ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Floydiella terrestris chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014346	TCTTTT	3	2704	2721	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014346	ACAAAA	3	10508	10526	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
3	NC_014346	AAAAGA	3	12475	12492	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_014346	AAAAAC	3	15122	15139	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
5	NC_014346	AGAAAA	3	18944	18961	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_014346	TTCTTT	3	25731	25749	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
7	NC_014346	TCAAAA	5	38838	38867	30	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014346	AAAAGC	3	44343	44361	19	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
9	NC_014346	TCTTTT	5	46074	46104	31	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
10	NC_014346	AGAAAA	3	51392	51409	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_014346	AAAAAG	3	64267	64285	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
12	NC_014346	ATTTTG	5	66037	66066	30	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_014346	TGACTT	3	68959	68976	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
14	NC_014346	TCTTTT	5	71803	71832	30	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014346	AAAGAA	4	75257	75280	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	4 %	Non-Coding
16	NC_014346	AAAGAA	5	80828	80857	30	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	3 %	Non-Coding
17	NC_014346	CTTTTT	5	81829	81858	30	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	3 %	Non-Coding
18	NC_014346	GAATTT	3	83670	83687	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014346	TCAAAA	11	86497	86562	66	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014346	AAAAGG	4	102125	102148	24	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	4 %	Non-Coding
21	NC_014346	TTTTCT	4	104267	104290	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014346	TCAAAA	5	109402	109431	30	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014346	TCTTTT	7	113783	113824	42	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	4 %	Non-Coding
24	NC_014346	AAAATG	3	119260	119277	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_014346	AAAAGG	8	119260	119307	48	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014346	CAAAAA	3	120729	120746	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014346	TCAAAA	9	131272	131325	54	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014346	ATTTTC	3	141847	141865	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	30432296
29	NC_014346	AAAAAG	3	160446	160463	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_014346	AGAAAA	4	162002	162025	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_014346	TCTTTT	3	163181	163198	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
32	NC_014346	CCTCTT	4	167597	167620	24	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_014346	CTTTTT	4	167615	167638	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
34	NC_014346	AGAAAA	3	167638	167655	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_014346	TTTCTT	3	172456	172473	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432297
36	NC_014346	GAAAAG	3	173657	173674	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	30432297
37	NC_014346	AAAAGA	6	186747	186782	36	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	30432297
38	NC_014346	TCTTTT	4	195471	195494	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	4 %	30432297
39	NC_014346	ATTTTT	3	196222	196239	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	30432297
40	NC_014346	TCAAAA	3	203699	203716	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	30432297
41	NC_014346	CCTTTT	3	206953	206969	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	30432297
42	NC_014346	TTCTTT	3	207869	207887	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	30432297
43	NC_014346	AAAAAC	3	208154	208172	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	30432297
44	NC_014346	TCTTTT	4	211749	211772	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	4 %	30432297
45	NC_014346	GAAAAA	3	218288	218305	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	30432297
46	NC_014346	CTTTTT	3	218410	218427	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432297
47	NC_014346	TCAAAA	3	220104	220121	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	30432297
48	NC_014346	TCTTTT	3	224130	224147	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432297
49	NC_014346	TCAAAA	3	228144	228161	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	30432297
50	NC_014346	ATCAAA	3	233400	233417	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	30432297
51	NC_014346	AAAAAG	3	247300	247318	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	30432297
52	NC_014346	TACGTT	3	253219	253236	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	30432297
53	NC_014346	TCAAAA	3	259274	259292	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	30432297
54	NC_014346	TCTTTT	3	270552	270569	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432297
55	NC_014346	TCTTTT	3	274340	274358	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432297
56	NC_014346	AAAAGA	3	276703	276721	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	30432297
57	NC_014346	TTTTGA	5	304468	304497	30	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	30432297
58	NC_014346	TTTTCT	6	313741	313776	36	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	30432297
59	NC_014346	TTTTGA	3	320157	320174	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	30432297
60	NC_014346	TTTTGA	5	320480	320509	30	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	30432297
61	NC_014346	AGGAAA	7	322932	322973	42	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30432297
62	NC_014346	AGCAAA	3	327898	327915	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	30432297
63	NC_014346	CAAAAA	4	330763	330786	24	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	0 %	30432297
64	NC_014346	GGTTCG	5	336305	336334	30	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	6 %	30432297
65	NC_014346	GTTCGG	3	338062	338079	18	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	5 %	30432297
66	NC_014346	AAAAGA	3	338425	338443	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	30432297
67	NC_014346	GAAAAG	3	340386	340403	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	30432297
68	NC_014346	TTTTTG	5	344732	344761	30	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	30432297
69	NC_014346	TCTTTT	4	359921	359944	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	30432297
70	NC_014346	TCTTTT	5	360035	360064	30	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	3 %	30432297
71	NC_014346	TGTTTT	3	360434	360452	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	30432297
72	NC_014346	TTTTGA	4	362531	362554	24	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	30432297
73	NC_014346	GAAAAG	17	366036	366137	102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	30432297
74	NC_014346	TTTTTC	3	382770	382787	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432297
75	NC_014346	TTTTGA	3	391501	391518	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	30432297
76	NC_014346	AAAAAG	4	394394	394417	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	0 %	30432297
77	NC_014346	TTCAAA	3	403628	403646	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
78	NC_014346	TCCTTT	4	405416	405439	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	Non-Coding
79	NC_014346	GAACCC	3	406897	406914	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	5 %	Non-Coding
80	NC_014346	GAACCC	3	414709	414726	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	5 %	30432299
81	NC_014346	GAACCC	3	414919	414936	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	5 %	30432299
82	NC_014346	TTTTTC	3	415217	415234	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432299
83	NC_014346	TTTTGA	5	424246	424275	30	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014346	AAAGAA	3	433190	433208	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	30432299
85	NC_014346	AAAACA	6	434966	435001	36	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	30432299
86	NC_014346	AACAAA	3	435022	435039	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	30432299
87	NC_014346	TCTTTT	6	446103	446138	36	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	2 %	Non-Coding
88	NC_014346	CTTTTT	5	459228	459260	33	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
89	NC_014346	TTTTCT	3	459937	459954	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
90	NC_014346	TTTTTC	3	460698	460715	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
91	NC_014346	AAAAAG	3	462252	462269	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014346	TTTCTC	3	478279	478296	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	30432300
93	NC_014346	TTTTTC	3	478667	478683	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30432300
94	NC_014346	AAAAAG	4	481998	482022	25	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	30432300
95	NC_014346	AGAAAA	7	482822	482863	42	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	9 %	30432300
96	NC_014346	AGAAAA	3	496728	496745	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_014346	AGAGAA	3	497867	497884	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
98	NC_014346	TTTCTT	4	503058	503081	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014346	AAAAAG	5	505774	505803	30	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014346	AAAGAA	3	507406	507423	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
101	NC_014346	AAAGAA	4	519068	519091	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_014346	TCTTTT	3	519383	519399	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Floydiella terrestris chloroplast