ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phakopsora pachyrhizi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014344	AT	6	1356	1366	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_014344	AGA	4	1914	1925	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_014344	TA	7	2809	2821	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_014344	AGTATC	5	3016	3045	30	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	6 %	Non-Coding
5	NC_014344	AT	6	3120	3130	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_014344	TA	33	3141	3204	64	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_014344	AGA	4	3511	3523	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_014344	AT	6	3547	3557	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_014344	AT	6	3587	3597	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_014344	CTA	4	4232	4242	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30135330
11	NC_014344	TA	6	4336	4346	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014344	TAGTA	4	5791	5809	19	40 %	40 %	20 %	0 %	5 %	30135330
13	NC_014344	AGTG	3	5947	5957	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	30135330
14	NC_014344	TAT	4	6624	6636	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_014344	AGCTA	3	6907	6921	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
16	NC_014344	TA	7	7085	7097	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_014344	AT	8	7107	7121	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_014344	AGTACT	4	7977	8000	24	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	8 %	30135330
19	NC_014344	AATACT	3	8344	8361	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
20	NC_014344	TAAAAC	3	8367	8390	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	4 %	Non-Coding
21	NC_014344	ATA	4	8505	8516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_014344	AAG	4	8616	8626	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014344	AT	6	8684	8697	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_014344	AT	6	8745	8755	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_014344	AGAT	3	8758	8769	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014344	AT	7	8820	8832	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_014344	ATA	4	8858	8868	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_014344	TAT	4	9092	9103	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135330
29	NC_014344	TA	6	9922	9932	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_014344	TA	7	10004	10016	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_014344	TA	7	10088	10101	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_014344	AAGTAG	3	10192	10209	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_014344	AT	6	11545	11555	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_014344	TAA	4	11658	11669	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_014344	AT	6	12027	12037	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_014344	TA	6	12068	12078	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_014344	TA	6	12174	12184	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_014344	GGA	4	12469	12480	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_014344	AT	6	14297	14307	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_014344	TA	6	14762	14773	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_014344	GT	6	14925	14936	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_014344	ATT	4	15440	15451	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135331
43	NC_014344	GTAG	3	17472	17484	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	30135331
44	NC_014344	AT	6	18072	18082	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135331
45	NC_014344	AG	6	18487	18497	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_014344	CGAA	3	18983	18994	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_014344	ATGA	3	19315	19327	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_014344	TAT	4	19452	19464	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_014344	AG	6	19887	19897	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_014344	TGG	4	20556	20568	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	30135331
51	NC_014344	TAT	5	20789	20803	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	30135331
52	NC_014344	AAT	4	21305	21316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135331
53	NC_014344	AT	7	22390	22403	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135331
54	NC_014344	TAA	4	23672	23685	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135331
55	NC_014344	AGTGT	3	23694	23707	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	30135331
56	NC_014344	AT	9	24077	24093	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30135331
57	NC_014344	AT	7	24122	24135	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135331
58	NC_014344	GATATA	3	24241	24258	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	30135331
59	NC_014344	AT	12	24264	24286	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135331
60	NC_014344	TA	6	24692	24702	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135331
61	NC_014344	ATA	4	24909	24919	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_014344	AGA	4	25191	25202	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_014344	TA	7	25348	25360	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135331
64	NC_014344	ATA	4	25421	25431	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135331
65	NC_014344	TTA	4	25500	25511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135331
66	NC_014344	TA	6	25702	25714	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135331
67	NC_014344	TGTATC	3	25904	25921	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014344	GA	7	26453	26465	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_014344	GTA	4	26524	26535	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	30135331
70	NC_014344	AGATA	14	27589	27656	68	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_014344	TAT	5	27720	27733	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_014344	TAT	5	28030	28044	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_014344	TA	6	28198	28208	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_014344	TA	6	28323	28333	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_014344	AT	6	28358	28371	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_014344	TA	11	28359	28381	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_014344	AT	7	28698	28711	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_014344	AT	6	28789	28800	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_014344	TG	6	28899	28909	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_014344	TAT	4	29130	29141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135331
81	NC_014344	CTA	4	29158	29169	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	30135331
82	NC_014344	TA	6	29428	29438	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135331
83	NC_014344	TAA	7	29449	29469	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135331
84	NC_014344	CTTCT	19	31226	31319	94	0 %	60 %	0 %	40 %	1 %	Non-Coding
85	NC_014344	TGAG	3	31350	31361	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_014344	AAT	4	31517	31528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_014344	ATA	4	31554	31565	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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