ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Spilonota lechriaspis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014294	TTA	4	670	680	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
2	NC_014294	ATT	4	835	845	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
3	NC_014294	TAT	5	870	885	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29982914
4	NC_014294	TAT	5	1095	1108	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982914
5	NC_014294	TAT	4	1962	1973	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982914
6	NC_014294	CTT	4	2041	2052	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29982914
7	NC_014294	AGG	4	2130	2141	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	29982914
8	NC_014294	ATT	4	2865	2877	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982914
9	NC_014294	ATT	4	2902	2912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
10	NC_014294	ATT	4	3967	3977	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
11	NC_014294	TTA	4	4870	4880	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
12	NC_014294	ATT	4	5568	5579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014294	TTA	5	6015	6028	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_014294	TTA	4	7229	7240	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982915
15	NC_014294	ATA	4	7334	7345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982915
16	NC_014294	TAA	4	7772	7784	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982915
17	NC_014294	ATA	4	7802	7813	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982915
18	NC_014294	ATT	4	7990	8000	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
19	NC_014294	ATC	4	8454	8465	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29982915
20	NC_014294	TAA	4	9118	9128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982915
21	NC_014294	ATT	4	9470	9481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	29982915
22	NC_014294	TTA	7	9635	9655	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
23	NC_014294	TAA	4	9949	9959	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982915
24	NC_014294	TAA	7	10356	10376	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982915
25	NC_014294	TTA	4	10822	10832	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
26	NC_014294	TAA	6	11038	11055	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	29982915
27	NC_014294	TTA	4	11170	11180	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
28	NC_014294	ATA	4	13129	13141	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_014294	TAT	4	13172	13183	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_014294	TAA	4	14707	14719	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Spilonota lechriaspis mitochondrion