ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gomphocerippus rufus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014349	ATA	4	362	372	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135342
2	NC_014349	AAT	4	1354	1365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_014349	ATTT	3	2458	2469	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30135342
4	NC_014349	TCAT	3	3099	3110	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30135342
5	NC_014349	TAT	4	3127	3138	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135342
6	NC_014349	TATTT	3	3907	3920	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	30135342
7	NC_014349	CTT	4	3953	3963	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30135342
8	NC_014349	ATT	4	4111	4123	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135342
9	NC_014349	ATTT	3	4366	4378	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	30135342
10	NC_014349	ATTT	3	4817	4829	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	30135342
11	NC_014349	TAA	4	6101	6111	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014349	AATC	3	6407	6419	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	30135342
13	NC_014349	TAAA	3	6435	6450	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	30135342
14	NC_014349	AAT	4	6866	6876	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135342
15	NC_014349	TAAA	3	7133	7143	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135342
16	NC_014349	TAA	4	7317	7328	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135342
17	NC_014349	AAG	4	7457	7468	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30135342
18	NC_014349	ATA	4	7551	7563	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135342
19	NC_014349	TAAA	3	7983	7993	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135342
20	NC_014349	AAAT	3	8734	8745	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135342
21	NC_014349	AAAAC	4	9191	9209	19	80 %	0 %	0 %	20 %	10 %	30135342
22	NC_014349	AAT	4	9595	9606	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135343
23	NC_014349	AAT	4	9974	9985	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135343
24	NC_014349	TAT	4	9982	9994	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135343
25	NC_014349	TTTA	3	10091	10102	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	30135343
26	NC_014349	ATT	4	10173	10184	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135343
27	NC_014349	ATA	5	10332	10346	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30135343
28	NC_014349	AGT	4	10364	10375	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	30135343
29	NC_014349	ATTC	3	11015	11026	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	30135343
30	NC_014349	ACC	4	11934	11945	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	30135343
31	NC_014349	ATA	4	12061	12071	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135343
32	NC_014349	TAA	4	12201	12213	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135343
33	NC_014349	TAAAA	3	12273	12286	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	30135343
34	NC_014349	AAT	4	12672	12683	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_014349	AAAT	3	12696	12707	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_014349	ATA	4	13471	13483	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_014349	TTA	5	13524	13537	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_014349	AAATT	3	13538	13551	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_014349	TAA	5	13709	13723	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_014349	TA	7	13770	13782	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_014349	TTTA	3	13831	13842	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_014349	AAT	4	13972	13982	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_014349	AATTA	5	14199	14222	24	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
44	NC_014349	ACA	4	14958	14969	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_014349	TCTTT	3	15048	15062	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
46	NC_014349	TAATA	3	15453	15467	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gomphocerippus rufus mitochondrion