ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pteridium aquilinum subsp. aquilinum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014348	ATC	4	1733	1743	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30135333
2	NC_014348	CAAA	3	4504	4514	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	30135333
3	NC_014348	TACT	3	4740	4750	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	30135333
4	NC_014348	TTATA	3	6172	6185	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	30135333
5	NC_014348	ATCC	3	6901	6912	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	30135333
6	NC_014348	TGAA	3	6921	6932	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	30135333
7	NC_014348	CAAA	3	7299	7309	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	30135333
8	NC_014348	AT	8	8609	8624	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30135333
9	NC_014348	TTTA	3	9038	9048	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30135333
10	NC_014348	TTGC	3	12133	12143	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	30135333
11	NC_014348	CTTT	4	12414	12429	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	30135333
12	NC_014348	CAG	4	13678	13689	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30135333
13	NC_014348	TCT	4	16188	16198	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30135333
14	NC_014348	GA	6	17350	17360	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30135333
15	NC_014348	TTTC	3	18763	18774	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	30135333
16	NC_014348	TGGA	3	19141	19152	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	30135333
17	NC_014348	CATT	3	20575	20585	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	30135333
18	NC_014348	C	12	22243	22254	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	30135333
19	NC_014348	T	15	22462	22476	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30135333
20	NC_014348	TC	6	23394	23405	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	30135333
21	NC_014348	AT	6	24172	24183	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
22	NC_014348	TCT	4	26331	26342	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30135333
23	NC_014348	TC	6	26421	26431	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	30135333
24	NC_014348	T	14	28466	28479	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	30135333
25	NC_014348	CTT	4	28992	29003	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30135333
26	NC_014348	A	12	29152	29163	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30135333
27	NC_014348	TTAC	3	29747	29757	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	30135333
28	NC_014348	TC	6	31494	31505	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	30135333
29	NC_014348	AG	6	31582	31593	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	30135333
30	NC_014348	ATCT	4	31631	31646	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	30135333
31	NC_014348	TAGA	3	31660	31671	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	30135333
32	NC_014348	AATA	4	35087	35102	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	30135333
33	NC_014348	CCTG	3	37830	37840	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	30135333
34	NC_014348	CAA	4	44107	44119	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	30135333
35	NC_014348	TA	7	45336	45349	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135333
36	NC_014348	TA	8	46588	46603	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30135333
37	NC_014348	ATC	4	48611	48623	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	30135333
38	NC_014348	AAAC	3	48906	48916	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	30135333
39	NC_014348	TAA	4	48998	49009	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135333
40	NC_014348	CGA	4	50218	50229	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30135333
41	NC_014348	TCTCAT	3	57716	57732	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	30135333
42	NC_014348	ATGA	3	60193	60204	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	30135333
43	NC_014348	AGCGA	3	62919	62933	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	30135333
44	NC_014348	TTA	4	64029	64041	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135333
45	NC_014348	A	12	64264	64275	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30135333
46	NC_014348	A	13	65041	65053	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30135333
47	NC_014348	TAAA	3	65633	65644	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135333
48	NC_014348	ATC	4	68886	68896	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30135333
49	NC_014348	GTGG	3	69829	69840	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	30135333
50	NC_014348	GTTT	3	70524	70534	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	30135333
51	NC_014348	AGT	4	72362	72372	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	30135333
52	NC_014348	GCA	4	72659	72670	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	30135333
53	NC_014348	CTT	4	78297	78307	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30135333
54	NC_014348	TCTA	3	78460	78472	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	30135333
55	NC_014348	TA	6	79026	79037	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
56	NC_014348	CT	6	82017	82028	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	30135333
57	NC_014348	GTTC	3	83088	83098	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	30135333
58	NC_014348	TAT	4	85259	85271	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135333
59	NC_014348	TTCC	3	86817	86828	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	30135333
60	NC_014348	T	13	87266	87278	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	30135333
61	NC_014348	GTTT	3	87432	87443	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	30135333
62	NC_014348	CT	6	91251	91261	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	30135333
63	NC_014348	AAG	4	99114	99125	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30135333
64	NC_014348	GAAA	3	100201	100211	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	30135333
65	NC_014348	TGGA	3	101709	101720	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	30135333
66	NC_014348	TTTA	3	102055	102066	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30135333
67	NC_014348	TCT	4	103678	103689	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30135333
68	NC_014348	AAAT	3	106201	106212	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135333
69	NC_014348	GAG	4	106298	106310	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	30135333
70	NC_014348	CGAA	3	106571	106581	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	30135333
71	NC_014348	GAA	4	107635	107646	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	30135333
72	NC_014348	AAC	4	107722	107733	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	30135333
73	NC_014348	TAAG	3	107760	107770	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	30135333
74	NC_014348	TGAA	4	108804	108819	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	30135333
75	NC_014348	AAAT	3	109452	109463	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135333
76	NC_014348	GTT	5	109925	109939	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	30135333
77	NC_014348	TTTCTA	3	109946	109963	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	30135333
78	NC_014348	A	12	111416	111427	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30135333
79	NC_014348	AT	6	111429	111440	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
80	NC_014348	TA	6	112130	112141	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
81	NC_014348	AAAT	3	114084	114094	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135333
82	NC_014348	AAAG	3	114495	114506	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30135333
83	NC_014348	AAAC	3	114521	114532	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	30135333
84	NC_014348	ATAA	3	114917	114928	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135333
85	NC_014348	GAA	4	115486	115498	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	30135333
86	NC_014348	CCCA	3	117692	117703	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	30135333
87	NC_014348	AGAA	3	120635	120646	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30135333
88	NC_014348	TCTT	3	120682	120692	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30135333
89	NC_014348	AAT	5	120967	120981	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30135333
90	NC_014348	CTT	4	121961	121971	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30135333
91	NC_014348	TTTC	3	123992	124002	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30135333
92	NC_014348	TGTT	3	124943	124954	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	30135333
93	NC_014348	ACCA	3	125805	125816	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	30135333
94	NC_014348	AT	6	126086	126096	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135333
95	NC_014348	AT	6	126308	126319	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
96	NC_014348	GTCT	3	127554	127564	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	30135333
97	NC_014348	ATTT	3	127788	127798	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30135333
98	NC_014348	TTC	4	129052	129063	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30135333
99	NC_014348	CTC	4	130392	130403	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	30135333
100	NC_014348	AATT	3	131398	131409	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
101	NC_014348	AATT	3	131846	131857	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
102	NC_014348	TCCA	3	134978	134989	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	30135333
103	NC_014348	TTTC	3	136487	136497	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	30135333
104	NC_014348	TCT	4	137573	137583	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	30135333
105	NC_014348	AG	6	145437	145447	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	30135333
106	NC_014348	GAGG	3	147278	147289	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	30135333
107	NC_014348	AGGT	3	147490	147501	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	30135333
108	NC_014348	AAAC	3	149255	149266	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	30135333
109	NC_014348	A	14	149422	149435	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30135333
110	NC_014348	GGAA	3	149870	149881	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	30135333
111	NC_014348	AT	6	150571	150582	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
112	NC_014348	ATTA	3	151407	151419	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135333
113	NC_014348	ATA	4	151427	151439	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135333

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pteridium aquilinum subsp. aquilinum chloroplast