978	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135347
45	NC_014352	ATA	4	17404	17414	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135347
46	NC_014352	AGTG	3	18609	18620	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	30135347
47	NC_014352	AT	6	18729	18739	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135347
48	NC_014352	AG	6	19163	19173	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_014352	CGAA	3	19678	19689	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_014352	ATGA	3	20014	20026	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_014352	TAT	4	20151	20163	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_014352	C	15	20290	20304	15	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
53	NC_014352	ATG	4	20501	20511	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_014352	GA	8	20677	20691	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_014352	TAA	5	22119	22133	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30135347
56	NC_014352	GA	7	22585	22598	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	30135347
57	NC_014352	GATATA	3	23137	23154	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	30135347
58	NC_014352	ATA	4	24393	24405	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135347
59	NC_014352	GATATA	3	24733	24750	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	30135347
60	NC_014352	TA	6	25217	25227	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135347
61	NC_014352	GTTATA	3	25503	25521	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
62	NC_014352	AAT	4	25539	25550	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_014352	AT	14	25561	25588	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014352	ATA	4	25611	25622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_014352	AATATC	14	25624	25706	83	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
66	NC_014352	A	15	25722	25736	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_014352	GATAA	3	26089	26103	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014352	TA	7	26244	26256	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135347
69	NC_014352	ATA	4	26317	26327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135347
70	NC_014352	TA	6	26607	26619	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135347
71	NC_014352	GA	7	27099	27111	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_014352	GGTAA	3	28301	28314	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_014352	AT	6	28684	28694	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_014352	ATA	4	28876	28887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_014352	ATA	4	29134	29145	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_014352	TAT	4	29948	29959	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135347
77	NC_014352	AT	6	30250	30261	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135347
78	NC_014352	TAA	7	30267	30287	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135347
79	NC_014352	AAC	4	32329	32340	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Phakopsora meibomiae mitochondrion