ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Spilonota lechriaspis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014294	TAAA	3	64	75	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014294	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_014294	TTA	4	670	680	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
4	NC_014294	AATT	3	781	791	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982914
5	NC_014294	ATT	4	835	845	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
6	NC_014294	TAT	5	870	885	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29982914
7	NC_014294	TTTTAT	4	1054	1077	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	29982914
8	NC_014294	TAT	5	1095	1108	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982914
9	NC_014294	T	12	1243	1254	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	29982914
10	NC_014294	TAT	4	1962	1973	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982914
11	NC_014294	CTT	4	2041	2052	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29982914
12	NC_014294	AGG	4	2130	2141	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	29982914
13	NC_014294	ATT	4	2865	2877	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982914
14	NC_014294	ATT	4	2902	2912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
15	NC_014294	AATT	3	3734	3744	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982914
16	NC_014294	TATTTT	4	3928	3952	25	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	29982914
17	NC_014294	ATT	4	3967	3977	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982914
18	NC_014294	AAAT	3	4004	4014	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29982914
19	NC_014294	ATTTA	3	4083	4096	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	29982914
20	NC_014294	AATT	3	4399	4409	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982914
21	NC_014294	TATT	3	4598	4609	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982914
22	NC_014294	TTA	4	4870	4880	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
23	NC_014294	TATC	3	4887	4898	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	29982915
24	NC_014294	TATT	3	5368	5379	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982915
25	NC_014294	ATT	4	5568	5579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014294	ATTT	3	5840	5851	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982915
27	NC_014294	TTA	5	6015	6028	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_014294	TAAAAA	3	6267	6283	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_014294	TAAA	7	6354	6381	28	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	29982915
30	NC_014294	TAAA	3	6404	6415	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	29982915
31	NC_014294	TTAA	3	6860	6871	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982915
32	NC_014294	TTA	4	7229	7240	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982915
33	NC_014294	ATA	4	7334	7345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982915
34	NC_014294	TAA	4	7772	7784	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982915
35	NC_014294	ATA	4	7802	7813	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982915
36	NC_014294	ATT	4	7990	8000	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
37	NC_014294	ATC	4	8454	8465	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29982915
38	NC_014294	TAAA	3	8977	8987	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29982915
39	NC_014294	AAAAT	3	9011	9024	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	29982915
40	NC_014294	TAA	4	9118	9128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982915
41	NC_014294	AAAAT	3	9150	9163	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	29982915
42	NC_014294	TA	7	9190	9202	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29982915
43	NC_014294	TATAAA	4	9388	9411	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982915
44	NC_014294	ATT	4	9470	9481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	29982915
45	NC_014294	AT	7	9608	9622	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	29982915
46	NC_014294	TTA	7	9635	9655	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
47	NC_014294	TTTA	3	9937	9948	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982915
48	NC_014294	TAA	4	9949	9959	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982915
49	NC_014294	TTTA	3	10114	10125	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	29982915
50	NC_014294	ATATTT	3	10181	10198	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29982915
51	NC_014294	AATT	3	10241	10253	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29982915
52	NC_014294	TAA	7	10356	10376	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982915
53	NC_014294	TA	6	10628	10638	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982915
54	NC_014294	T	14	10736	10749	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29982915
55	NC_014294	TTA	4	10822	10832	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
56	NC_014294	TAA	6	11038	11055	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	29982915
57	NC_014294	TTA	4	11170	11180	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982915
58	NC_014294	AATTTT	3	11363	11380	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29982915
59	NC_014294	ATTA	3	11450	11460	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982915
60	NC_014294	TA	6	11882	11894	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29982915
61	NC_014294	A	16	12292	12307	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	29982915
62	NC_014294	TA	18	13015	13050	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_014294	ATA	4	13129	13141	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014294	TAT	4	13172	13183	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_014294	TA	18	13448	13481	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_014294	T	12	13521	13532	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_014294	TTAA	3	13630	13640	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_014294	ATTA	4	13698	13713	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_014294	AATT	3	13987	13998	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_014294	TAAA	3	14090	14101	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014294	TTAA	3	14254	14265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014294	TTTCAA	3	14288	14306	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
73	NC_014294	AATA	4	14540	14555	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_014294	TAA	4	14707	14719	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_014294	ATTA	3	14830	14841	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014294	T	24	14949	14972	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_014294	TA	14	15033	15058	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_014294	TA	12	15161	15182	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_014294	TA	9	15288	15304	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Spilonota lechriaspis mitochondrion