ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Proteromonas lacertae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014338	ATTT	3	22	32	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_014338	ACT	4	73	83	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_014338	AAAAT	3	366	380	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	30135320
4	NC_014338	TAA	4	880	890	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135320
5	NC_014338	TTAA	3	1015	1026	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135320
6	NC_014338	ATAA	3	1326	1336	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135320
7	NC_014338	TAAAAC	3	1353	1370	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	30135320
8	NC_014338	ATA	4	1452	1463	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135320
9	NC_014338	AAAT	3	1532	1542	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135320
10	NC_014338	TAT	4	1661	1672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135320
11	NC_014338	TAA	4	1785	1795	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135320
12	NC_014338	TAA	4	1893	1903	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135320
13	NC_014338	TAA	4	2103	2113	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135320
14	NC_014338	TAA	4	2199	2210	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135320
15	NC_014338	AAAT	3	2558	2568	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135320
16	NC_014338	TAT	4	2660	2671	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135320
17	NC_014338	ATA	4	2887	2898	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_014338	ATTA	3	2899	2910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_014338	AAAAC	3	2967	2981	15	80 %	0 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014338	TAA	4	3177	3188	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	30135320
21	NC_014338	TAA	4	3227	3238	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135320
22	NC_014338	AAAT	3	4826	4836	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014338	TAT	4	5600	5610	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_014338	TTAT	3	5798	5809	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_014338	CAAA	3	5841	5853	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
26	NC_014338	ATA	4	5878	5888	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_014338	ATAG	3	7697	7708	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_014338	ATT	4	7784	7796	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_014338	ATT	5	8296	8309	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_014338	TAA	4	9027	9037	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135321
31	NC_014338	ATATA	3	9044	9058	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	30135321
32	NC_014338	AAT	4	9105	9116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135321
33	NC_014338	TAA	5	9360	9374	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	30135321
34	NC_014338	TAA	4	9755	9767	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135321
35	NC_014338	ATAA	3	10029	10040	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30135321
36	NC_014338	ATA	4	10640	10651	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135321
37	NC_014338	TAA	4	11081	11092	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135321
38	NC_014338	TTA	4	11107	11118	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135321
39	NC_014338	TTTA	3	11208	11218	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30135321
40	NC_014338	TTTTAT	3	11805	11822	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	30135321
41	NC_014338	T	14	11893	11906	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135321
42	NC_014338	ATA	7	12025	12046	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135321
43	NC_014338	TAA	4	12453	12464	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135321
44	NC_014338	ATA	4	13061	13071	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135321
45	NC_014338	ATAA	3	13098	13109	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30135321
46	NC_014338	CAA	4	13127	13138	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30135321
47	NC_014338	AATAT	3	13416	13429	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	30135321
48	NC_014338	TAA	5	13477	13491	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30135321
49	NC_014338	TAAATT	3	13743	13760	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30135321
50	NC_014338	ATTT	3	14376	14387	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30135321
51	NC_014338	TAT	4	14597	14609	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135321
52	NC_014338	CTTTT	3	15368	15381	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	30135321
53	NC_014338	TAA	4	15589	15599	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135321
54	NC_014338	AAAG	4	16391	16406	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	30135321
55	NC_014338	AAT	4	16591	16602	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135321
56	NC_014338	ACA	4	16750	16761	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	30135321
57	NC_014338	ATA	5	17194	17207	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135321
58	NC_014338	AT	6	17211	17222	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135321
59	NC_014338	AAATT	3	17267	17282	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	30135321
60	NC_014338	TAT	4	17414	17425	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135321
61	NC_014338	ATT	4	17820	17830	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135322
62	NC_014338	TAAA	3	18784	18795	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30135322
63	NC_014338	TAAA	3	18868	18878	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135322
64	NC_014338	ATT	5	19267	19281	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30135322
65	NC_014338	TAAAAT	3	19365	19383	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30135322
66	NC_014338	TAAAAT	3	19456	19474	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	30135322
67	NC_014338	ATT	4	19487	19497	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135322
68	NC_014338	AATTTA	3	20182	20199	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30135322
69	NC_014338	ATAA	4	20280	20294	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	30135322
70	NC_014338	ATT	4	20358	20369	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135322
