Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Pteridium aquilinum subsp. aquilinum chloroplast
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S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Start | End | Tract Length | A% | T% | G% | C% | Imperfection % | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_014348 | CAAA | 3 | 4504 | 4514 | 11 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
2 | NC_014348 | TACT | 3 | 4740 | 4750 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
3 | NC_014348 | ATCC | 3 | 6901 | 6912 | 12 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 8 % | 30135333 |
4 | NC_014348 | TGAA | 3 | 6921 | 6932 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 0 % | 30135333 |
5 | NC_014348 | CAAA | 3 | 7299 | 7309 | 11 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
6 | NC_014348 | TTTA | 3 | 9038 | 9048 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 30135333 |
7 | NC_014348 | TTGC | 3 | 12133 | 12143 | 11 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
8 | NC_014348 | CTTT | 4 | 12414 | 12429 | 16 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 6 % | 30135333 |
9 | NC_014348 | TTTC | 3 | 18763 | 18774 | 12 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 8 % | 30135333 |
10 | NC_014348 | TGGA | 3 | 19141 | 19152 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
11 | NC_014348 | CATT | 3 | 20575 | 20585 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
12 | NC_014348 | TTAC | 3 | 29747 | 29757 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
13 | NC_014348 | ATCT | 4 | 31631 | 31646 | 16 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 6 % | 30135333 |
14 | NC_014348 | TAGA | 3 | 31660 | 31671 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 0 % | 30135333 |
15 | NC_014348 | AATA | 4 | 35087 | 35102 | 16 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 6 % | 30135333 |
16 | NC_014348 | CCTG | 3 | 37830 | 37840 | 11 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 9 % | 30135333 |
17 | NC_014348 | AAAC | 3 | 48906 | 48916 | 11 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
18 | NC_014348 | ATGA | 3 | 60193 | 60204 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
19 | NC_014348 | TAAA | 3 | 65633 | 65644 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
20 | NC_014348 | GTGG | 3 | 69829 | 69840 | 12 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
21 | NC_014348 | GTTT | 3 | 70524 | 70534 | 11 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 9 % | 30135333 |
22 | NC_014348 | TCTA | 3 | 78460 | 78472 | 13 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 7 % | 30135333 |
23 | NC_014348 | GTTC | 3 | 83088 | 83098 | 11 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
24 | NC_014348 | TTCC | 3 | 86817 | 86828 | 12 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 8 % | 30135333 |
25 | NC_014348 | GTTT | 3 | 87432 | 87443 | 12 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
26 | NC_014348 | GAAA | 3 | 100201 | 100211 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 30135333 |
27 | NC_014348 | TGGA | 3 | 101709 | 101720 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
28 | NC_014348 | TTTA | 3 | 102055 | 102066 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
29 | NC_014348 | AAAT | 3 | 106201 | 106212 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
30 | NC_014348 | CGAA | 3 | 106571 | 106581 | 11 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
31 | NC_014348 | TAAG | 3 | 107760 | 107770 | 11 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 9 % | 30135333 |
32 | NC_014348 | TGAA | 4 | 108804 | 108819 | 16 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 6 % | 30135333 |
33 | NC_014348 | AAAT | 3 | 109452 | 109463 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
34 | NC_014348 | AAAT | 3 | 114084 | 114094 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 30135333 |
35 | NC_014348 | AAAG | 3 | 114495 | 114506 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
36 | NC_014348 | AAAC | 3 | 114521 | 114532 | 12 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 0 % | 30135333 |
37 | NC_014348 | ATAA | 3 | 114917 | 114928 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
38 | NC_014348 | CCCA | 3 | 117692 | 117703 | 12 | 25 % | 0 % | 0 % | 75 % | 8 % | 30135333 |
39 | NC_014348 | AGAA | 3 | 120635 | 120646 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
40 | NC_014348 | TCTT | 3 | 120682 | 120692 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
41 | NC_014348 | TTTC | 3 | 123992 | 124002 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
42 | NC_014348 | TGTT | 3 | 124943 | 124954 | 12 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
43 | NC_014348 | ACCA | 3 | 125805 | 125816 | 12 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 8 % | 30135333 |
44 | NC_014348 | GTCT | 3 | 127554 | 127564 | 11 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
45 | NC_014348 | ATTT | 3 | 127788 | 127798 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 30135333 |
46 | NC_014348 | AATT | 3 | 131398 | 131409 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
47 | NC_014348 | AATT | 3 | 131846 | 131857 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
48 | NC_014348 | TCCA | 3 | 134978 | 134989 | 12 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 8 % | 30135333 |
49 | NC_014348 | TTTC | 3 | 136487 | 136497 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | 30135333 |
50 | NC_014348 | GAGG | 3 | 147278 | 147289 | 12 | 25 % | 0 % | 75 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
51 | NC_014348 | AGGT | 3 | 147490 | 147501 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
52 | NC_014348 | AAAC | 3 | 149255 | 149266 | 12 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 8 % | 30135333 |
53 | NC_014348 | GGAA | 3 | 149870 | 149881 | 12 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 8 % | 30135333 |
54 | NC_014348 | ATTA | 3 | 151407 | 151419 | 13 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 7 % | 30135333 |