Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Alveolata sp. CCMP3155 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014345TTTG318361846110 %75 %25 %0 %9 %30150092
2NC_014345CAA4203420441166.67 %0 %0 %33.33 %9 %30150093
3NC_014345AGA4204820591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30150093
4NC_014345CTAT3331533251125 %50 %0 %25 %9 %30150093
5NC_014345CAG4433643471233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %30150093
6NC_014345GCT444134424120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %30150093
7NC_014345AAT4550155121266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30150093
8NC_014345GCT474887500130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %30150093
9NC_014345AGAT3769477051250 %25 %25 %0 %8 %30150093
10NC_014345GTT41767817690130 %66.67 %33.33 %0 %7 %30150094
11NC_014345CTCG31865218662110 %25 %25 %50 %9 %30150094
12NC_014345AAAG323385233961275 %0 %25 %0 %8 %30150094
13NC_014345TCC42361723629130 %33.33 %0 %66.67 %7 %30150094
14NC_014345AGA424803248131166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
15NC_014345TCAT327181271931325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
16NC_014345TCCC32725027260110 %25 %0 %75 %9 %30150095
17NC_014345CAC532673326871533.33 %0 %0 %66.67 %6 %30150095
18NC_014345GA633968339791250 %0 %50 %0 %8 %30150095
19NC_014345GAG436535365461233.33 %0 %66.67 %0 %8 %30150096
20NC_014345TTG44121741228120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
21NC_014345AGTT342877428881225 %50 %25 %0 %8 %30150097
22NC_014345ACAT344888448991250 %25 %0 %25 %8 %30150097
23NC_014345ACA445693457041266.67 %0 %0 %33.33 %8 %30150097
24NC_014345CTGT34681746828120 %50 %25 %25 %8 %30150097
25NC_014345TC64941649426110 %50 %0 %50 %9 %30150098
26NC_014345CTTG35143851449120 %50 %25 %25 %8 %30150098
27NC_014345TCT45224952260120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30150098
28NC_014345ATA454381543921266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_014345TCT45471354724120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30150098
30NC_014345AGC454982549931233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %30150098
31NC_014345CTT45649056501120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30150098
32NC_014345TTCT35662356634120 %75 %0 %25 %8 %30150098
33NC_014345GAACC359800598141540 %0 %20 %40 %6 %30150099
34NC_014345AAAG361367613791375 %0 %25 %0 %7 %30150099
35NC_014345TAGC361848618591225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
36NC_014345ACG462140621501133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
37NC_014345CTAG462417624311525 %25 %25 %25 %6 %Non-Coding
38NC_014345CCAA370260702711250 %0 %0 %50 %0 %30150099
39NC_014345TCAAG371820718341540 %20 %20 %20 %6 %30150099
40NC_014345AGAA372160721711275 %0 %25 %0 %8 %30150099
41NC_014345GACA380957809671150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
42NC_014345CCTT38112481134110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
43NC_014345AGCT381328813381125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
44NC_014345CGT48160781617110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
45NC_014345GCTA381898819091225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
46NC_014345GGTTC38394383957150 %40 %40 %20 %6 %30150100
47NC_014345GAA484819848311366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding