Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Setaria digitata mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014282TAT453631133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_014282T13130142130 %100 %0 %0 %7 %29982899
3NC_014282TTTTGT3214231180 %83.33 %16.67 %0 %5 %29982899
4NC_014282T18478495180 %100 %0 %0 %5 %29982899
5NC_014282GTT4589600120 %66.67 %33.33 %0 %8 %29982899
6NC_014282GTT4764774110 %66.67 %33.33 %0 %9 %29982899
7NC_014282T13856868130 %100 %0 %0 %7 %29982899
8NC_014282TGTTT5911936260 %80 %20 %0 %7 %29982899
9NC_014282TAGT39379481225 %50 %25 %0 %8 %29982899
10NC_014282TATTT39639771520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
11NC_014282TTTA3119812091225 %75 %0 %0 %0 %29982899
12NC_014282T1312691281130 %100 %0 %0 %7 %29982899
13NC_014282TGTTT313291343150 %80 %20 %0 %0 %29982899
14NC_014282TTTG314041414110 %75 %25 %0 %9 %29982899
15NC_014282TTTA3153815481125 %75 %0 %0 %9 %29982899
16NC_014282T1616811696160 %100 %0 %0 %6 %29982899
17NC_014282GTTT319581968110 %75 %25 %0 %9 %29982899
18NC_014282TTTCT320212034140 %80 %0 %20 %7 %29982899
19NC_014282T1820812098180 %100 %0 %0 %5 %29982899
20NC_014282TTTA3223722491325 %75 %0 %0 %7 %29982899
21NC_014282TTTA4331733321625 %75 %0 %0 %6 %29982899
22NC_014282T1440444057140 %100 %0 %0 %0 %29982899
23NC_014282TAT4410941201233.33 %66.67 %0 %0 %8 %29982899
24NC_014282TTA4424342551333.33 %66.67 %0 %0 %7 %29982899
25NC_014282T3642604295360 %100 %0 %0 %5 %29982899
26NC_014282ATT5435743701433.33 %66.67 %0 %0 %7 %29982899
27NC_014282TGT443904401120 %66.67 %33.33 %0 %8 %29982899
28NC_014282TAT4465946691133.33 %66.67 %0 %0 %9 %29982899
29NC_014282TGTTT348054818140 %80 %20 %0 %7 %29982899
30NC_014282ATTTT5523352572520 %80 %0 %0 %8 %29982899
31NC_014282TGT454385449120 %66.67 %33.33 %0 %8 %29982899
32NC_014282TGTTT355025515140 %80 %20 %0 %7 %29982899
33NC_014282TGTT358425857160 %75 %25 %0 %6 %29982899
34NC_014282TTTG359875997110 %75 %25 %0 %9 %29982899
35NC_014282TGT461966206110 %66.67 %33.33 %0 %9 %29982899
36NC_014282ATA4625062611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %29982899
37NC_014282TGTT364636475130 %75 %25 %0 %7 %29982899
38NC_014282TGT465576567110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
39NC_014282GTT465956605110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
40NC_014282AT29676468195650 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
41NC_014282TA17684968823450 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_014282TGTA8686768973125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
43NC_014282TA7700270141350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
44NC_014282TTTGT373157328140 %80 %20 %0 %7 %29982899
45NC_014282GTTT374677478120 %75 %25 %0 %8 %29982899
46NC_014282TTTGAT3754275601916.67 %66.67 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
47NC_014282TATT3771177211125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
48NC_014282T1277457756120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
49NC_014282AATT3781078211250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
50NC_014282TTA4802680371233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
51NC_014282T1280908101120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_014282TTTGT382598272140 %80 %20 %0 %7 %29982900
53NC_014282TTGG382798290120 %50 %50 %0 %8 %29982900
54NC_014282TTA4844984591133.33 %66.67 %0 %0 %9 %29982900
55NC_014282GTT485018511110 %66.67 %33.33 %0 %9 %29982900
56NC_014282T1487208733140 %100 %0 %0 %0 %29982900
57NC_014282TTTTG387978811150 %80 %20 %0 %6 %29982900
58NC_014282T1889798996180 %100 %0 %0 %5 %29982900
59NC_014282TTTTG490879106200 %80 %20 %0 %10 %29982900
60NC_014282TTTA3919292021125 %75 %0 %0 %9 %29982900
61NC_014282TTTTA3922392361420 %80 %0 %0 %7 %29982900
62NC_014282TTTTG394229435140 %80 %20 %0 %7 %29982900
63NC_014282GTT496799690120 %66.67 %33.33 %0 %8 %29982900
64NC_014282GTTT397429753120 %75 %25 %0 %8 %29982900
65NC_014282TGTT399439953110 %75 %25 %0 %9 %29982900
66NC_014282ATT4996699771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %29982900
67NC_014282TTGT31065610666110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
68NC_014282T171084410860170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
69NC_014282T181091210929180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
70NC_014282T171098811004170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
71NC_014282AATT311218112281150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
72NC_014282T121145311464120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
73NC_014282TTTC31165011660110 %75 %0 %25 %9 %29982900
74NC_014282T151169311707150 %100 %0 %0 %6 %29982900
75NC_014282TTA511837118511533.33 %66.67 %0 %0 %6 %29982900
76NC_014282T241188611909240 %100 %0 %0 %8 %29982900
77NC_014282ATTT312083120951325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_014282TTTTA312193122071520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
79NC_014282ATTTT312240122531420 %80 %0 %0 %7 %29982900
80NC_014282TTAT312269122791125 %75 %0 %0 %9 %29982900
81NC_014282GTT41229512305110 %66.67 %33.33 %0 %9 %29982900
82NC_014282T261246912494260 %100 %0 %0 %7 %29982900
83NC_014282TGT41291812928110 %66.67 %33.33 %0 %9 %29982900
84NC_014282TTTG31311613126110 %75 %25 %0 %9 %29982900
85NC_014282GTTT31351113523130 %75 %25 %0 %7 %29982900
86NC_014282T181375213769180 %100 %0 %0 %5 %29982900