ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Apis cerana mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014295	TCTA	3	259	269	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_014295	A	22	313	334	22	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
3	NC_014295	TAA	10	364	394	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_014295	AAT	6	395	412	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_014295	AAT	4	415	426	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014295	ATTA	3	840	851	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982915
7	NC_014295	ATTT	3	874	885	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982915
8	NC_014295	TAT	4	891	903	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982915
9	NC_014295	ATTT	3	1072	1083	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982915
10	NC_014295	ATTT	3	1251	1261	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982915
11	NC_014295	TAT	4	1263	1275	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982915
12	NC_014295	AAT	5	1497	1511	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	29982915
13	NC_014295	AATT	3	1516	1527	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982915
14	NC_014295	AAAATT	3	1858	1876	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_014295	AATT	3	2124	2135	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29989091
16	NC_014295	CTTC	3	2199	2209	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29989091
17	NC_014295	TAT	4	2218	2229	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29989091
18	NC_014295	ATA	4	2391	2402	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29989091
19	NC_014295	ATTT	3	2427	2438	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29989091
20	NC_014295	TAT	4	2509	2519	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29989091
21	NC_014295	TTA	4	2917	2927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29989091
22	NC_014295	ATT	4	3291	3302	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29989091
23	NC_014295	AATT	3	3586	3596	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_014295	TAA	4	3692	3703	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982916
25	NC_014295	TTA	4	3701	3712	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982916
26	NC_014295	TAT	4	3728	3740	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982916
27	NC_014295	ATT	4	3820	3833	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982916
28	NC_014295	AATT	3	4140	4151	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982916
29	NC_014295	TAA	4	4303	4313	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_014295	ATT	5	4800	4814	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29982916
31	NC_014295	CTTTAT	3	4903	4920	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	29982916
32	NC_014295	AATT	4	5029	5045	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29982916
33	NC_014295	AATCT	3	5254	5267	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	29982916
34	NC_014295	TTTTTG	3	5556	5574	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	29982916
35	NC_014295	ATTT	6	6036	6059	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982916
36	NC_014295	AT	18	6107	6140	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_014295	AT	6	6186	6196	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982916
38	NC_014295	ATT	4	6405	6415	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982916
39	NC_014295	TTAA	3	6545	6556	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982916
40	NC_014295	ATT	4	7123	7133	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982916
41	NC_014295	AAT	4	7135	7146	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982916
42	NC_014295	TAT	4	7230	7242	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982916
43	NC_014295	TA	6	8181	8191	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982916
44	NC_014295	AAAT	3	8215	8226	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29982916
45	NC_014295	ATCT	3	8250	8261	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	29982916
46	NC_014295	TAAA	3	8450	8460	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29982916
47	NC_014295	AATA	5	8700	8720	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29982916
48	NC_014295	TAAAAT	4	8738	8761	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982916
49	NC_014295	TAA	5	9139	9153	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	29982916
50	NC_014295	AAAT	3	9296	9307	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	29982916
51	NC_014295	TAAA	4	9335	9350	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	29982916
52	NC_014295	ATTT	3	9368	9378	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982916
53	NC_014295	TTAATC	3	9394	9411	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	29982916
54	NC_014295	AT	6	9429	9439	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982916
55	NC_014295	ATT	4	9606	9617	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982916
56	NC_014295	ATAAA	3	9878	9897	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	29982916
57	NC_014295	TTAA	3	9899	9910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982916
58	NC_014295	AAAT	3	10123	10133	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29982916
59	NC_014295	TAA	4	10358	10368	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_014295	ATTAAA	3	10650	10667	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	29982916
61	NC_014295	ATA	4	11197	11209	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982917
62	NC_014295	ATTTT	5	11616	11639	24	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	29982917
63	NC_014295	TAA	4	11842	11852	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982917
64	NC_014295	TAA	4	11855	11867	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982917
65	NC_014295	TTA	4	11915	11925	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982917
66	NC_014295	AAAT	3	12313	12324	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	29982917
67	NC_014295	AAAT	3	13056	13067	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29982917
68	NC_014295	ATT	4	13082	13094	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982917
69	NC_014295	ATTC	4	13666	13682	17	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
70	NC_014295	TA	8	13840	13855	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_014295	AATT	5	14369	14387	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
72	NC_014295	ATT	4	14772	14783	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_014295	AATT	3	15117	15128	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014295	ATTTT	3	15236	15250	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_014295	TATTTT	3	15330	15347	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_014295	AATTAT	3	15410	15427	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_014295	TAT	4	15430	15441	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_014295	T	26	15441	15466	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_014295	TAA	4	15518	15529	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_014295	AT	17	15557	15589	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_014295	TA	11	15589	15610	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_014295	AT	8	15612	15628	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_014295	TA	22	15669	15712	44	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_014295	TA	28	15711	15765	55	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_014295	TAA	4	15768	15780	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_014295	TAAAT	3	15833	15847	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014295	AAT	5	15845	15860	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_014295	AATT	3	15867	15878	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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