71	NC_014338	AAATAT	3	20396	20412	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30135322
72	NC_014338	TAA	4	20606	20616	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135322
73	NC_014338	TTTTA	3	21538	21552	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	30135322
74	NC_014338	TAA	4	22055	22066	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135322
75	NC_014338	ATT	4	22506	22517	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135322
76	NC_014338	T	13	22568	22580	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	30135322
77	NC_014338	ATTT	3	23175	23185	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30135322
78	NC_014338	TAT	5	23240	23253	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135322
79	NC_014338	ATTTT	3	23359	23372	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	30135322
80	NC_014338	ATTTT	4	23401	23419	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	30135322
81	NC_014338	ATTTT	4	24030	24048	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	30135322
82	NC_014338	ATA	4	24360	24370	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_014338	TAT	6	24384	24400	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_014338	AT	9	24412	24429	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_014338	TTGT	3	24503	24514	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_014338	A	15	25494	25508	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30135322
87	NC_014338	AAATAT	3	25536	25554	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30135322
88	NC_014338	AAAAT	3	25565	25580	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	30135322
89	NC_014338	TAAA	3	25677	25687	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135322
90	NC_014338	AAAATT	3	25735	25753	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	30135322
91	NC_014338	ATATTA	3	25903	25920	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30135323
92	NC_014338	ATA	4	26054	26065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135323
93	NC_014338	TAA	7	26103	26123	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135323
94	NC_014338	AAAT	3	26220	26231	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135323
95	NC_014338	TAT	4	26317	26328	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135323
96	NC_014338	AAAT	3	26373	26383	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135323
97	NC_014338	ATTT	3	26561	26572	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30135323
98	NC_014338	ATA	4	26609	26621	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135323
99	NC_014338	CAAA	3	26957	26967	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	30135323
100	NC_014338	TAAA	3	27035	27045	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135323
101	NC_014338	TAAA	3	27078	27089	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135323
102	NC_014338	TTAA	3	27229	27239	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135323
103	NC_014338	ATT	4	27581	27591	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135323
104	NC_014338	AATT	3	27605	27616	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135323
105	NC_014338	ATT	4	27636	27647	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135323
106	NC_014338	TAA	7	27860	27881	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135323
107	NC_014338	AATTTA	3	28141	28159	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	30135323
108	NC_014338	ATA	4	28205	28215	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135323
109	NC_014338	ATA	4	28292	28303	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135323
110	NC_014338	ATT	4	28409	28423	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30135323
111	NC_014338	TAATT	3	28541	28555	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	30135323
112	NC_014338	TA	6	28658	28668	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135323
113	NC_014338	ATA	5	28787	28800	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30135323
114	NC_014338	TAA	7	28959	28979	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135323
115	NC_014338	TAT	5	29273	29286	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135323
116	NC_014338	TTTA	3	29292	29303	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30135323
117	NC_014338	ATT	5	29531	29545	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30135323
118	NC_014338	TAA	4	29565	29576	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135323
119	NC_014338	AAAT	3	29663	29673	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135323
120	NC_014338	ATA	4	29787	29797	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135323
121	NC_014338	TTTAAA	3	29889	29906	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30135323
122	NC_014338	ATT	4	29933	29945	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135323
123	NC_014338	AAT	4	29962	29972	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135323
124	NC_014338	TAT	4	30305	30315	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135323
125	NC_014338	A	12	30540	30551	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30135323
126	NC_014338	TAAA	3	30708	30720	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	30135323
127	NC_014338	GGGTAA	3	30936	30953	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	30135323
128	NC_014338	TAT	4	31117	31128	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135323
129	NC_014338	GTTT	3	32558	32569	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	30135323
130	NC_014338	AT	7	32699	32711	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135323
131	NC_014338	CAAT	3	32818	32829	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	30135323
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136	NC_014338	CAAT	3	35137	35148	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	30135323
137	NC_014338	TTTA	3	35554	35565	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	30135323
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158	NC_014338	TAT	4	42776	42786	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
159	NC_014338	ATA	4	43054	43064	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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179	NC_014338	AGT	4	48581	48591	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
180	NC_014338	TAAA	5	48631	48650	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Proteromonas lacertae mitochondrion