ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phakopsora pachyrhizi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014344	AGA	4	1914	1925	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014344	AGA	4	3511	3523	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_014344	CTA	4	4232	4242	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30135330
4	NC_014344	TAT	4	6624	6636	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_014344	ATA	4	8505	8516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014344	AAG	4	8616	8626	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_014344	ATA	4	8858	8868	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_014344	TAT	4	9092	9103	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135330
9	NC_014344	TAA	4	11658	11669	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_014344	GGA	4	12469	12480	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_014344	ATT	4	15440	15451	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135331
12	NC_014344	TAT	4	19452	19464	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_014344	TGG	4	20556	20568	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	30135331
14	NC_014344	TAT	5	20789	20803	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	30135331
15	NC_014344	AAT	4	21305	21316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135331
16	NC_014344	TAA	4	23672	23685	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135331
17	NC_014344	ATA	4	24909	24919	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_014344	AGA	4	25191	25202	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_014344	ATA	4	25421	25431	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135331
20	NC_014344	TTA	4	25500	25511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135331
21	NC_014344	GTA	4	26524	26535	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	30135331
22	NC_014344	TAT	5	27720	27733	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_014344	TAT	5	28030	28044	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_014344	TAT	4	29130	29141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135331
25	NC_014344	CTA	4	29158	29169	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	30135331
26	NC_014344	TAA	7	29449	29469	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135331
27	NC_014344	AAT	4	31517	31528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_014344	ATA	4	31554	31565	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phakopsora pachyrhizi mitochondrion