ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Durinskia baltica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014287	ACC	4	628	639	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983050
2	NC_014287	TTA	4	812	823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
3	NC_014287	TGA	4	883	894	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983050
4	NC_014287	TAA	4	1891	1902	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	29983050
5	NC_014287	ACC	4	2925	2936	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983050
6	NC_014287	ATG	4	3777	3787	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29983050
7	NC_014287	TGT	4	5433	5443	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29983050
8	NC_014287	AGA	4	9570	9581	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983051
9	NC_014287	TAA	4	12630	12640	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_014287	GCA	4	13067	13078	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29983052
11	NC_014287	AAG	4	13112	13123	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983052
12	NC_014287	TGT	4	13816	13827	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983052
13	NC_014287	CAC	4	13842	13853	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983052
14	NC_014287	TAA	4	13893	13905	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983052
15	NC_014287	AAT	4	15312	15323	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983052
16	NC_014287	TAT	4	15908	15918	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983052
17	NC_014287	TTA	4	15987	15998	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983052
18	NC_014287	ATA	4	16066	16076	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_014287	CTA	4	17646	17657	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_014287	TAA	4	17868	17879	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014287	TAT	4	17885	17896	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_014287	TAT	4	20416	20426	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014287	AGA	4	21772	21783	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983053
24	NC_014287	AAT	5	24599	24612	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_014287	TAT	4	24632	24643	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014287	AGC	4	24898	24909	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29983053
27	NC_014287	TAT	4	28611	28622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983054
28	NC_014287	TTA	4	28758	28769	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983054
29	NC_014287	TAG	4	28940	28951	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983054
30	NC_014287	TGG	4	29374	29384	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	29983054
31	NC_014287	TTG	4	33887	33897	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29983055
32	NC_014287	ATA	4	34026	34038	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983055
33	NC_014287	TCT	4	35055	35066	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983055
34	NC_014287	TAT	4	37112	37122	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983055
35	NC_014287	AAG	4	37925	37936	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983055
36	NC_014287	TAT	4	47607	47619	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29983055
37	NC_014287	TAT	4	50187	50198	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_014287	CAA	4	51589	51600	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983056
39	NC_014287	ATT	4	53615	53626	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983056
40	NC_014287	GGT	4	56433	56444	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	29983056
41	NC_014287	TTA	4	57039	57050	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_014287	CAT	4	57593	57604	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29983057
43	NC_014287	CAA	4	57998	58009	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983057
44	NC_014287	TAT	4	58862	58873	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983057
45	NC_014287	ATA	4	59009	59019	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_014287	AAT	4	61201	61212	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983057
47	NC_014287	TAT	4	62855	62866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_014287	ATA	4	71935	71945	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_014287	ATT	4	76470	76482	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29983058
50	NC_014287	GAT	4	76747	76758	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983058
51	NC_014287	AAT	4	77599	77611	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_014287	ATT	4	78020	78031	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983058
53	NC_014287	ATA	4	80523	80534	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_014287	AAG	4	81263	81274	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983058
55	NC_014287	CTT	4	82193	82204	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983059
56	NC_014287	AAT	4	83604	83614	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983059
57	NC_014287	CAA	4	88101	88112	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983059
58	NC_014287	TTA	4	90211	90222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_014287	GGT	4	91283	91294	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	29983059
60	NC_014287	AGA	4	94256	94267	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983060
61	NC_014287	TAT	4	95776	95786	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983060
62	NC_014287	ATT	4	96755	96766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983061
63	NC_014287	TTG	4	98773	98784	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983061
64	NC_014287	AAT	4	102385	102396	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_014287	ATC	4	102780	102791	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29983062
66	NC_014287	ACA	4	105350	105361	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983062
67	NC_014287	GTT	4	108208	108219	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983062

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Durinskia baltica chloroplast